Nat Commun 丨原佳沛/张蔷/杨扬团队揭示基因启动子选择调控新机制
启动子在基因的转录起始过程中扮演着关键角色。在人类基因组中,蛋白编码基因通常拥有多个启动子,选择不同的启动子会产生不同的转录本1。启动子选择的失衡与多种组织发育异常及疾病的发生密切相关。尽管已有研究表明遗传变异位点能够影响可变启动子的选择,并在有限的组织类型中鉴定了相关的性状位点(PromoterusageQT...
蓝鸟坠落!7名接受Bluebird bio基因疗法的儿童患上血癌
Skysona的慢病毒载体设计中包含了一个病毒启动子,目的是促进基因的强烈表达。然而,这种启动子的一个潜在风险是可能诱发癌症。Bluebirdbio还正在销售另外两种基因疗法:一种名为Zynteglo,用于治疗重度β地中海贫血;另一种名为Lyfgenia,用于治疗镰状细胞病。这两种疗法使用了不同的慢病毒载体,含有不同的启动子。2023...
MGMT基因启动子甲基化,为啥好多癌症都在关注它?
《NCCN临床实践指南(2024版)》指出,MGMT基因启动子甲基化是所有高级别脑胶质瘤(III级和IV级)分子诊断的重要部分,是脑胶质瘤患者预后的独立预测因子。MGMT启动子甲基化预测胶质母细胞瘤的生存优势,并用于临床研究中的风险分层。相比未发生MGMT甲基化的胶质母细胞瘤,发生MGMT甲基化的患者从替莫唑胺中的获益可能更大[2...
第四证!圣湘生物药物基因组学领域又双叒叕上新
VKORC1是编码维生素K环氧化物还原酶复合体1的基因,该基因存在大量多态性位点,其中启动子区1639位置G>A单核苷酸多态性(SNPs)位点突变构成AA、AG、GG3种基因型,GG型属于野生型,AG、AA型属于突变型,VKORC1基因型不同,其编码的VKORC1表达水平则不同。VKORC1基因的多态性检测可辅助华法林确定给药剂量。最新研...
张锋最新Science论文:发现“隐藏基因”,揭开全新遗传调控方式
一种解释是,有毒基因的表达难以控制,其转录泄漏会导致不良后果,这被认为是编码毒素的防御系统在短的进化时间尺度内往往经常丢失的原因。在DRT2系统中,转录泄漏引起的自身免疫问题得到了解决,因为单个重复序列不包含启动子并且本身无毒。另一种解释是,裂解性噬菌体在感染早期往往会降解宿主的基因组,部分原因是为了关闭...
Nature子刊:曾朝阳/熊炜/龚朝建团队揭示HPV病毒编码circRNA,促进...
Galectin-9还可以结合T细胞表面PD-1抑制T细胞凋亡;circE7下调Galectin-9,导致CD8+T功能和活性受到抑制;circE7下调LGALS9表达的具体分子机制是,circE7结合并抑制乙酰辅酶A羧化酶1(acetyl-CoAcarboxylase1,ACC1)的磷酸化和激活,降低细胞内乙酰辅酶A水平,导致LGALS9基因的启动子区域H3K27乙酰化水平降低,通过表观...
专家点评Cell Metab | 黄志锋/宋林涛/李校堃团队发现胆汁淤积症...
进一步机制研究发现,FXR-FGF4的这种以肝脏为中心的作用是通过一个从未被报道的FGFR4-LRH-1信号传递途径介导的:当FGF4激活FGFR4后,细胞质中的核受体LRH-1被招募到FGFR4激酶区域,导致通过磷酸化介导的LRH-1失活并失去对Cyp7a1和Cyp8b1基因启动子的靶向作用。重要的是,研究团队于小鼠中发现的...
至善唯新rAAV基因药物临床研究启动,治疗法布雷病
该产品的基因表达盒框架搭载了该公司自主研发的肝脏特异启动子和基因工程改造优化后的α-半乳糖苷酶A基因,保证α-半乳糖苷酶A蛋白在肝脏细胞中特异表达并高效分泌,提高了药物的安全性与有效性。此外,至善唯新还选择了能够覆盖绝大部分患者的AAV载体血清型。
通过对拟南芥基因表达的研究,揭示其他各类生物体的生存进化规律
比如说,在大肠杆菌和酵母菌里,一些启动子结构、平均特异表达水平和功能属性基因组间的“噪声”及“可塑性”,显示出更强的关联性。所以,科研人员觉得对基因里这种“噪音”和“可塑性”之间的相关性进行研究,可以帮助我们了解各种生物体的生存策略。近期有研究以花生酵母菌和大肠杆菌为对象,确定了单细胞生物体中...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
富集5??端RNA(7-methylguanosine5??-cappedRNA)的测序的方法常用来鉴定启动子和转录起始位点(TSSs),可以做为DGE分析的补充。有多种方法都可以实现这个操作,但很少作为常规使用。在CAGE(capanalysisofgeneexpression)和RAMPAGE(RNAannotationandmappingofpromotersforanalysisofgeneexpression)...