西南大学团队研发！“数字家蚕”共享分析平台上线
2023-11-22 18:42:04 - 华龙网
华龙网讯（记者秦思思）日前，西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验代方银教授团队上线了“数字家蚕”共享分析平台（SilkMeta），该平台整合了家蚕泛基因组及多组学数据，将具有上千个种质资源的线下实体基因资源库，转化为组学序列线上数据库，实现“数据共享”。
该研究成果在线发表在生物学领域国际著名期刊《核酸研究》上，题为《SilkMeta：一个家蚕泛基因组和多组学数据共享分析平台》。这也是继2022年该团队发布家蚕超级泛基因组图谱后，推动创建“数字家蚕”取得的又一重大进展。
据悉，在现代蚕学研究和育种实践中，家蚕泛基因组及多组学数据已经成为科学家手里不可或缺的基础资源，合理使用可以大大缩短研究和育种的时间，显著提高工作效率。但这些数据的分析利用，对一般用户来讲，具有较高的技术壁垒，成本也很高。
目前，平台已涵盖丰富的数据内容，包括294种家蚕质量性状基因型特征、546个基因组等，是迄今涵盖数据类型最全、数据量最大的家蚕组学数据库。
相关负责人介绍，此次平台的上线，则代表着西南大学家蚕基因研究已从“技术领跑”转变为“数据共享”，全球科学家都能在该平台获得基因数据，实现种质资源基因组、遗传变异及表型的开放共享和可视化、便利化分析。