干货 | 预约另一台qPCR仪器数据变异常?速查你的ROX选对了吗?

2023-05-23 17:06:08 - 市场资讯

转自:诺唯赞生物

干货 | 预约另一台qPCR仪器数据变异常?速查你的ROX选对了吗?

昨天做的qPCR实验数据还是正常的,今天预约了另一台仪器,得到的扩增曲线怎么是“十字型”?

干货 | 预约另一台qPCR仪器数据变异常?速查你的ROX选对了吗?

在仪器设置中将参比染料由ROX更改为NONE,取消ROX的校正功能,若扩增曲线恢复正常,则判定是BadRox的问题;

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BadRox是什么?有什么办法可以避免这种问题的出现吗?

当然啦,让我们一起来了解一下如何避免qPCR下机数据中出现BadRox的问题~

为什么更换仪器后会出现BadRox报错?

BadRox报错是因为更换qPCR仪器后,试剂中添加的ROX浓度与仪器不匹配导致的。

什么是ROX?

ROX是一种惰性参比荧光染料,能被qPCR仪检测到,但其荧光信号值在qPCR反应中基本保持不变,不会随着qPCR扩增而增强,不会对qPCR反应产生影响(如图1)。

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为什么qPCR试剂中要添加ROX?

ROX具有校正数据误差的作用,提高数据精确性。主要用于纠正由于qPCR反应本身的物理因素而导致的荧光信号变化,帮助排除可疑数据。

如何避免出现BadRox报错?

不同qPCR仪器由于激发光学系统不同,其需要的ROX染料浓度也不同。目前市面上的qPCR仪器分为不需要ROX校正、需要高浓度ROX校正以及需要低浓度ROX校正的三种仪器,当我们在选择qPCR预混试剂时,要注意选择含有适配于当前机型ROX的qPCR试剂才能避免BadRox报错情况发生。常见的qPCR仪器与所需的ROX浓度参考如下表:

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除了难以判断qPCR仪器及其适配的ROX浓度之外,更头疼的是预约到平台的不同的共享仪器时,还要更换含有不同浓度的ROX试剂,如果有一款定量产品通用于所有的qPCR仪器就好了!

Vazyme热卖qPCR试剂(ROX通用款):TaqProUniversalSYBRqPCRMasterMix(Vazyme#Q712),其中含有特殊的ROXReferenceDye,适用于各种主流PCR仪器,无需在不同qPCR仪器上调整ROX的浓度。

此外,本产品采用的TaqProDNAPolymerase是经过升级改造的、基于抗体法修饰的新一代热启动聚合酶,配以针对qPCR优化的合适Buffer以及特异性促进因子,有效避免引物二聚体和非特异性扩增的产生,同时扩增效率更加稳定,更适合于低表达体系的检测,且扩增荧光强度大幅度提高,轻松获得优美曲线。

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