中国科大解析Lon蛋白酶的完整三维结构并揭示其底物识别与转移的...
LonAAA+蛋白酶(LonA)是一种在原核生物和真核生物细胞器中保守的ATP依赖性蛋白酶。LonA组装为同源六聚体,每个单体都包含一个N端结构域、一个中间ATP酶结构域和一个C端蛋白酶结构域。LonA通过降解受损或错误折叠的异常蛋白质在细胞蛋白质稳态中发挥重要作用,从而防止这些不需要的蛋白质种类形成有毒聚集体。LonA还...
生命相变必然涌现,而演化则不可预期
在这所有6700种原核生物中存在着小分子集体自催化集的证据强烈表明,宇宙中第一个能够自我复制的化学系统可能正是这样的反应集合。我们在下面将证明,此类集合的出现是可预期的。图3.由文献(11)导出。原核生物中存在不含DNA、RNA或肽聚合物的小分子集体自催化集。在所有6700种原核生物中都发现了类似...
Nat Eco Evo | 吴法柏/Bernheim团队揭示从古菌到真核的免疫蛋白进化
作者发现人类Viperin蛋白在真核生物中有着广泛的同源蛋白分布,并且可溯源于古菌。结合系统发育学、结构预测和生化生理实验,作者阐释了Viperin通过对少数氨基酸位点的改变来修改对核苷酸底物的特异性,揭示了Viperin在20多亿年的进化过程中维持原有基本结构框架并不断创新的基本原理。人类Viperin参与先天免疫Viperin(干扰素诱...
研究阐释猴痘病毒DNA聚合酶F8-A22-E4-H5四元复合物的工作机制
原核生物和真核生物经典的DNA聚合酶中的复制持续性因子PCNA结合在聚合酶活性中心下游的dsDNA区域(图4A),环绕dsDNA防止DNA底物的脱落。在猴痘病毒聚合酶四元复合物结构中,已知的复制持续因子A22-E4结合在活性中心上游的模板ssDNA区域(图2C),在分子机制上与PCNA完全不同。该工作的结构分析认为,A22-E4可能一方面通过E...
【云飞杂记】真菌传之测序
他认为生命由细菌域、古菌域和真核生物域构成,并构建了生命进化总树。之后,该学说经过其他学者以其它序列保守的基因用于进化研究的验证,遂大行其道。选用16/18SrRNA作为生物进化和系统分类研究有以下几个优点:第一,普遍存在于一切细胞内,不论是原核生物还是真核生物,可比较在进化中的相互关系;第二,生理功能既...
CELL文献速递:了解微生物如何在社会中传播并塑造健康
我们知道社会互动会推动病原体的传播,比如说,狩猎和食用森林猎物会增加感染人畜共患病毒的风险,从而将病原体引入人类社交;但与宿主相关的互惠共生体和共生微生物通过社会传播对宿主健康和疾病的贡献还很少研究(www.e993.com)2024年8月31日。刚刚,来自世界顶级学术殿堂——哈佛大学的人类进化生物学系AmarSarkar研究团队发表在《Cell》上的综述成果...
用人工智能筛选氨基酸残基对底物的特异性,使酶工程变得简单
ME是一种酶,可将三羧酸循环中的中间体苹果酸脱羧为丙酮酸,这是糖酵解的最终产物,伴随着NAD或NADP。大多数生物,从原核生物到真核生物,都含有ME;因此,大量的序列数据可用于NAD和NADP依赖的ME。通过获得来自不同物种的ME氨基酸序列,研究人员可获得负责辅因子特异性的残基。转换辅因子特异性的...
古菌可能是真核生物的祖先?那我们到底起源于什么?
原因是,阿斯加德古菌不仅具有原核生物的生物学特征,如古菌没有细胞核,因此属于原核生物;但是有意思的是,阿斯加德古菌还具有许多从原核到真核过渡的生物学特征,例如:阿斯加德古菌富含很多只有在真核生物中才会出现的蛋白编码基因。另外,古菌在基因组复制、转录和翻译等遗传信息传递过程也与真核生物类似,这些证据逐渐使...
【原核生物全系列-60】拟杆菌门—拟杆菌纲
拟杆菌属,又称为类杆菌属(学名:Bacteroides),是细菌中的一个属,是人类大肠中的非病原性优势菌种。拟杆菌属被归类在革兰氏阴性菌和专性厌氧菌中。不同于其他细菌的是,拟杆菌属的细胞膜上带有鞘磷脂。这一细菌种类中以松脆类杆菌较为有名。拟杆菌属是指革兰氏染色阴性、无芽孢、专性厌氧的小杆菌。正常寄居于...
Cell | 人源BAF在核小体底物上的作用和运动机制
Cell|人源BAF在核小体底物上的作用和运动机制撰文|小白薯责编|兮真核生物区别于原核生物的重要特征是具有高级结构的染色质,其作为真核生物遗传物质的载体,对于遗传物质的复制、转录,保护DNA免受损伤等过程中扮演着重要角色。ATP依赖的染色质重塑复合物包含大量的组分,通过选择核小体位置和组分控制着细胞...