质谱可以检测蛋白质序列吗
通过对质谱图的解析,可以得到肽段的质量信息,再通过数据库搜索,可以得到肽段的氨基酸序列。通过这种方式,质谱技术不仅可以用于蛋白质序列的鉴定,还可以用于蛋白质的定量分析,如蛋白质的表达水平分析、蛋白质的翻译后修饰分析等。质谱技术是蛋白质研究的重要工具,其在蛋白质序列检测中的应用为生物医学研究提供了强大的...
质谱法测定肽段氨基酸序列的分析流程是什么?
数据解析的主要步骤包括质谱图的处理、氨基酸序列的匹配和肽段鉴定。首先,通过质谱图的处理和峰识别,确定各离子峰的质量和相对丰度。然后,将实验得到的质谱数据与已知的氨基酸序列数据库进行比对,以寻找与样品中的肽段相匹配的序列。最后,通过对匹配结果的统计分析和验证,确定肽段的氨基酸序列和可能的修饰。4.质谱法...
Nature子刊:黄硕团队首次通过纳米孔实现20种蛋白质氨基酸和翻译后...
蛋白质是生命活动的执行者,由20种天然存在的蛋白质氨基酸构成。与高歌猛进的DNA测序技术相比,高灵敏、高通量的蛋白质测序技术的发展严重滞后,目前仅Edman降解法和质谱法能做到蛋白质测序。然而,Edman降解法的序列分析长度有限,质谱法的检测限和动态范围阻碍了低丰度蛋白质的分析鉴定和新型生物标志物的发现。单分子蛋白...
Nature子刊:吴海臣/刘蕾团队首次实现基于纳米孔的短肽序列测定
基于纳米孔技术的多肽测序新方法实现蛋白质测序最关键的步骤是获得氨基酸的序列信息。研究团队利用羧肽酶A和羧肽酶B将肽段中的氨基酸逐一水解,并将游离的氨基酸通过偶联反应连接到多肽探针上,最后通过纳米孔单通道的电流信号确定每个氨基酸的种类,利用其信号丰度确定序列位置,从而成功实现了基于纳米孔技术的多肽序列测定。
精度达90%的从头肽测序,一种深度学习驱动的串联质谱分析方法
德国慕尼黑工业大学(TechnischeUniversit??tMünchen,TUM)的研究人员推出了Spectralis,一种用于串联质谱分析的从头肽测序方法。Spectralis利用了多项创新,包括连接按氨基酸质量间隔的光谱峰的卷积神经网络层、提出碎片离子系列分类作为从头肽测序的关键任务,以及肽谱置信度评分。
模拟“提绳打水”,破解多肽纳米孔测序瓶颈
通俗地说,质谱法是用生物酶将蛋白质分解成很多多肽片段,再通过质谱仪器检测,确定蛋白质片段的信息,最终将这些片段重构成蛋白质序列(www.e993.com)2024年7月29日。而埃德曼降解法是用化学方法将蛋白质N端的一个氨基酸切下来进行鉴定,然后再进行第二轮的氨基酸切割和鉴定,多次循环操作后,确定氨基酸的序列。
中国科学技术大学刘世勇教授Angew:精确序列定义的聚合物——从...
串联质谱是SDPs中最常用的测序方法。其基本原理是将目标聚合物电离,然后在中性气体中加速,导致链主干和一些碎片解离。通过质量检测器检测这些片段以产生MS/MS光谱。因此,聚合物序列信息可以从质谱峰间推导出来。值得注意的是,侧链裂解可能伴随着主干分离产生嘈杂的质谱信号,从而干扰测序和解码。骨架的单次解离将产生两个...
《食品科学》:厦门医学院吴靖娜副教授等:红毛藻血管紧张素转化酶...
根据串联质谱数据进行的从头测序是蛋白质组学中进行蛋白质特性分析的关键技术,从头测序的任务是基于给定质谱谱图和肽段质量分布的情况下,通过算法从谱图离子峰推断出肽的氨基酸序列,并对序列结果的准确性进行打分评估。作为denovo结果的置信度,当ALC>80%表示结果较为可信。本研究通过denovo测序,获得ALC>80%的红毛...
药典蛋白质组学分析标准二次公示!增加QC评价标准
1.将“通过质谱分析技术检测到肽指纹图谱进行多肽的鉴定和定量分析”修改为“通过质谱分析技术检测肽段一级与二级谱图进行多肽的鉴定和定量分析”。2.将文中“图谱”修改为“谱图”。三、蛋白质组学分析方法1.“2.1质谱技术”增加其他质谱碎裂技术,修订为:“蛋白质组样品经过提取、分离富集或者进一步...
河南工业大学布冠好教授等:大豆主要致敏蛋白及其检测技术研究进展
根据识别物质的不同,目前食品过敏原的检测技术可分为基于蛋白水平和基于核酸水平的检测技术。基于蛋白质水平的检测技术包括酶联免疫吸附测定(ELISA)、免疫印迹法(Westernblotting)、免疫层析法、质谱法及生物传感器法;基于核酸水平的检测技术有实时定量聚合酶链式反应(qPCR)、环介导等温扩增(LAMP)技术。