疫苗前沿 | mRNA疫苗的序列设计

1.3编码序列(CDS)该mRNA疫苗的CDS区域由多个抗原编码序列串联组成,包括小鼠共享肿瘤相关抗原、肿瘤新抗原和源自卵清蛋白(OVA)抗原表位,抗原序列之间用10聚甘氨酸-丝氨酸(GS)接头连接。在克隆到mRNA编码质粒之前,研究人员使用GENEWIZ生物信息学软件工具对抗原编码序列进行了密码子优化。02其他元件的设计2.1启动...

疫苗前沿 | mRNA传染病疫苗最新综述|原性|寄生虫|mrna|新冠病毒...

目前,普通mRNA序列中会引入某些修饰核苷用以增加蛋白质的产生、降低先天免疫反应。mRNA的关键考量点是其半衰期、稳定性、可翻译性和炎症能力,这些特征会影响mRNA疫苗的有效性和安全性。上述问题可以通过优化mRNA的结构元素5′cap、5′-UTR、CDS区、3′-UTR、poly(A)尾来得到改善(图1)。其中非编码元件、UTR、5′ca...

「星耀小课堂」一文读懂|IVT RNA质粒模板序列设计全解析

服务于mRNA的质粒模板应满足以下需求：首先是目标RNA编码序列，即UTR、CDS和polyA。其实是质粒功能元件，包括复制起点（ori）、启动子、线性化酶切位点、抗性基因，以具备自我复制和选择性筛选的功能，并能够转录生成特定长度的RNA转录本。今天这篇文章我们将聚焦于IVTRNA质粒模板的功能元件和设计策略。图1:IVTRNA...

疫苗前沿 | mRNA 癌症疫苗的最新进展

高通量筛选(HTS)技术和遗传算法的快速发展,有助于从细胞或病毒基因组中识别出潜在的优化序列,这些序列来自5'UTR和3'UTR的多样化库。mRNA中编码序列(CDS)的优化对于有效的基因表达至关重要。常见的策略包括将宿主细胞中罕见的密码子替换为更普遍的同义密码子。2005年,Karikó等人通过纳入前文提到的修饰核苷,解决...

Cancer Commun | 喜讯!武汉同济医院张必翔团队团队发现肝癌治疗新...

将HMGB2CDS连接到多克隆位点(MCS)来构建了pmirGLO-HMGB2荧光素酶报告基因,双荧光素酶测定清楚地表明,与对照细胞相比,NAT10缺陷细胞中HMGB2的翻译效率显著降低(图4H,补充图S4B-C)。此外,与对照细胞相比,NAT10缺陷细胞中HMGB2mRNA在核糖体组分中的分布显示翻译活性多聚体(>80S)显著减少(图4I)。这些综合结果...

PlantCFG: 植物开花基因数据库

在“下载”模块中,用户可以批量下载FASTA格式的候选开花基因列表以及蛋白质、CDS和基因序列(www.e993.com)2024年11月19日。该模块便于用户高效地执行序列分析。此外,研究者还开发了“提交”模块,用户可以轻松添加新报告的开花基因。为了方便用户更好地理解模块,添加了“关于”页面来搜索、合成、进化和提交模块,并提供了每个模块的详细描述。

人类基因组中这些被忽视的非编码序列,被发现普遍表达癌细胞生存...

人类基因组序列的早期分析表明,人类拥有10万个甚至更多的编码蛋白质的基因。然而,进一步的研究发现,这些候选基因中的大多数更有可能产生非编码RNA、片段互补的DNA克隆或表达水平不显著的RNA。与此同时,人类蛋白质组计划中的NeXtProt数据库识别出约17600个经质谱分析确认的蛋白质编码基因以及约2100个未确认的蛋白质编码...

CdSe/ZnS荧光量子点偶联OTA单克隆抗体|叶酸-BSA偶联CdTe量子点

量子点定制：纳米二氧化锰偶联peg化AgInSe2(银铟硒)量子点修饰甲氨蝶呤纳米SiO2偶联peg化硒化锌量子点修饰阿霉素DOX纳米二氧化硅偶联peg化ZnSe量子点修饰紫杉醇PTX纳米Fe3O4偶联peg化CdSe/Cds量子点修饰喜树碱CPT纳米四氧化三铁偶联peg化CdTe/CdS量子点修饰顺铂DDP纳米金偶联peg化CdSe/ZnSe量子点修饰吉西他滨...

RACE专题 | RACE实验总翻车?吃透原理才能应万变!

RACE(rapidamplificationofcDNAend)也叫cDNA末端快速扩增技术,是一种在已知部分cDNA序列时,通过逆转录和PCR快速克隆得到完整的cDNA的3'或5'末端的分子生物学技术。广泛应用于cDNA文库的构建及筛选、克隆已知序列的旁侧内部序列、克隆同源基因的同源片段、克隆长链非编码RNA全长、mRNAUTR区域定位等研究。

野生二粒小麦抗白粉病基因MlIW172

通过筛选硬粒小麦Langdon的BAC文库，对获得的两个阳性BAC克隆进行测序，开发出3个与MlIW72紧密连锁的分子标记。利用MlIW172基因组区域短柄草共线性基因的CDS序列比对当时刚组装出来的乌拉尔图小麦Triticumurartu基因组scaffolds，找到scaffold25403(333kb)和scaffold96474(61kb)，并根据它们开发出5个与MlIW172紧密...