实现蛋白质动态对接预测!上海交大/星药科技/中山大学等联合推出...
纵观其研究进程,AlphaFold的面世是一个里程碑式突破,能够预测单个蛋白质的空间三维结构,为研究蛋白质–配体相互作用提供了结构基础。但AlphaFold只能预测蛋白质在一个瞬间的静态结构,未能实现蛋白质结构动态变化的预测。当使用AlphaFold预测的无配体蛋白质结构作为对接进行输入时,所得到的配体位置预测往往与配体结合...
被质疑“不该拿物理学奖”的诺奖得主,一生经历却足够拍一部《奥本...
舒尔曼的贝尔实验室小组随后将研究重点从血红蛋白蛋白质转向了被称为转运核糖核酸(tRNA)的核酸,他们可以从核磁共振中确定分子二级结构的某些方面。由于缺乏将这些实验与功能问题联系起来的方法,我对该小组关于tRNA的实验失去了兴趣。然而,我确实参加了许多外部演讲者的研讨会,他们描述了tRNA的功能生物学方面,尽管对...
新技术助力蛋白质二级结构测定领域拓展
红外光谱可以通过测定蛋白质在不同波长下的吸收峰来推断其二级结构。不同的二级结构在红外光谱中表现为不同的吸收峰,通过分析这些吸收峰的位置和强度可以确定蛋白质的二级结构。2.3生物信息学方法生物信息学方法是一种利用计算机算法和统计学方法来预测蛋白质二级结构的方法。这些方法基于蛋白质序列的特征和统计学模...
蛋白质二级结构分析的高效实验步骤揭秘
生物信息学分析可以快速、高通量地预测蛋白质的二级结构,为实验设计和结果解读提供重要参考。结论蛋白质二级结构分析是揭示蛋白质结构和功能的重要手段。通过样品制备、圆二色谱测定、核磁共振、X射线晶体学和生物信息学分析等技术的综合应用,我们可以高效地揭示蛋白质的二级结构。这些分析方法的发展为蛋白质研究和药物...
...教授等:蛋白质-香气化合物结合作用的研究方法及影响因素研究进展
蛋白分子结合香气化合物前后的紫外-可见吸收光谱变化能够反映蛋白质的色氨酸和酪氨酸残基周围微环境的变化情况,从而可判断蛋白分子与香气化合物是否发生了结合作用。荧光猝灭光谱法常用于进一步研究蛋白质与香气化合物的结合模式,其中荧光强度能够反映蛋白质内部微环境亲水-疏水平衡的变化,进而结合Stern-Volmer方程对荧光数据...
.../肖奕团队开发基于深度学习的冷冻电镜RNA全原子结构建模方法
RNA作为遗传信息的载体,在蛋白质合成、基因调控、免疫调节等许多生命活动中发挥重要作用,“结构决定功能”,因此,确定RNA的三维结构对于理解其功能及相关药物开发至关重要(www.e993.com)2024年10月17日。作为被广泛用于解析生物大分子结构的冷冻电镜技术,除大量用于解析蛋白质结构外,也被用于解析RNA以及蛋白质-RNA复合物结构。对于实验获得的冷冻电镜密度...
AI在诺奖上杀疯了!对话专家:人工智能已成科研的第四范式
传统的蛋白质结构测定方法依赖于实验技术,如X射线晶体学和核磁共振(NMR)光谱,这些方法既耗时又昂贵。基于深度学习模型的AI技术,特别是AlphaFold3,能够从大量已知蛋白质结构数据中快速学习规律,其预测的蛋白质结构已达到原子精度。与其他基于量化计算及分子动力学模拟的蛋白质预测的预测方法相比,所占用的算力资源非常少,...
...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...
2024年5月8日,谷歌旗下公司DeepMind与IsomorphicLabs合作,在《自然》期刊发表论文,发布了蛋白质结构预测领域最新人工智能模型——AlphaFold3!这一AI模型能够准确预测蛋白质、DNA、RNA以及配体等所有生命分子的结构及其相互作用方式。这是继AlphaFold2之后的又一重大突破。
ABB 近红外光谱技术多领域应用最新进展研讨会圆满召开 ICNIRS2021...
报告题目:FTIR在蛋白质二级结构分析应用和FTIR红外光谱技术用细菌的快速分型宁波大学余绍宁教授通过“红外光谱对蛋白质二级结构的测定”和”红外光谱在微生物分型领域”两个视频介绍了FTIR的两种实验操作。报告专家:大连理工大学刘涛教授报告题目:基于近红外光谱实时检测生物发酵过程组分与干燥过程脱水量预测大连理工...
《Science》子刊:超分子聚合物也可以像蛋白质一样自折叠
在过去的几十年中,科学家们利用超分子聚合方法制备了具有多种刺激响应特性和功能的一维纳米材料。通过近十年对于超分子形成动力学的深入研究,研究人员已经可以成功制备链长和分子量分布可控的超分子聚合物。然而,目前的超分子聚合物在高阶拓扑结构的复杂性方面仍远远落后于生物大分子,例如蛋白质,其独特高阶拓扑结构是...