新方法可索引和搜索拍碱基级核苷酸资源

研究人员通过创建八个数据库来说明Pebblescout的功能,这些数据库索引了超过3.7个拍碱基。Pebblescout的网络服务可通过httpspebblescout.ncbi.nlm.nih.gov访问。这些研究表明,对于各种查询长度,Pebblescout都能提供一种数据驱动的方法来查找大型核苷酸资源的相关子集,从而大大减少了下游分析的工作量。研究人员还表明,Pe...

测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?

首先HiFi是基于单分子测序,测序模板为单独的DNA链,因此可以用来区分相似序列之间的区别。其次是长读长,HiFi测序能够提供15,000-20,000个碱基对或更长的读长,能够让基因组组装变得更加准确、高效。此外,超长的读长使其可以对完整的mRNA直接进行从头测序,获得全长转录本序列。同时,HiFi测序具备高准确性,通过循环一...

畅谈寡核苷酸类药物ADME表征及DDI

ONs产品被切掉少数核苷酸后,剩余的大代谢产物可能依然有活性,仅检测原型ONs会低估该分子的活性。另外,更小片段的代谢产物可能杂交结合脱靶序列,导致非预期毒性反应。故,ONs的代谢研究非常必要。体外代谢稳定性体外代谢在药物发现阶段用于考察候选分子的稳定性比较常用。虽然种属间代谢物种类通常没有区别,但代谢速率还是...

大涨150%,RNA编辑疗法爆火

两者区别在于,CRISPR-Cas9技术通过直接剪切DNA链上的特定基因序列,实现对基因的编辑。而RNA编辑技术通过特定的酶或编辑因子,对mRNA上的碱基进行修改,从而影响蛋白质的合成。机制的不同,使RNA编辑技术比CRISPR技术可能更具有优势:RNA编辑技术旨在通过改变RNA的序列来补偿有害突变,从而合成正常蛋白质。与CRISPR技术相比...

电大_国开24秋《医用基础化学#》形考作业3

4.正常的血红蛋白和镰刀型贫血病的血红蛋白结构的区别是()A.亚基数不同B.每一亚基的架构不同C.β-亚基N端第六位氨基酸残基不同D.α-亚基N端第六位氨基酸残基不同E.亚基数及结构不同5.细胞中进行DNA复制的部位是()A.核蛋白体B.细胞膜...

仇子龙/程田林团队成功利用全脑单碱基编辑技术,改善孤独症小鼠...

不仅比AncBE4等编辑器效率更高,还使用了PAM为NGN的SpGCas9,拓宽了编辑器的使用范围;第三是使用了可以突破血脑屏障的AAV-PHP.eB,高效地将编辑系统递送至小鼠全脑;第四是概念上证明了碱基编辑器可以通过一次给药的方式,对脑部遗传疾病进行精准且有效的基因治疗,为未来ASD及相关遗传疾病治疗提供了良好的思路与范式...

技术分享|疫苗佐剂之 CpG ODN:特性、研究进展与应用全解析

不同于ASO和siRNA等寡核苷酸药物通过碱基互补配对原理发挥作用,CpGODN通过与蛋白结合发挥作用(图5)。其中主要的作用力是疏水相互作用和氢键。图5:TLR9蛋白和CpGOND的计算机模拟3D结构图。CpGODN临床研究进展CpGODN已被广泛应用于多种疾病的研究和开发中。而且不仅仅用于人,对于动物的效果也非常明显。肿瘤免...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

在需要测序尽可能多核苷酸的实验中,首选long-readpaired-end测序。在DGE分析中,用户只需要计算比对到转录本的reads数即可,故不需要对转录本片段的每个碱基都进行测序。例如,将“短”的50bp的单端测序与“长”的100bp的双端测序的DGE分析比较表明单端测序也可以获得一致的结果。这是因为单端测序足以确定大多数...

DNA机器人,或让更多疾病治疗未来可期

“DNA机器人可以实现很多功能,比如DNA行走、识别、结构开合等,这些技术都是通过DNA的序列设计技术来实现的。而序列设计是基于DNA链和链之间的识别来控制配对。”齐浩举例说,比如DNA机器人行走,就是根据核苷酸的碱基互补配对原则,A、T、C、G这4种碱基能够两两连接,形成双链。利用这个原理,设计特殊序列的DNA“桩”,...

江苏吴中与丽徕科技签订战略合作 独家代理再生水光针产品PDRN

据了解,多聚脱氧核糖核苷酸(PDRN)是由50-200个碱基对组成的链状脱氧核糖核苷酸聚合物的混合物,主要从含有丰富核酸的鳟鱼和鲑鱼精巢中提取,因此又在医美市场被称为“三文鱼针”。由于PDRN碱基组成与人类DNA相似度高达98%,PDRN成分不会引起明显的免疫反应,产品安全性高。PDRN溶液与普通水光针的最大区别是其组织修复和...