中国科大揭示Lon蛋白酶在单个蛋白水解位点对底物进行持续切割
晶体结构表明,AAA+和蛋白酶结构域形成一个封闭的腔室,六个ATP酶位点朝外,六个蛋白水解活性位点朝内。已有研究表明了与共价抑制剂结合的蛋白水解活性位点的结构,然而,与蛋白酶活性位点结合的底物结构尚未确定。迄今为止,人们致力于了解蛋白质底物如何被AAA+蛋白酶的AAA+环识别、去折叠和移位,张凯铭/张崇毅团队在2021...
蛋白酶特异性底物裂解位点预测方面取得新进展
近日,西北农林科技大学信息工程学院李富义教授团队在蛋白酶特异性底物裂解位点预测方面取得重要研究进展,研究论文“ProsperousPlus:aone-stopandcomprehensiveplatformforaccurateprotease-specificsubstratecleavagepredictionandmachine-learningmodelconstruction”在线发表于《BriefingsinBioinformatics》。
...教授等:食源性蛋白酪氨酸磷酸酶1B抑制剂的功能意义和结构-活性...
由于所有的PTPs的活性位点(即pTyr结合位点)都具有高度的结构保守性,阻碍了开发高亲和力和选择性PTP1B抑制剂的进程。然而,通过对PTPs底物特异性的研究发现,单独的pTyr部分不足以进行高亲和力结合,而pTyr两侧的残基对PTP1B底物识别具有重要作用,且其他的PTPs不具有与之相同的活性中心外围的作用位点。因此,PTP1B活性...
高活性钯基纳米酶,在生物分子传感中,可以监测生物体内代谢物?
底物选择性:高活性钯基纳米酶的催化机制具有显著的底物选择性,它们的表面位点与特定底物之间的相互作用是高度特异性的,这意味着它们能够选择性地催化目标分子,而不受其他分子的干扰,这种底物选择性使高活性钯基纳米酶在监测复杂生物样本中的代谢物变化时非常有优势。2.抗干扰性高活性钯基纳米酶在生物分子传感中的...
西北农林科技大学罗安伟副教授等:没食子酸对α-淀粉酶和α-葡萄...
在分子对接中,没食子酸定位在α-淀粉酶、α-葡萄糖苷酶活性位点附近。如图7B和图8B所示,没食子酸与α-葡萄糖苷酶结合时,主要被Lys156、Asn235、Ser236、Thr237、Phe314、Asn317、Ile419、Glu422、His423、Glu429、Lys432、Phe433等氨基酸残基所包围,且与氨基酸残基Lys156、Asn317、Glu422、His423、Glu429之间...
干货| 酶切实验切开 or 切不开,真的是玄学吗?
??模板制备过程中使用到乙醇、氯仿、苯酚、SDS、EDTA等,残留在DNA模板中,会不同程度影响酶的活性,可将DNA过柱纯化(www.e993.com)2024年8月31日。??PCR中参与扩增反应的DNA聚合酶具有外切酶活性,可能会影响酶切产物末端完整性,进而影响克隆效率,建议使用PCR纯化后的产物。2.内切酶识别的DNA位点上的碱基被甲基化或存在其它修饰...
【科技前沿】丁建平组发现乳酸脱氢酶D是一个广谱性的D-2-羟基酸...
实验结果表明,LDHD对D-乳酸表现出脱氢酶活性,但对L-乳酸没有活性。此外,LDHD对多种C2原子上带有疏水基团的D-2-羟基酸具有酶活,但对C2原子上带有亲水基团的D-2-羟基酸无酶活。结构分析显示,LDHD的底物结合口袋由一个带正电的subsiteA和一个疏水的subsiteB组成,subsiteA结合Mn2+和底物的乙醇酸基团或产物...
蒙牛高科乳制品(北京)有限责任公司钱文涛高级工程师等:牛乳纤溶酶
不同品种泌乳动物之间乳中纤溶酶活性存在差异。牛乳中的纤溶酶及其酶原的活力会也受到乳牛品种的影响,不同乳牛品种间纤溶酶含量的差异可能与乳中酪蛋白相关,通过调整合成底物和酪蛋白比例以消除酪蛋白干扰后,品种间的纤溶酶活性差异得以抵消。泌乳阶段和胎次...
中国药科大:丹参生物活性化合物的心脏保护机制
Pdha1是一种位于线粒体中的丙酮酸脱氢酶,其三个磷酸化位点(S232、S293和S300)在IS心脏中严重缺失,但在IR处理后显示出适度恢复(图2D)。最近的研究报道,AMPK介导的Pdha1活性增强和随后的葡萄糖氧化可以减少心肌梗死面积,我们发现AMPK在IR心脏中相应富集(图2C)。AMPK被确定为心肌缺血期间的代谢调节剂,在细胞内适应...
施剑林/董海青/Bin Li JACS:双位点仿生Cu/Zn-MOF催化治疗特应性...
要点2.Cu/Zn-MOF表现出突出的四酶活性,包括SOD、GPx、巯基过氧化物酶(TPx)和抗坏血酸过氧化物酶(APx),它们有效地拓宽了反应底物的范围,以分解超氧阴离子(O2·-)歧化产生的过氧化氢(H2O2)并减轻炎症。要点3.Cu/Zn-MOF在减少抓挠损伤、恢复皮肤经表皮水分损失(TEWL)和抑制AD改善中的皮肤...