祖先序列重构拓展三萜2"-O-糖基化酶底物谱| 清华大学李春联合北...
尽管RTASLoop被鉴定为影响酶底物特异性的关键区域,但其作用机制有待进一步实验证实。比如,可通过定点突变和酶活检测,分析RTASLoop中关键氨基酸残基的作用;或解析野生型酶和突变体的蛋白结构,阐明底物结合模式的差异。虽然ASR和系统发育分析被证实可有效指导UDP-糖基转移酶的功能优化和新酶挖掘,但这一策略能否推广至...
中国农业科学院毕金峰研究员等:桃酶促褐变机理与调控技术研究进展
活性区域中有2个铜离子活性位点CuA区域和CuB区域,其中CuA区域含3个保守组氨酸残基和1个半胱氨酸残基,CuB区域含3个或4个保守组氨酸残基。根据其催化反应类型的不同,可以将PPO分为单酚氧化酶、双酚氧化酶与漆酶。桃果实中的PPO会随着桃的品种、成熟度的不同而表现出不同的结构特性和催化活性。在酶促褐变中,PPO...
中国科大解析Lon蛋白酶的完整三维结构并揭示其底物识别与转移的...
AAA+蛋白酶与底物结合的核苷酸结合状态比较顶部视图显示了核苷酸和底物的结合状态。与底物结合的原体呈不同深浅的绿色。然而到目前为止,Lon六聚体的现有报道的所有结构中没有包含N端区域,Lon如何选择蛋白质靶标作为底物、控制底物进入AAA+结构域、并介导底物去折叠的机制尚不清楚。10月15日,合作团队在期刊Sciences...
各种HIV药物的“前世今生”
核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)与天然核苷底物竞争并充当原病毒DNA合成的终止子,非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)与靠近逆转录活性位点的疏水口袋结合,还执行反逆转录翻译功能(如图3所示)(Magaetal.,2010)。1987年,第一个核苷类逆转录酶抑制剂齐多夫定(AZT)获得批准。然后是去羟肌苷、司他夫定(d4T)、...
合生万物,重塑未来——第一财经《未来产业系列白皮书丨合成生物篇...
在合成生物学的推动下,原本原料药、中间体的制造工艺将逐步由动植物提取、化学合成或微生物发酵向酶法工艺、细胞工程过度。一些原有合成方式下成本较高、制备难度较大,但拥有较大市场需求的原料药品种,有望通过合成生物技术实现在生产效率、节能减排等方面的较大提升,从而帮助企业形成更强的成本优势,这成为目前原料药...
作为丝氨酸蛋白酶中的一个家族,颗粒酶具有哪些特性?
大鼠颗粒酶B的晶体结构最近被测定,它的晶体结构几乎没有什么惊喜(www.e993.com)2024年9月1日。结果表明,颗粒酶B的底物裂隙容量相当大,可容纳多达8个底物残基。与P1底物残基接触的关键残基(即切割键的氨基末端,通常是天冬氨酸)是Arg226。颗粒酶是作为酶原合成的,在包装时被加工成溶细胞颗粒。前导肽的裂解留下两个氨基酸附着在成熟的氨基末端...
Plant Physiol | 广西大学明振华课题组揭示水杨酸生物合成关键酶...
图2ICS1识别底物的关键氨基酸残基研究者同时发现,酶分子的催化中心与溶剂之间有一个长通道,底物穿过通道到达活性位点需要克服较高的能量屏障。分子对接和突变体实验结果表明长通道中存在一个可以结合底物的关键位点,底物与该位点的瞬时结合可以降低其穿过长通道的能量消耗,最终提升进入催化活性位点的效率。基于这些发现...
Nature一周论文导读|2024年8月15日
(导读阿金)生物膜可根据不同功能区域划分出膜微结构域,包含特异的脂质与蛋白质。本研究分离出近天然的胞质体,作为螺旋微管,由Pil1/Lsp1与质膜脂质结合形成的晶格构成,结构解析展示了膜脂质的结构,确认了被Pil1/Lsp1外壳隔离的单个PI(4,5)P2,磷脂酰丝氨酸和固醇分子的位置所在。结果阐明了Pil1/Lsp1...
...大学朱艳冰教授等:N端非催化结构域对微泡菌ALW1褐藻胶裂解酶...
褐藻胶裂解酶AlgL7包含QIH保守结构域,是一个对polyM和polyG都起作用的双功能褐藻胶裂解酶。PL7家族的褐藻胶裂解酶包含3个高度保守的区域(R/E)(S/T/N)EL、Q(I/V)H和YFKAG(V/I)YNQ,这些保守区域形成了β-三明治形状的空腔结合底物。本研究中,褐藻胶裂解酶AlgL7包含QIH保守结构域,是一个对polyM和...
从菌株之间的相互作用,解析控制着微生物群落的生态进化动态
区分这些菌株的SNP分散在整个核心基因组中,其中62%位于具有已知功能注释的基因编码区域。从广义上讲,这些基因对应于转录调节因子(如gbdR)、跨膜蛋白(如硝酸盐转运蛋白nitT)和与中心碳代谢有关的酶(如aceE、murA和ppsA)。gbdR蛋白是氨基酸代谢,甘氨酸甜菜碱分解代谢以及细菌中磷酸酶活性的已知转录调节因子,并且...