《食品科学》:齐鲁工业大学赵祥颖研究员等:组学技术研究裂殖壶菌...

2001年Metz等已经通过对Schizochytrium的cDNA进行测序鉴定,得到3个编码PUFA合成酶的开放阅读框(orf),共含有11个结构域(图4),随后HuFan等也在Schizochytriumsp.TIO01基因组中发现了3个不含内含子的巨大基因,编码PUFA合成酶的3个亚基(A、B和C)(NCBI中的LOCUS号分别为AF378327、AF378328、AF378329),这类似...

动物样本lncRNA测序方案-启衡星哺乳动物通用型rRNA去除试剂盒

LncRNA作为RNA三宝(miRNA、lncRNA和circRNA)之一,包括PolI,PolII和PolIII转录的RNA,以及来自加工过的内含子的RNA。大多数lncRNA比蛋白质编码序列进化得更快是一类长度超过200nt的非编码RNA分子,因其缺少有效开放阅读框而很少编码或不能编码蛋白质。科学家们已经在人类和其他哺乳动物的基因组中鉴定了许多长...

【云飞杂记】真菌传之基因组

云飞:在分子生物学中,开放阅读框是开始于起始密码子,结束于终止密码子,连续的碱基序列,是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列。健客:内含子是什么意思?云飞:内含子是基因中在编码RNA剪切后切除的部分。与之对应的是外显子,是基因中在编码RNA剪切后保留的部分,绝大部分的外显子为编码序列。健客:今天太难啦!

专访清华大学刘俊杰:为基因编辑做减法,无需蛋白质的基于RNA核酶的...

此前有研究发现,存在天然的缺乏开放阅读框(ORF)的GII内含子,它们被认为是GII内含子的“退化和无功能后代”,并且缺乏表征。迄今为止,广泛使用的GII内含子数据库仅列出了42个经生物信息学分析确定的缺乏ORF的GII-A和GII-B,尚未报道缺乏ORF的GII-C内含子。刘俊杰团队对公开可用的细菌基因组序列进行初步筛选,发现许多...

Science | 清华大学刘俊杰团队开发基于RNA核酶的基因编辑工具

GII内含子通常由六个结构域组成。最大的结构域I(DI)通过与外显子结合位点(EBS)的碱基配对促进RNA外显子识别。结构域II和III(DII和DIII)是结构基序,维持稳定的核酶结构。结构域IV(DIV)通常包含一个编码内含子编码蛋白(IEP)的开放阅读框(ORF),其中包含DNA内切酶(EN)和逆转录酶(RT)结构域。形成RNA剪接核心...

上海科技大学李磊团队发现渐冻症突变基因调节DNA损伤修复

肌萎缩侧索硬化症(ALS,也称为渐冻症)是一种快速进行性神经退行疾病,累及上下运动神经元(www.e993.com)2024年12月20日。患者最初表现为肌肉无力、运动障碍,最后死于呼吸衰竭,目前尚无有效的治疗方法。ALS最常见的致病因素为9号染色体开放阅读框72(C9orf72)基因内含子1中的GGGGCC六核苷酸重复扩增增多,相关疾病已被命名为C9ALS。目前对于该蛋白功能...