畅谈寡核苷酸类药物ADME表征及DDI

ONs是由化学合成的寡核苷酸单链或双链组成的一类药物,一般由12-30个核糖核苷酸或脱氧核苷酸单链或双链组成。ONs通过沃森克里克碱基互补配对作用于目的核苷酸序列上,干扰基因的解旋、复制、转录、翻译等各个环节,使编码异常的基因丧失功能,进而矫正“错误”蛋白质的表达,达到治疗疾病的目的。ONs包括反义核酸(ASO)、小...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

而以上这些方法都依赖于cDNA转换,这一过程抹去了有关RNA碱基修饰的信息,而且也只能粗略估计多聚腺苷酸(poly(A))尾巴的长度,而directRNA-seq可以直接分析全长转录本异构体、度量碱基修饰(比如N6-甲基腺苷(M6A))和检测poly(A)尾巴长度。RNA-seq技术的进步在NCBIShortReadArchive(SRA)数据共享平台中多于95%...

首创集成式表面阵列传感系统,栅极芯致打造超灵敏和超多重蛋白组学...

基因组学和蛋白质组学是相互关联的,而不是分开的,但是蛋白质组学在功能上更为复杂。人类有2.5万个单独的基因,但是有超过100万个不同的蛋白质类型。因为DNA由4个核苷酸碱基组成,而蛋白质由20种不同的氨基酸组成。磷酸化、乙酰化和泛素化等翻译后修饰改变了蛋白质成型和功能。这就造成了虽然一个人的基因组基本不...

“DNA存储”锻造合成生物学“底层基座”

工作人员将带有不同二维码的微型芯片依次放入合成仪中,芯片上就会“长出”DNA——按照芯片设置的预定顺序,不同种类的脱氧核糖核苷酸将自动连接为DNA链。该平台由20余台华大自主研发的全国产化高通量合成仪组成,可实现年合成通量超百亿碱基。目前,华大基于分选芯片并行合成原理的高通量DNA合成仪已升级至第五代,在关键...

陈玲玲:RNA有自己的特点,别把它当蛋白质来“玩” | 走近科学

LncRNA非常多样,有些只需要数百个碱基就可以发挥功能,而另一些则可以长达3.6万个碱基——Xist就很长,有2.1万碱基。如此长的lncRNA要发挥功能,可能是依赖于其中一些功能性的单元模块从而与一些功能因子互作,但是这些关键单元如何形成、如何折叠、如何与蛋白质相互作用,目前还没有发现一个普适性的规律。

基因工厂云探秘系列1--合成原料与合成仪

以此循环,直到完成指定寡核苷酸序列的合成(www.e993.com)2024年11月12日。合成后处理合成完成后,寡核苷酸链仍固定在固相载体上,需使用裂解液打断固相载体与寡核苷酸之间的连接,将合成好的寡核苷酸从固相载体上氨解切割下来,并去除寡核苷酸上的各种保护基团,包括碱基上的保护基和糖基2'位的TBDMS基团,最后通过高效液相色谱(HPLC)或其他纯化方法,...

技术分享|浅谈寡核苷酸之单体

(1)核苷:碱基和核糖或脱氧核糖通过糖苷键缩合形成核苷或脱氧核苷,连接位置是核糖或脱氧核糖上的1号位置。种类有:腺苷、鸟苷、胞苷、尿苷、脱氧脱氧腺苷、脱氧鸟苷、脱氧胞苷、胸苷。(2)核苷酸:核苷或脱氧核苷通过酯键结合形成核苷酸或脱氧核苷酸注:尽管核糖环上的所有游离羟基(核糖的2、3、5号位及脱氧核糖的3、...

寡核苷酸合成的底层技术 – 亚磷酰胺三酯合成法!

缩合反应式核苷酸单体是通过亚磷酯键与CPG上的寡核苷酸连接,而亚磷酯键不稳定,易被酸、碱水解,常用碘的四氢呋喃溶液将亚磷酰转化为磷酸三酯,得到稳定的寡核苷酸。那么,如果实现这一连串的步骤呢?DNA合成仪就是将上述一系列化学合成过程进行自动化,精准可控的设备。仪器主要由试剂驱动系统、试剂瓶组、碱基瓶组...

核酸药物,潜能释放,中国已成为全球核苷酸原料最大出口国

除mRNA药物外,基本上其他核酸药物都是由100个以内的核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸单链或双链组成,所以也称为寡核苷酸或小核酸药物。与mRNA药物编码产生蛋白不同,寡核苷酸药物主要是通过碱基互补配对原则与DNA、mRNA或者pre-mRNA配对,通过基因沉默、非编码RNA抑制、基因激活等一系列机制来调节基因表达。

寡核苷酸疗法未来可期

寡核苷酸通常是由20个以内的短链核苷酸(脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸)组成,可以通过Watson-Crick碱基互补配对原理与DNA、mRNA或者pre-mRNA配对,实现非常高的选择性,精准地抑制某些基因,让编码异常的基因保持“沉默”,从而阻止许多“错误”的蛋白质表达。目前,在研的寡核苷酸药物种类很多,包括反义寡核苷酸(ASO)、小干扰核糖...