中国科大揭示CRL2 APPBP2 E3泛素连接酶调控蛋白质降解的分子机制

在大多数情况下,它可以直接识别底物蛋白质中的特定基序,这种基序被称为降解子(degron)。蛋白质暴露的羧基末端降解信号(C-degron),可以被Cullin-RINGE3泛素连接酶(CRLs)复合体中不同的底物受体所识别,包括KLHDC2,FEM1A/1C,FEM1B以及APPBP2等。之前的工作中,许超教授课题组通过解析FEM1B、FEM1C与Arg/C-de...

高性价比2区: 贵中医大基于蛋白质组学和生物信息学探究土茯苓治疗...

蛋白质链以图形表示,配体以棒的形式显示,口袋以球体的形式显示。蛋白质由深绿色和棕色条带表示,配体由棒表示。选择配体(A/Q6ZE606)模式,通过SYBYL脱水、添加全氢和电子来形成口袋。在这种分子对接计算中,通常是有机小分子的结合位置。对于蛋白质-小分子复合物的X射线晶体结构,口袋中有一个配体,绿色区域是对接口袋...

《食品科学》:宁夏大学李亚蕾教授等:基于蛋白质组学分析蛋白酶体...

ATP酶活性的调节、蛋白质折叠、骨骼肌收缩、糖酵解过程、肌肉收缩等BP;MF主要包括内肽酶活性、肌动蛋白结合、苏氨酸型内肽酶活性、肌动蛋白丝结合、微丝运动活性、ATP结合等;CC主要包括蛋白酶体核心复合物、Z盘、肌球蛋白复合体、应力纤维、细胞核、细胞质、肌动蛋白细丝、蛋白酶体核心复合物、α-亚单位...

Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...

大多数NMPFs(64,186个,占60.44%)由来自宏基因组和宏转录本组的蛋白质混合组成,进一步证实了它们的存在,而38,292个NMPFs(占36.06%)只包含在宏基因组中发现的蛋白质,3,720个NMPFs(占3.50%)只包含在宏转录本组中发现的蛋白质(补充表5)。含有来自宏基因组和宏转录本组的成员的科的百分比随着...

比最优技术快 8 倍:浙大侯廷军等人提出 ResGen,基于蛋白质口袋的...

*GraphBP:采用3D图神经网络来提取语义信息,然后通过自回归流模型依次生成原子。通过将特定类型和位置的原子逐个放置到给定的结合位点来生成与给定蛋白质结合的3D分子。*Pocket2Mol:用于建模三维蛋白质口袋的化学和几何特征,并采用一种新的高效算法来采样基于口袋条件的新的3D候选药物。

TPD2024 靶向蛋白降解药物开发论坛早鸟票倒计时2天

·蛋白质敲除技术开发于19世纪90年代末期,先于PROTAC10个月发表,是TPD领域的开创性技术平台(www.e993.com)2024年11月10日。·PKO利用SCF(Skp1、CUL1和含F-box的底物受体)泛素化机制,指导原本稳定的细胞蛋白质的降解,而无需使用双功能的PROTAC分子或分子胶。·人工设计的βTrCP-BP泛素连接酶在培养的哺乳动物细胞和小鼠模...

2区-贵州中医药: 基于蛋白质组学和生信探究土茯苓治疗高血压的...

本研究应用蛋白质组学和生物信息学研究了SGR治疗高血压患者的差异蛋白表达及其与免疫浸润的关系。采用N-硝基L-精氨酸甲酯(L-NAME)构建高血压模型,灌胃给予SGR4周,每7天用尾袖法测定各组大鼠的收缩压和舒张压。此外,使用酶联免疫吸附测定法(ELISA)测定各组血清总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(...

北京中医药大学胡继强团队:发现心力衰竭与血脂、血压和血糖的共同...

HF与BLs、BP和BG数量性状之间的遗传相关性和遗传因果关系比例研究结论03这项多性状关联研究,为HF的风险位点,以及HF与BLs、BP和BG的共同遗传病因,提供了重要见解。此外,它还强调了HF治疗的现有药物和潜在的新型蛋白质靶点。这些发现将为HF的发病机制,提供生物学见解,并有利于HF预防或治疗药物的开发。

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

大多数发表的RNA-seq数据都是基于oligo-dT方法富集包含poly(A)尾巴的转录本,定位于分析转录组上的蛋白质编码区(生信宝典注:部分lncRNA也有poly(A)尾巴)。但是这种方法除了会导致3??端偏好外,很多不含Poly-A尾巴的非编码RNA,例如miRNA和增强子RNA不会被测到。完全不进行选择而使用全部提取的RNA也不合适,因为这...

Nature 子刊 | 骨肉瘤潜在治疗靶点:RNA结合蛋白

进一步的GO分析显示,细胞质翻译相关蛋白,包括核糖体蛋白、翻译起始和翻译终止因子在更具侵袭性的OS中升高更明显(图4b),表明OS细胞中的整体翻译更活跃。另外,与OB相比,线粒体翻译相关蛋白(已知其在维持干细胞干性中发挥重要作用)在MSCs的互作组和全蛋白组中表达更为丰富(图4a)。此外,还有几种具有不同RNA结合活性的...