一种新型研究的出现,造福全人类

方法使用一个具有编码器和解码器的网络模型,使用多任务方法训练。环境的特征使用氨基酸类型,但是没有显式描述氨基酸的侧链构象(Rotamer-Free)。通过X-ray的实验验证,ABACUS-R超过了目前最优秀的序列从头设计算法,可以作为非常有效的蛋白质设计工具3.CarbonDesign是蛋白质序列设计版的AlphaFold,它从用于蛋白质结构预测...

时代楷模!一种新型研究的出现轰动世界,造福全人类,成功通过细节...

方法使用一个具有编码器和解码器的网络模型,使用多任务方法训练。环境的特征使用氨基酸类型,但是没有显式描述氨基酸的侧链构象(Rotamer-Free)。通过X-ray的实验验证,ABACUS-R超过了目前最优秀的序列从头设计算法,可以作为非常有效的蛋白质设计工具3.CarbonDesign是蛋白质序列设计版的AlphaFold,它从用于蛋白质结构预测...

人类基因组草图再添细节 X染色体被无死角解码

“由于人类基因组太长了,目前任何测序技术都无法一次性读取所有的序列信息。因此,科学家只能把基因组打碎成一个个小片段进行测序,最后再组装起来。”南京医科大学生物信息学系主任汪强虎教授说,在外人看来,这些科学家所做的工作就像是在“拼图”。在这幅“拼图”中,有许多重复的序列。由于测序技术只能完成短片段读取...

国内首个!《动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

宏基因组高通量测序获得的微生物序列数(Reads)受测序样品量、样品质量、下机数据量等因素影响,每个样品测序获得的微生物序列数不一致。因此宏基因组高通量测序结果判定时,建议将测序获得的微生物序列数进行归一化,以每百万条序列数(Readspermillion,RPM)或每千万条序列数(Readspertenmillion,RPTM)为单位。各...

三代测序动态突变检测(dmTGS)的创新解决方案 提升临床适用性与...

图3.dmTGS可检测FRM1体细胞嵌合CGG扩张dmTGS可检测VNTR可变数目串联重复序列(variablenumbertandemrepeat,VNTR)表现出高度的多态性。目前已报道与疾病相关的基因有PLIN4、EIF4A3、PRNP、CACNA1C、ABCA7和WDR7,这类串联重复的检测对于传统方法是一个极大的挑战,如PLIN4为99bp重复序列异常扩增,先前的...

Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...

首先,我们从IMG/M的26931个宏基因组数据集中剔除了所有与IMG数据库中超过10万个参考基因组或Pfam匹配的基因,从而确定了新的蛋白质空间(www.e993.com)2024年11月20日。接下来,我们将剩余的序列聚类为蛋白质家族,探索它们在分类学和生物群落中的分布,并在可能的情况下预测它们的三级(三维)结构。

全球首个核苷酸序列!江苏泰州发现罕见小p血型,我国仅记录10余人

此次曹国平发现的特殊基因序列的P表型血，属于人类第三个被发现的血型系统。这种血是P血型系统中一种极其罕见的血型，为常染色体隐性遗传。P血型1927年由奥地利生物学家兰德斯泰纳发现。目前P血型共有7个分型(P1、P2、LEK+、LEK-、P、P1K、P2K)，前4种在人群中常见，后3种则罕见。其中小p血型红细胞上缺乏所有...

下一个“合成致死”新星?阿斯利康、罗氏、恒瑞、英派等都看中的...

“合成致死”是指两个非致死基因同时被抑制,导致细胞死亡的现象。利用这一机制找到肿瘤中的特异突变,再找到它的“合成致死搭档”,将有望特异性杀死癌细胞。众所周知的PARP抑制剂是首个利用“合成致死”概念在临床上取得成功的药物。PARP抑制剂之外,科学家们也在探索一些其它的“合成致死”新靶点,以期给癌症患者带来...

重大突破!人类基因簇新序列被发现

这是史上第一个完整的、无间隙的人类基因组序列，它首次揭示了高度相同的节段重复基因组区域及其在人类基因组中的变异。美国国家人类基因组研究所的高级研究员亚当菲利普博士表示，“获得完整的人类基因组序列就像换上了一副新眼镜，当我们对某人的基因组进行测序时，我们将能识别所有的DNA变体，并利用这些信息更好地...

Nature Methods | 精准基因比对新突破:Genes2Genes框架助力单细胞...

G2G在时间序列数据中的应用:图中首先展示了G2G在一个已发表的小鼠骨髓来源的树突状细胞数据集中的应用。该数据集包含了PAM(参考)和LPS(查询)两种刺激条件下的细胞轨迹。G2G的比对结果展示了基因在两种条件下的匹配和不匹配状态,特别是发现了在早期和晚期伪时间点上的基因表达差异。