如何快速启动siRNA文库筛选
转自:优宁维抗体专家
但我们实验室没有高通量仪器,也能做siRNA文库筛选吗?
当然,小几十个基因的筛选排枪就能搞定
但我之前没操作过,有点方
不方,基本操作和单基因一致,只不过通常是用96孔细胞板进行
那我可以试试看
对了,你讲座中说的基因家族分类亚库和我想要的不太匹配呢
你说的是这些亚库嘛?
问题不大,图中所有文库的基因列表我都有,你可以挑选喜欢的基因定制,毕竟只要有5个基因就能定制文库了,价格很划算
能定制还蛮不错的,那我来看看能不能凑些基因出来给你
但是定制的规格、产品形式又是什么样的?
定制会更灵活:规格上有0.1nmol、0.25nmol、0.5nmol、1nmol和2nmol5种可选,siRNA你可以选择4条分装的,也可以选择SMARTpool形式的
等等等,什么叫SMARTpool?
哈哈,讲座没认真听吧。每个基因会提供4条不同的siRNA,SMARTpool就是把4条siRNA预混后共同放在1个孔里
那我要怎么选啊?
做多个基因筛选的话,我更建议选SMARTpool,这样你的转染工作量就减少了3/4,而且SMARTpool沉默效果更好,毕竟4条不同的siRNA共同发挥作用
那沉默效率怎样?
所有的siRNA出厂前都有做过验证,而且是有沉默效率保障的,保证每个基因对应的4条siRNA中至少有3条在mRNA水平上有≥75%的沉默效率
OKK,那这个规格我咋选呢?
如果只是利用文库做一下基因的初筛,那0.1nmol绝对够用了。常规筛选剂量下,0.1nmol可以支持10次左右的筛选
这样啊,那0.1nmol确实够用了,筛到以后,我再单独购买大规格的siRNA就是了
对的,就是这个意思
行,那我了解了,你把泛素化集合相关的基因列表发我,我看看选一些,再把我手头上有的基因列一列,到时发你
好哒,这是基因列表,请查收