Nature︱细胞内的“搬运工”:揭秘蛋白质定位调控的新策略

为了研究缺乏已知小分子结合位点的蛋白质,研究人员合成了双功能分子TRAM1,其能够与大肠杆菌二氢叶酸还原酶结构域(EcDHFR)和FKBP12F36V结构域结合,这些结构域因其与大多数哺乳动物蛋白的紧密的结合亲和力和正交性而被广泛使用。然后生成了mCherry融合EcDHFR和来自HIV-1REV蛋白的NES作为穿梭蛋白,并在HeLa细胞中稳...

又登Science!神经退行疾病三大核心蛋白研究与应用解析

今年8月,剑桥大学团队在Science发表最新研究,基于E3泛素连接酶TRIM21的聚集体依赖性激活,形成TRIM21的RING结构域与Tau靶向特异性纳米抗体融合的降解剂,可有效减少tau蛋白在体内聚集。该研究为神经退行疾病的靶向疗法开发和临床应用提供重要依据[1]。除了Tau蛋白外,Aβ和α-Syn蛋白聚集体,被...

Nat Biomed Eng | 谢琦/曹龙兴团队联合开发基于从头蛋白质设计...

研究团队开发了一套使用Binder代替传统scFv作为抗原结合结构域的新型CAR构建策略,用于有效识别肿瘤表面抗原,并提高CART疗法对于胶质母细胞瘤的治疗效果。该策略从已知癌症靶标的蛋白结构入手,选择合适的靶蛋白表面,并利用游离氨基酸匹配和空间匹配算法获得与该表面契合的Binder空间位置,使用Rosetta平台,通过能量打分函数对Bin...

Nature子刊:魏文胜团队实现蛋白质组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点...

图2:筛选鉴定出大量功能性磷酸化位点此外,研究团队还分析了突变在蛋白质结构中的分布,发现丝氨酸到脯氨酸的替换广泛影响不同类型的蛋白质结构域功能,尤其是WD重复结构域中的两个高度保守的丝氨酸,暗示这些位点在维持蛋白质结构方面具有关键作用。最后,研究发现,筛选出的促进细胞生长的突变与临床癌症患者的基因数据存在...

...篇顶刊,阿尔茨海默病治疗新突破!剑桥团队新策略精确清除毒性蛋白

▲Trim21与靶向tau的纳米抗体相结合的策略示意图(图片来源:参考资料[1])在发表于《科学》的论文中,研究人员展示的方法是用靶向tau蛋白的纳米抗体(一种微型抗体)与Trim21的RING结构域融合,这样一来当相邻的tau蛋白形成病理性聚集体时,上面的RING也会被激活,从而给tau蛋白聚集体打上降解标签,但健康的tau蛋白几乎不...

Nature:严欢/石正丽团队首次提出人工设计病毒受体

图2:冠状病毒定制化人工病毒受体示意图值得一提的是,研究团队发现一种结合新冠病毒NTD特定表位的人工受体(S2L20-CVR),意外地可以通过结合经典的CTD受体结合域(RBD)之外的区域发挥功能,通过与DavidVeesler团队合作,揭示了这一特殊的功能性受体通过一种类似于“分子棘轮”的机制强制三个CTD结构域处于“开放”构像,进...

Nat Commun:阻断Aβ42纤维聚集热点的新蛋白结构域

蛋白质错误折叠会产生有毒的中间产物,阿尔茨海默病(AD)中Aβ淀粉样蛋白肽纤维的表面被认为是自我复制和产生潜在毒性物质的催化剂。分子伴侣BRICHOS蛋白结构域可与淀粉样蛋白纤维结合并打破这种自催化循环。近期,NatureCommunications期刊在线发表了题为“IdentificationofpotentialaggregationhotspotsonAβ42fibrils...

国内首家!独特结构的弹性蛋白出现了!

典型如先进再生医学开发的独家二级结构折叠技术,该公司研发团队借助于领先的AlphaFold3技术,对弹性蛋白的结构进行了广泛的解析预测与深入研究,同时引入PyMOL进行分子模拟和结构可视化,并通过实施定点突变技术等,最终成功设计制备出具有仿生天然弹性蛋白弹性关键结构域的三维交错构型嵌合的β-螺旋“类弹簧”结构。

基础医学院钱鹏旭团队《Nature Cell Biology》揭示核仁蛋白FBL在...

本研究首先利用FBL结构域点突变、缺失、替代与嵌合等进行功能筛选,发现FBL的特定相分离属性是其促进AML发展的基础。FBL通过其相分离的互斥型RBD和IDR结构维持AML的扩增和LSPC的自我更新能力,而不是单纯的甲基转移酶或乙酰化结构域。进一步通过超分辨显微技术和胞内外相分离凝聚体重构实验,研究揭示了FBL蛋白中GAR和MD...

SHP2成药之旅:破局、热潮、遇冷与希望

SHP2的抑制和活性构象及3个结构域示意图破局:诺华开启SHP2研发新篇章2016年,诺华在Nature上报道了一款SHP2变构抑制剂SHP099,它能结合到SHP2蛋白的3个结构域之间,使SHP2稳定在抑制状态,从而抑制SHP2的活性。这一变构抑制剂的突破性发现开启了SHP2药物研发的新篇章。