Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型...
癌症的基因型通常指的是癌细胞中的基因组变异,包括基因突变、染色体重排、基因拷贝数变异等。这些变异能够直接或间接影响细胞的生长、分化和死亡,从而推动癌症的发展。例如,某些基因突变可能激活致癌基因或失活抑癌基因,导致细胞增殖失控。表型多样性的遗传基础癌症的表型不仅指肿瘤的形态特征,还包括其生物学行为,如侵...
...NanoGPS:实现高通量单细胞长读测序分析同一细胞基因型和表型的...
内容概要:介绍了一种名为scNanoGPS的单细胞长读测序分析方法,可以在不依赖短读或白名单的情况下计算同一细胞的基因型和表型。将scNanoGPS应用于4种肿瘤和2种细胞系的23,587个长读转录组,发现肿瘤和基质/免疫细胞表达不同的基因亚型组合,并且不同细胞类型存在特异性的突变。2、空间细胞结构预测胶质母细胞瘤的预后...
中国农业科学院作科所举办作物田间表型精准鉴定技术交流研讨会
中国农业大学马韫韬教授系统介绍了表型平台搭载各类传感器设备及其在表型调查中的应用,并表示,这种高通量的表型监测技术可有效地提高作物农艺性状鉴定的估算精度,进而加速作物育种评价鉴定的效率。种质资源中心主任李立会指出,“精”选优异种质是通过多年多点全生育期表型与基因型鉴定;“准”确评估优异种质的可利用性是作...
《基因彩票》第八章:其他可能的世界
该图还指出了两个拥有不同基因的假设个体的结果:基因型A(圆形)与B(三角形)。具有某种基因型的个体的预期表型结果在不同的环境中如何变化,被称为反应规范(reactionnorm)。注AnthonyJ.F.Gri.thsetal.,“NormofReactionandPhenotypicDistribution,”inAnIntroductiontoGeneticAnalysis,7thed...
避开“拖后腿”的基因型,韩斌院士团队新研究助力杂交稻优选育种
此外,由于训练集包含了大量亚种间杂交稻来源的F2个体,该模型能够有效处理亚种间杂交稻的基因型数据,从而适用于亚种间杂交组合选配,有望推动亚种间杂交稻育种的发展。该研究通过分析2839份杂交稻品种的表型变化趋势,回顾了改良育种的成就:1.库器官显著增大,包括每穗粒数和有效穗数。库器官的增大搭建了材料的高产架子...
植物表型组学——用前沿科技铺陈未来农业画卷
植物表型是指植物群体和个体可以通过一定手段测定的诸如形状、大小、结构、颜色等的外在表现、以及除基因组(genome)以外的其它组学(如转录组、蛋白组、代谢组、离子组等)特定表达特征与生理生化过程(www.e993.com)2024年7月1日。我们把这种表型集合称为表型组,研究基因型与环境互作,控制表型组形成的科学就是表型组学。图1不同植物表型性状...
心肌病分五表型,新增非扩张型左室心肌病!ESC首个心肌病指南
基因型阳性/表型阴性者,或有轻度心肌病表型但无症状或任何危险因素者,可能能够参加竞技运动。对于一些高风险的肥厚型心肌病、非扩张型左室心肌病、致心律失常性右室心肌病患者,不鼓励进行高强度运动和竞技运动。来源:2023ESCGuidelinesforthemanagementofcardiomyopathies:Developedbythetaskforceon...
基因检测在疾病确诊、家系遗传模式分析与再生育计划中的重要作用
靶向基因panel全外显子组测序全基因组测序所有三个选项根据用于选择和富集DNA中感兴趣区域的捕获方法而有所不同。2.1靶向基因panel这些面板经过定制设计,重点关注与特定临床表型相关的基因的特定区域(外显子和侧翼内含子区域)。这通常是遗传性眼病的主要筛查方法,因为可以同时对大量已知致病基因进行测序,...
未来的生命形态会是怎样的? | 智能渐近线
在自然生态群落中,不同物种的生物相互作用。在Alife中,研究者则经常将个体视为某种基因型、表现型或生态型(genotypes,phenotypes,ecotypes)来分析群落动态。威廉·莱纳斯(WilliamReiners)[10]提出,统一的系统生态学研究需要至少三个独立互补的理论框架:能量学、物质学,以及种群相互作用或生态系统“连通性”(connectedness...
加快推进种业振兴的重要意义和实践路径
由于表型精准鉴定基地和规模化基因检测平台建设不完善,目前对农作物种质资源库中所保存种质资源的鉴定,基本局限于表型农艺性状的鉴定,被用于基因型和表型精准鉴定的数目不到10%,这一比例在三大粮食作物中仅有5%,能得到商业化利用的比例则更少①。而美国近10万份玉米种质资源中约有20%能够得到精准性状鉴定,并能...