通过探究豇豆轻斑驳病毒,研究其基因组结构及其编码,有何特征?
其次可从cDNA文库里对已知蛋白的互作蛋白进行挑选,世界进展现今阶段,生物学上迎来高通量时代,当酵母双杂交与高通量两种技术结合使用时,可大大提高工作效率。此时可不仅仅局限于蛋白质之间的体内互作,它还可发掘出新的蛋白质的功能,在生物上的一些作用途径,机体功能,能量代谢途径发挥出作用,可对其做出科学有效的猜...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
short-read测序是检测和定量转录组范围基因表达的最常见方式,部分原因是因为它比表达芯片更便宜、更易于应用,但更主要的是它可以获得全转录组水平高质量的表达数据。采用Illumina的short-read测序做DGE分析的核心步骤包括RNA提取,cDNA合成,接头连接,PCR扩增,测序和数据分析(图一)。由于mRNA片段化和基于beads的文库纯化过...
中国医科大学2024年9月《生物技术制药》作业考核试题
由于酵母细胞基因组小,增殖一代所需的时间仅需几个小时,且具有易于培养、无毒性等优点,因此,酵母细胞是比较合适的细胞工程菌(或细胞)。29.动物细胞培养的污染主要有化学污染和微生物污染两种。30.酶的本质是催化剂,其仅能改变反应速度而不能改变反应的性质、方向和平衡常数,并且酶在反应前后其本身的结构和性质...
Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿
研究还发现,文库制备和测序平台的差异显著影响了转录组定义。例如,文库制备方法如CapTrap和cDNA测序生成了更多的读长数据,但不同工具对这些数据的处理结果不同。在具体实验中,不同平台生成的读长数量存在显著差异,这表明在选择测序平台时需要综合考虑文库质量和读长数量。研究团队还设计了多种评估指标和方法,以便更全...
酵母文库——对于突变你了解多少?(科普系列)
1、密码子(codon):遗传密码以三个核苷酸(三联体)为单位解读,每一组代表一种氨基酸,即每三个核苷酸序列成为一个密码子。2、可读框(ORF):一个由能翻译成氨基酸的三联体构成的阅读框称为可读框(ORF)。一个基因包括一系列密码子,从5’端的起始密码子往3’端的终止密码子解读,氨基酸序列即为N端到C端。
NGS文库构建的关键酶!
文库构建的本质是将片段化后的基因组DNA两端加上通用接头序列,通过PCR扩增获取足够多能够上机测序的文库核酸分子(www.e993.com)2024年11月16日。根据样本类型,又分为DNA建库和RNA建库。在DNA文库构建过程中,TA克隆连接接头建库是目前商业技术中最常用的技术手段,主要建库流程如下:图2.Illumina平台DNA文库构建流程...
【干货分享】怎样把CRISPR文库筛选玩出花儿?
在过去的几年中,CRISPR技术成为了生物领域中的一颗新明珠,CRISPR文库筛选作为其中的一种应用,建立目标物种的全基因组敲除库或与特定功能相关的基因敲除库,通过功能性筛选和富集及后续PCR扩增和深度测序分析,发掘与筛选表型相关的基因。基于CRISPR文库筛选的这种高通量功能性筛选技术也逐渐取代了RNAi和cDNA文库,为功能基因的...
新冠病毒RNA会整合到人类基因组中吗?
此外,该课题组还发明了从庞大数目的RNA中富集新冠病毒序列的方法,并对富集的核酸序列进行测序,未检出更高HVC,意味着它与RNA测序建库时引入的人为操作有关。总之,该研究表明之前观察到的所谓“新冠病毒基因组整合到人基因组”现象,实际上是在RNA测序过程中引入人为操作导致的假象,即“HVC”的整合事件是人为产物。
一文读懂基于长读长技术的单细胞全长转录本测序
现阶段主流的单细胞测序,大多是通过单细胞捕获设备获得cDNA文库后进行打断、扩增、建库,并用二代建库测序分析基因的整体定量。然而,基因在不同组织、不同细胞亚群中会使用mRNA的不同转录本,SNV、融合基因等结构变异也具有组织和细胞特异性,此外,科研界研究比较热门的lncRNA,在不同组织细胞亚群中也具有特异性的表达。
华大基因: 2023年半年度报告
一、载有公司法定代表人、主管会计工作的负责人与会计机构负责人签名并盖章的财务报表。二、报告期内公开披露过的所有公司文件的正本及公告的原稿。三、经公司法定代表人签名的??2023??年半年度报告文本原件。以上备查文件的备置地点:深圳华大基因股份有限公司证券部办公室??????????????????...