超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
下图展示了AlphaFold3对RNA修饰蛋白复合物的结构预测,该复合物包含一个蛋白质(蓝色)、一条RNA链(紫色)和两个离子(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。下图展示了AlphaFold3对一种分子复合物的结构预测,该复合物包含一种酶蛋白(蓝色)、离子(黄色球体)和单糖(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。这种酶...
...突破mRNA翻译瓶颈:LEGO技术显著提升疫苗和蛋白质疗法的效能
结果表明,相比于未修饰的mRNA,经优化的编码人促红细胞生成素(hEPO)的双帽mRNA-LNP复合物能够在小鼠体内产生总共近8倍的hEPO蛋白表达并显著提高小鼠血液中网织红细胞的比例,显示其用于蛋白质疗法的优越性。而在针对SARS-CoV-2的mRNA疫苗应用中,经优化的mRNA不仅能够在注射后七天内产生抗体免疫反应,而且在加强针免疫...
...AlphaFold3来了!超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子...
下图展示了AlphaFold3对RNA修饰蛋白复合物的结构预测,该复合物包含一个蛋白质(蓝色)、一条RNA链(紫色)和两个离子(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。下图展示了AlphaFold3对一种分子复合物的结构预测,该复合物包含一种酶蛋白(蓝色)、离子(黄色球体)和单糖(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。这种酶...
2024年诺贝尔奖中的生命科学
相对于蛋白质单体,实验上解析蛋白质-蛋白质复合物结构要困难得多。目前PDB(ProteinDataBank)数据库中收录的蛋白质单体结构超过4万个,蛋白质-蛋白质复合物结构的数量超过10万个。因此,迫切需要发展有效的计算机模拟方法来探索蛋白质分子间的相互作用与识别过程,进而预测蛋白质-蛋白质相互结合形成的复合物三维结构。
ADC的方方面面,你了解多少?
泰兰司他丁及其类似物靶向剪接体是一种参与mRNA加工的大型核糖核蛋白复合物,为靶向癌症治疗提供了一种有希望的治疗选择。有几种天然产物能够通过与不同的剪接体亚单位结合来抑制RNA剪接。最具代表性的是thailanstatinA,它可以与剪接体的SF3b亚单位结合,从而阻止RNA剪接。
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
其它高丰度的转录本,例如珠蛋白RNA(globin)或线粒体RNA也可以按照类似的方法去除(www.e993.com)2024年10月18日。Pull-out方法中探针是带有生物素的,然后使用链霉素包裹的磁珠从总RNA溶液中除去探针-rRNA复合物,剩余的RNA用于建库测序,试剂盒有Ribo-Zero(Illumina,USA)(生信宝典注:还是Illumina取名字霸气)和RiboMinus(ThermoFisher,USA)。
FIDA分子互作仪:带你复现Nature青睐蛋白质与核酸互作50分顶级发文...
FIDA不仅可以表征互作亲和力,也同时无标记检测CRISPR核酸酶与gDNA相互作用的热力学、亲和力、和结合动力学,全面表征蛋白与核酸互作。FIDA不仅可以完成本研究中得到的CbCas9-PcrIC1复合物表现出增强的DNA结合亲和力,还可在无标记下表征蛋白与核酸的热力学参数与结合动力学,甚至表征结合时蛋白构象变化与获得有关基因编辑过...
AI正在重构诺贝尔奖,哪些制药公司可以承接下一轮泼天富贵?
该模型能预测含有蛋白质数据银行(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构。对于蛋白质与其他分子的相互作用,与现有预测方法相比,AlphaFold3改进了至少50%,这使AlphaFold3成为首个在生物分子结构预测方面超越基于物理的工具的人工智能系统。此外,AlphaFold3的预测能力已经不再局限于蛋白质,其范围...
科学家研发新型核酸检测系统,无需依赖昂贵蛋白质酶,单次材料成本...
然而,核酸标志物存在低丰度、高度动态、高异质性、背景干扰大等特点,其临床检测面临着测不出、测不准、测不全、测不了、测不起等挑战。因此,迫切需要开发超灵敏、高特异、通量高、便捷经济的核酸生物标志物检测分析方法。DNAzymes是一类体外筛选的合成DNA分子,具有类似酶的催化活性,例如裂解核酸磷酸二酯键。
分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...
1、确定两种蛋白是否有相互作用,一般在后面接WB实验;2、确定两个蛋白的结合的结构域或者位点,一般结合片段截短或者突变实验;??相关资料03Biacore??原理Biacore技术是一种基于表面等离子共振(SPR)原理检测生物分子相互作用的技术,可以用来检测蛋白和蛋白,蛋白和核酸,蛋白和小分子,抗原和抗体等之间的相互作...