悲剧or春天?AlphaFold究竟给结构生物学家带来了什么?
激酶有几个区域,这些区域会翻转并快速进入不同的、容易接近的构象状态,AlphaFold的结构预测结果不一定能够捕获所有这些信息,而且它们肯定不会告诉你哪些结果与活性酶有关,哪些与蛋白质在体内的不同功能更相关。考虑一下刚才提到的那些脯氨酸:AlphaFold可能会给你一种蛋白质结构中的顺式脯氨酸,也可能给你一个蛋白...
华东理工大学2023年硕士研究生招生考试大纲:619药学基础综合
同系列和构造异构、碳架异构;烷烃的结构,甲烷的结构;构象,乙烷、正丁烷的构象;构象的表示方法:锯架式、透视式、Newman投影式。烷烃的物理、化学性质;自由基卤代反应历程,反应中能量的变化、反应热、活化能;异构化反应、裂化反应和裂解反应;烷烃的制法:烯烃的氢化,Corey-House反应,Wurtz反应,Grignard试剂法,卤代烷...
百度飞桨拿下KDD CUP 2021两金一银背后:自研图学习框架PGL显威力
分子特性预测已被广泛认为是计算药物和材料发现中最关键的任务之一。基于DFT量子物理计算的方法需要耗费大量时间才能有效预测多重分子性质。为了利用图神经网络强大的表达能力来预测分子性质,飞桨PGL与螺旋桨PaddleHelix生物计算框架联合提出了LiteGEM模型,利用分子的3D构象构造自监督预训练辅助任务,提升分子性质...
KDD CUP 2021放榜!百度飞桨 PGL 在全部三赛道斩获三金一银
分子特性预测已被广泛认为是计算药物和材料发现中最关键的任务之一。基于DFT量子物理计算的方法需要耗费大量时间才能有效预测多重分子性质。为了利用图神经网络强大的表达能力来预测分子性质,飞桨PGL与螺旋桨PaddleHelix生物计算框架联合提出了LiteGEM模型,利用分子的3D构象构造自监督预训练辅助任务,提升分子性质预测效果,并最终...
百度飞桨拿下KDD CUP 2021两金一银背后:自研图学习框架PGL显威力
基于DFT量子物理计算的方法需要耗费大量时间才能有效预测多重分子性质。为了利用图神经网络强大的表达能力来预测分子性质,飞桨PGL与螺旋桨PaddleHelix生物计算框架联合提出了LiteGEM模型,利用分子的3D构象构造自监督预训练辅助任务,提升分子性质预测效果,并最终获得亚军。
五大顶级学者的AlphaFold 2论道:破译结构、开源代码后的产研「大...
第一,预测蛋白质结构拓展,例如解析电镜结构或解析晶体结构,这些问题已经解决的很好(www.e993.com)2024年10月19日。第二,对蛋白功能理解,像GPCR蛋白以前没有精准结构预测方法,所以看不出来活性状态和失活状态下的结构差异。现在有了精准预测方法以后,就可以看到不同活性状态下的结构差异,也就推进了我们对蛋白功能的理解。
北京市科学技术委员会、中关村科技园区管理委员会 新闻中心 北京...
主要衣壳蛋白p72原子分辨率结构展示出非洲猪瘟病毒潜在的构象型抗原表位,与其他的核胞质大DNA病毒(NCLDV)显著不同。次级衣壳蛋白在衣壳内表面形成了一个复杂的蛋白相互作用网络,通过调控相邻的病毒壳微体之间的作用力介导衣壳的组装并稳定了衣壳的结构。作为核心的组织者,100纳米长的M1249L蛋白沿着三重对称体的每个边缘...
2019年度中国科学十大进展揭晓,“量子”研究占据两席
主要衣壳蛋白p72原子分辨率结构展示出非洲猪瘟病毒潜在的构象型抗原表位,与其他的核胞质大DNA病毒(NCLDV)显著不同。次级衣壳蛋白在衣壳内表面形成了一个复杂的蛋白相互作用网络,通过调控相邻的病毒壳微体之间的作用力介导衣壳的组装并稳定了衣壳的结构。作为核心的组织者,100纳米长的M1249L蛋白沿着三重对称体的每个边缘...
分析化学知识点总结贴
J值大小表示氢核间相互偶合作用的强弱。与化学位移不同,不因外磁场的变化而变化,受外界条件的影响也很小。偶合常数有以下规律:(1)J值的大小与B0无关。影响J值大小的主要因素是原子核的磁性和分子结构及构象。因此,偶合常数是化合物分子结构的属性。