一定要了解!血液DNA提取试剂选择秘诀
DNA得率与裂解液的性能有关,裂解液通常含有去污剂、盐和蛋白酶。去污剂是通过使蛋白质变性,破坏膜结构及解开与核酸相连接的蛋白质,从而使核酸游离在裂解体系中;盐可以为反应提供一个合适的裂解环境,抑制样品中的核酸酶在裂解过程中对核酸的破坏,维持核酸结构的稳定等;蛋白酶可以将蛋白质消化成小的片段,促进核酸与...
物理拉扯DNA是什么感觉? ; 用AI识别AI写的论文准确率可达94% |...
他们在发表于Cell的论文中描述了这种特殊的方法:使用一种可对激光作出反应的生物工程凝聚物,类似一种由CRISPR创造的特殊蛋白质,将其附着在两根不同的DNA上,然后用特定波长的蓝光照射,这两种蛋白质会变大然后合并在一起,这时就会将两根DNA拉到了一起。图源:WrightSeneres研究人员表示,以这种方式对DNA进行...
洪亮团队基于图扩散概率模型生成活性高、体积大、结构复杂蛋白质
结构和功能之间的隐含映射规则,生成多样化的蛋白质序列,并以极高的成功率通过湿实验验证,最终在两款超长的多结构域复杂功能蛋白(KurthiamassiliensisAgo和PyrococcusfuriosusAgo,简称为KmAgo和PfAgo)得到超过10倍的DNA剪切活性提升,显著高于现有任何已发现的常温野生型蛋白活性。
Cell:张锋团队揭示首个真核基因编辑系统Fanzor的结构多样性和DNA...
在GtFz1中,未结合DNA的状态以及两个结合了不同形式DNA的结构展示了REC结构域在R-loop形成和稳定中的关键构象变化。而在SpuFz1和PpFz1中,研究解析了具有不同数量Guide/DNA碱基配对的结构,揭示了RuvC结构域中的一个环状结构(通常被称为“Lid”)对蛋白激活的关键调控作用。该研究还发现,这个Lid能够随着Guide/DNA配对...
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
AlphaFold3和AlphaFold2的区别(包含实践示范:如何使用AlphaFold3大模型开源服务器进行蛋白质结构预测以及相互作用预测)Rosettafold详解c)基于Alphafold的下游应用基于AF的蛋白-蛋白对接/蛋白-多肽对接利用AF2做多构象预测和功能发现基于AF2的环肽设计d)trrosetta幻想设计e)基于ProteinMPNN的蛋白质设计MPNN模型简...
诺奖2024|解读:小RNA如何帮助我们理解生命和治疗疾病?
细胞核的DNA中储存着生命的“密码”,这些遗传信息通过转录被复制到“信使”RNA(mRNA)中并被带到细胞质,在那里进行蛋白质的合成(“表达”),形成生命的构造和功能(www.e993.com)2024年10月17日。不同于mRNA,miRNA是一类长度仅约20~22个核苷酸的小RNA(smallRNA)分子,它并不直接参与蛋白质的合成,而是通过调控mRNA影响基因的表达。
AI成功改写人类DNA,全球首个基因编辑器震撼开源,近5倍蛋白质宇宙...
也就是说,世界上首个使用AI从头设计的分子级精确基因编辑器诞生了。就像ChatGPT能生成诗歌一样,Profluent这个全新的AI系统,可以让我们编辑自己DNA的微观机制生成蓝图。在迄今最广泛的基于CRISPR的基因编辑系统数据集上,研究者训练了LLM。这些LLM产生的蛋白质,将几乎所有天然存在的CRISPR-Cas家族的多样性,扩大了4.8倍...
不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
图|蛋白质是具有数亿种不同形状的分子。从在血液中携带氧气到引发化学反应,每一种蛋白质都具有特定的生物功能。功能通常由其形状或结构来定义。(来源:RCSBPDB)当谷歌将这一消息推向世界时,媒体为之疯狂。头条新闻宣称AlphaFold2“将改变一切”。那些毕生致力于研究单个蛋白质结构的蛋白质生物学家担心自己会失业...
蛋白质含量远超牛肉 小小的南极磷虾潜力巨大?
中国水产科学研究院黄海水产研究所水产生物技术与基因组室主任邵长伟:我们人类的基因组才3.2个G,小小的南极磷虾,虽然个儿很小,但它的基因组却是我们人类基因组的16倍那么大。种群规模庞大的南极磷虾,是人类重要的蛋白质储存库和战略资源,一直受到各国科学家的关注。有了完整的DNA序列图谱,南极磷虾的许多生物特性...
全球最大结直肠癌多组学研究:科学如何让疾病分类更准确?
林从:组学分析是从不同层面和角度对生物系统中大量分子数据进行研究的方法。一般通过高通量技术(如基因测序、质谱等)得到不同类型的数据,如基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等。基因组是指人体内所有DNA的总和,包括所有的基因以及非编码区域,线粒体基因组等。转录组是指所有RNA分子的集合,转录组分析提供了基因表...