Molecular Cancer | 揭示RNA甲基化如何影响肿瘤免疫:从机制到治疗

主要的RNA甲基化形式包括N1-甲基腺嘌呤(m1A)、N6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、N7-甲基鸟嘌呤(m7G)和3-甲基胞嘧啶(m3C),这表明它在塑造基因调控的复杂景观中具有广泛存在和重要意义。RNA甲基化由三类蛋白质介导:“写入者”催化甲基基团的添加;“读取者”识别这些修饰;“擦除者”去除这些修饰,每种蛋...

科学家在陨石中发现DNA和RNA的重要组成部分为有生源说提供支持

我们所知的生命遗传学是建立在DNA和RNA上的,它们由五个有机分子组成。它们被命名为腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶。而这些分子可以分成两类,即所谓的核碱基。一方面,有嘌呤。这类化合物包括鸟嘌呤和腺嘌呤,以前曾在撞击我们星球的陨石中发现过。但是,如果没有另一种核碱的存在,DNA和RNA就无法形成(...

Nature Bio | 突破性MOBE系统实现多重精准基因修复

本研究开发了一种多重正交碱基编辑系统(MOBE),该系统通过使用RNA适配体-外壳蛋白系统将DNA修饰酶直接招募到导向RNA,从而实现了腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器的正交多重化。MOBE系统能够在不同的原位上同时引入C·G到T·A和A·T到G·C的单核苷酸变异,具有较高的精确度和编辑效率。通过荧光富集策略,MOBE系统在多种细胞...

Nature Biotech背靠背 | 脱靶率极低,中外团队分别开发基于腺嘌呤...

胞嘧啶脱氨酶催化C转变为U的过程通常伴随着尿嘧啶的切除,形成的无嘌呤无嘧啶位点最终导致潜在的C到G/A副产物的形成,因此在CBE的基础上,通过对APOBEC1的改造等策略开发了主要实现C到G碱基颠换的CGBEs5-9。然而现有的CBEs/CGBEs均依赖于天然的胞嘧啶脱氨酶AID/APOBEC家族成员,由于胞嘧啶脱氨后会激活碱基切除...

为什么我们是由DNA组成 而不是RNA?

而RNA是一个单链螺旋,由较短的核甘酸链、一个磷酸盐骨干、核糖所组成,以及以腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶(uracil)为主要成分。但或许这两者之间最重要的差异,如同在Al-Hashimi的研究所展示,是DNA能够以一种方式来变形而RNA不能,造成DNA的适应力更强而且是更好的基因码储存处。特别地是,它与胡思町碱基...

Nature子刊:李大力团队开发精准高效的腺嘌呤颠换编辑器ACBE

目前,不依赖DNA双链断裂和模板参与的单碱基编辑器(baseeditors)是治疗遗传病强有力的基因编辑工具(www.e993.com)2024年11月16日。现有的碱基编辑技术CBE(C-to-T),CGBE(C-to-G),GBE(C-to-G/C-to-A)和ABE可实现胞嘧啶转换/颠换编辑以及腺嘌呤的转换突变,由于缺少切除肌苷的内源DNA糖苷酶,ABE的产物纯度可达99%。然而,仍有25%的人类...

日本团队新研究:陨石中首次发现核酸主要成分嘧啶碱基

碱基,作为核酸的结构成分之一,此前已在碳质球粒陨石(Carbonaceouschondrite)中被检测到。DNA和RNA中有两种类型的碱基,即嘧啶和嘌呤。其中嘧啶包括胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶,嘌呤包括鸟嘌呤、腺嘌呤。研究团队称,包括碱基在内的一系列外源陨石有机物,可能在后期重轰炸期(又名“月球灾难”,约40亿年前-38亿年前)...

多篇重要研究成果聚焦科学家们在RNA编辑研究领域取得的新进展!

7Science子刊:一种新型腺嘌呤碱基编辑器可让细胞RNA编辑最小化doi:10.1126/sciadv.aax5717在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所和哈佛大学的研究人员发现有证据表明使用碱基编辑器会导致细胞中出现意想不到的RNA编辑。相关研究结果发表在2019年5月8日的ScienceAdvances期刊上,论文标题为“Analysisandminimiz...

SWISS:Cas9 nickase和CRISPR RNA骨架介导的植物多重正交基因组...

SWISS利用两个含有不同RNA配体的RNAscaffold(scRNA)分别招募相应结合蛋白融合的胞嘧啶脱氨酶或腺嘌呤脱氨酶,同时在不同的靶位点分别实现CBE和ABE两种碱基编辑。再利用nCas9的切口酶活性,将成对的sgRNA引入到SWISS系统中,可以在第三个靶位点处产生DSB,使得SWISS成为具有三重(C-to-T、A-to-G和Knockout)编辑...

《科学》:“RNA世界”学说又出新证据

据生物探索网站今日(5月17日)报道,美国斯克利普斯研究所的化学家GeraldJoyce一直致力于与生命起源相关的化学研究,他和很多学者认为,生命开始之初的关键事件之一是RNA的合成。作为一种传递遗传信息、参与生化反应的长链状分子,RNA由四种不同的碱基组成:腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U)。那么,这些碱基...