iMeta | 上海市食药检院/美吉生物-??MIST: 可交互微生物鉴定和...
基于HTS的方法可分为两类:1)扩增子测序,扩增子测序扩增微生物中的保守序列(例如,细菌的16SrDNA和真菌的18SrDNA/ITS区域),2)全基因组测序(WGS),在微生物纯培养后对微生物的全基因组进行测序。基于16SrDNA的扩增子测序是研究样本中所有细菌的有效方法,因为该区域已被公认为微生物群落鉴定的常规方法。在Ribosoma...
SnapGene安装包下载:snapgene如何查找序列的保守序列
1、打开SnapGene,直接将txt拖入snapgene起始界面。2、SnapGene将自动识别txt中的每个序列,并将其拆分成为单独的序列文件,点击Import,软件将生成一个文件夹,文件夹中含有txt中的每一个FASTA序列。第三部分:SnapGene详细安装教程httpspan.baidu/s/1Byl4EomaMSG8f3LvVgG3JA?pwd=67ew...
基因组研究揭示鸟类特有保守序列
研究者首先猜测鸟类的特异性表型可能与其基因组特异性的保守DNA序列有关,即这些序列由于受到强烈的自然选择压力在所有鸟类中很少发生变化,但在其他脊椎动物里这些序列要么不存在,要么发生了很大的变化。研究团队通过比较48个已知鸟类物种的基因组和9个其它类群脊椎动物基因组(涵盖哺乳类、爬行类、两栖类和鱼类),发现大概...
碳青霉烯类耐药性在人源和动物源产NDM酶大肠埃希菌间的传播丨...
(四)动物源和人源NDM阳性大肠杆菌间的保守序列分型由于NDM是CREC菌株中主要的碳青霉烯酶,因此利用生物信息学手段进一步研究了动物源和人源NDM阳性大肠杆菌间的关系。用463株NDM阳性大肠杆菌和463株随机选择匹配的NDM阴性大肠杆菌(1∶1)构建了基于序列分型(sequencingtypes,STs)的最小生成树,其菌株来源组成为人(...
FSAP|黑龙江大学孙庆申教授:植物乳杆菌L3的抗菌机制、全基因组...
Ⅱb类细菌素中GxxxG的保守序列使两个多肽形成膜渗透性的螺旋-螺旋结构,然后与靶细胞膜上的识别蛋白结合,使其发生构象变化,形成复杂而特异的孔隙,这也与上述抗菌机制的结果一致。图6antiSMASH此生代谢产物分析结果(A)BAGEL4细菌素基因簇分析结果(B)如表4和图7所示,PlantaricinE和PlantaricinF不包含预测的跨...
悦康药业和病原所合作开发针对新冠肺炎的多肽药物
新京报讯(记者刘旭)1月10日,悦康药业宣布与中国医学科学院病原生物学研究所签署《技术转让(专利权)合同》,合作开发针对新型冠状病毒肺炎的广谱冠状病毒膜融合抑制剂多肽药物(www.e993.com)2024年9月7日。该药物针对病毒S蛋白的保守序列设计,能阻断病毒与宿主细胞的
曹议匀等Science突破:深度解析促癌肠菌的新型基因毒素|热心肠日报
此外,针对可单独或不能单独培养的微生物均可利用HiFi测序组装出高质量基因组。相比二代短读长,利用HiFi测序还组装出高度保守序列(rRNA)和可移动序列(基因岛)。总之,HiFi测序为进一步提高人类肠道菌群基因组质量提供了新视角,但目前测序价格相对昂贵且需要更多的DNA量等问题仍需要改善。(@九卿臣)...
探秘公共空间生物气溶胶新冠病毒检测系统
“我们的检测都是针对病毒的保守序列。病毒虽然在不断变异,但是其有些部分是不变的,保守序列就是不变的部分。因为一旦病毒保守序列发生改变,这个病毒就会‘死掉’。”刘鹏表示,检测基于保守序列,因而无论是德尔塔还是奥密克戎,检测系统都可以准确检测。同时刘鹏也表示,由于检测系统是针对保守序列的,因而在第一...
雷厉风行 火眼金睛——探秘公共空间生物气溶胶新冠病毒检测系统
“我们的检测都是针对病毒的保守序列。病毒虽然在不断变异,但是其有些部分是不变的,保守序列就是不变的部分。因为一旦病毒保守序列发生改变,这个病毒就会‘死掉’。”刘鹏表示,检测基于保守序列,因而无论是德尔塔还是奥密克戎,检测系统都可以准确检测。同时刘鹏也表示,由于检测系统是针对保守序列的,因而在第一时间只...
北京各区疫情呈现差异化分布
北京市疾病预防控制中心副主任刘晓峰在会上指出,4月22日至5月18日,北京市各区疫情呈现差异化分布,当前社会面仍有零星散发病例,疫情防控形势依然严峻。刘晓峰指出,我国新冠病毒核酸检测试剂均是针对新冠病毒突变位点较少的保守序列设计的,因此,国内核酸检测试剂不受病