Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

而以上这些方法都依赖于cDNA转换,这一过程抹去了有关RNA碱基修饰的信息,而且也只能粗略估计多聚腺苷酸(poly(A))尾巴的长度,而directRNA-seq可以直接分析全长转录本异构体、度量碱基修饰(比如N6-甲基腺苷(M6A))和检测poly(A)尾巴长度。RNA-seq技术的进步在NCBIShortReadArchive(SRA)数据共享平台中多于95%...

动脉粥样硬化中的DNA甲基化和组蛋白修饰及其表观遗传治疗视角

在促炎M1中观察到组蛋白赖氨酸甲基转移酶SETDB2(KMT1家族成员)上调,而在造血细胞中SETDB2缺失会促进血管炎症和加速动脉粥样硬化。组蛋白H3K27甲基转移酶Ezh2通过抑制细胞因子信号转导抑制因子Socs3,以增加巨噬细胞炎症反应。髓系特异性Ezh2缺失可降低巨噬细胞泡沫细胞炎症反应,减少一氧化氮、IL-6和IL-12产生,从而...

CMA在临床诊疗中的应用_澎湃号·湃客_澎湃新闻-The Paper

分辨率??CMA通常能够提供更高的分辨率,可以检测到较小的染色体缺失或重复,通常是几千个碱基对的尺度。??染色体核型分析能够检测到较大的染色体异常,如整体染色体的缺失、重复或易位。??全外显子测序则更为精细,能够检测到较小的单核苷酸变异,例如单核苷酸多态性或SNV。4潜在疾病范围??CMA可用于广泛的遗...

人造合成DNA,离现实又近了一步

无法分辨区别在新研究中,研究人员使用了所谓的人工扩展遗传信息系统(AEGIS)。这是一种为了扩展DNA的核苷酸字母表而开发的遗传系统,最开始时,它是美国宇航局的一个旨在研究地外生命的项目的一部分。AEGIS包含两个新的碱基对。但是,关于RNA聚合酶是否能识别和处理AEGIS,科学家仍不甚清楚。新研究从大肠杆菌中分离出R...

人类首个泛基因组草图公布!又多了1.19亿个碱基对,更好反映人类...

在这张图上,碱基相同的部分与以往的单一基因组参考一样保持了线性,而在某些单个核苷酸差异的地方,出现了路线的分歧,另外,绕过某个核苷酸代表缺失(如上图绿色和深蓝色路径),顺时针环绕代表重复(如黄色路径),逆时针环绕代表倒位(如粉色路径)等等。这次的泛基因组参考草图实现了预期序列99%的覆盖,并且在结构和碱基...

诺奖的背后:基因编辑发展史上的幕后英雄和未来发展,是魔剪还是...

通过将每一个组成部分逐一剔除,他们证明Cascade是将经由CRISPR基因位点转录的一个长前体RNA接入61个核苷酸长的CRISPRRNA(crRNAs)所必需的(www.e993.com)2024年11月14日。经过对一组与Cascade复合体一同纯化的crRNAs进行克隆和基因测序,发现它们都从8个碱基的重复序列开始,紧随其后的是完全间隔和新重复区的出现。这一发现支持了先前的假设,即重复...

华大基因: 2023年半年度报告

??????????????????????????????????????是嘌呤和嘧啶的衍生物,是核酸、核苷、核苷酸的成分。DNA??和??RNA碱基??????????????????????????指??????的主要碱基略有不同,其重要区别是:胸腺嘧啶是??DNA??的主要嘧啶??????????????...

用小分子靶向RNA:药物发现的前沿

反义寡核苷酸虽然市场上绝大多数传统药物的靶点是蛋白质,但反义药物靶点的是RNA。它们是经过化学修饰的核酸聚合物,依靠Watson-Crick碱基对与目标mRNA结合,导致基因沉默、立体阻碍、或替代剪接。反义寡核苷酸(ASO)可以与细胞核中的pre-RNA和细胞质中的成熟mRNA相互作用。它们可以针对外显子、内隐子和非翻译区(UTR...

Cas9脱靶效应的结构机理|dna|rna|位点|核苷酸_网易订阅

包含相对于向导RNA的单核苷酸缺失的脱靶位点是由碱基跳变或多个非经典碱基对而不是RNA隆起形成的。此外,PAM-远端不匹配会导致双向解配对,并诱导Cas9REC叶中的构象变化,干扰其构象激活。总之,这些研究为Cas9的脱靶活性提供了一个结构基础,并有助于改进向导RNA的理性设计和脱靶预测算法。

高中生物:这些“坑”千万要绕开!易错知识点必究

1.DNA与RNA的组成不同(1)五碳糖:DNA含有脱氧核糖,RNA含有核糖;(2)碱基:DNA含有碱基T,而RNA含有碱基U。2.中心法则的有关过程判断(1)模板是DNA,则为DNA复制或转录过程;模板为RNA则为RNA复制、翻译或逆转录过程。(2)原料为氨基酸,则为翻译;原料为核糖核苷酸则为转录或RNA复制过程;原料为脱氧核糖核苷酸则为DNA...