质谱可以检测蛋白质序列吗
通过对质谱图的解析,可以得到肽段的质量信息,再通过数据库搜索,可以得到肽段的氨基酸序列。通过这种方式,质谱技术不仅可以用于蛋白质序列的鉴定,还可以用于蛋白质的定量分析,如蛋白质的表达水平分析、蛋白质的翻译后修饰分析等。质谱技术是蛋白质研究的重要工具,其在蛋白质序列检测中的应用为生物医学研究提供了强大的...
蛋白氨基酸序列测试方法的分析流程是什么?
蛋白质的氨基酸序列测试主要依赖于测序技术。目前常用的蛋白质测序技术包括质谱法和测序法。2.1质谱法质谱法是一种基于质量-电荷比的测序技术,常用的方法包括质谱图谱法和串联质谱法。质谱图谱法通过测量蛋白质分子的质量和碎片离子的质量,推断出蛋白质的氨基酸序列。串联质谱法则通过将蛋白质分子进行碎裂,测量碎片离子...
蛋白质组学研究新成果|解锁紫外光解离(UVPD)质谱产生的内部碎片
使用者需要提供蛋白序列、去卷积后的质谱数据、固定修饰信息、甚至非共价结合配体还能作为unlocalizedmodification添加进去用于holo-fragmemts的搜索。PCC评分系统将对碎片离子实验测定的同位素分布与理论计算的同位素分布进行比较,由此过滤掉低置信度的匹配。此外,软件中还增加了MassCalibration用于校正实验测定的m/z或去卷...
Nature子刊:黄硕团队首次通过纳米孔实现20种蛋白质氨基酸和翻译后...
蛋白质是生命活动的执行者,由20种天然存在的蛋白质氨基酸构成。与高歌猛进的DNA测序技术相比,高灵敏、高通量的蛋白质测序技术的发展严重滞后,目前仅Edman降解法和质谱法能做到蛋白质测序。然而,Edman降解法的序列分析长度有限,质谱法的检测限和动态范围阻碍了低丰度蛋白质的分析鉴定和新型生物标志物的发现。单分子蛋白...
南京大学黄硕Nature Methods:一个纳米孔,分辨全部20种氨基酸
蛋白质是一切生命活动的执行者,由20种天然存在的蛋白质氨基酸构成。与高歌猛进的DNA测序技术相比,高灵敏、高通量的蛋白质测序技术的发展严重滞后,目前仅Edman降解法和质谱法能做到蛋白质测序[1,2]。然而,Edman降解法的序列分析长度有限,质谱法的检测限和动态范围阻碍了其对于低丰度蛋白质的分析鉴定和新型生物标志物...
蛋白表达纯化时如何选择标签?
检测标签说明1HAHA标签,属于小标签,共9个氨基酸,标签序列YPYDVPDYA,源于流感病毒的红细胞凝集素表面抗原决定簇,对目标蛋白的空间结构影响小,可融合到N端或者C端,可购买商业化的Anti-HA抗体检测(www.e993.com)2024年7月29日。HA标签常用于蛋白质印迹,免疫荧光和免疫沉淀实验,偶尔用于ELISA和ChIP分析。2HisHis标签,也是小标签,多指6个...
ASMS2024|质谱技术应用前沿趋势大揭秘
质谱技术在蛋白质的结构鉴定、定量分析和修饰研究中提供了强有力的工具。利用高分辨质谱仪,可以精确测定蛋白质的分子量和序列,并通过多级质谱技术分析蛋白质修饰。相关主题报告包括:-基于毛细管电泳质谱的单细胞蛋白质组学应用进展-高通量蛋白质-配体相互作用分析...
河南工业大学布冠好教授等:大豆主要致敏蛋白及其检测技术研究进展
大豆球蛋白由氢键连接的5个主要亚基对组成,其主要亚基对根据氨基酸序列可以分为两组(组1包括A1aB1b、A1bB2、A2B1a;组2包括A3B4、A5A4B3),每个亚基对的分子质量约60ku。目前已知的大豆球蛋白酸性多肽链有6种:A1a、A1b、A2、A3、A4和A5,其分子质量为35~40ku;碱性多肽链有5种:B1a、B1b、B2、B3...
...Metab | 改写教科书:刘兴国组发现线粒体基因编码第14个蛋白质
该研究发现并证实了线粒体基因细胞色素b(CYTB),作为唯一的呼吸链复合物III的线粒体编码基因,其信使RNA出线粒体而使用胞质核糖体的标准遗传密码编码全新的187个氨基酸长的蛋白质(CYTB-187AA),翻译后定位到线粒体基质中。这一新蛋白沉默的转基因敲入小鼠模型及细胞模型发现其调控早期发育。本工作发现了一种...
蛋白质折叠的细胞密码破解,有望为治疗多种疾病开辟新途径
“伴侣系统”的发现,归功于糖蛋白组学和质谱分析,但研究人员希望其还能够回答25年来一直悬而未决的问题:“伴侣”如何知道7000种不同的蛋白质折叠哪些是正确的?此次研究给出的答案,涉及一种被称为UGGT的“内质网守门人”酶,以及一系列称为N-聚糖的碳水化合物标签,这些标签与蛋白质氨基酸序列中的特定位点相连。