2024 诺贝尔化学奖:AI 助力生命科学
尽管自然界中存在超过500种氨基酸,但最为重要的是构成蛋白质的22种蛋白原性氨基酸,它们也是生命遗传密码中的关键组成部分。氨基酸可根据核心结构中官能团的位置进行分类(如α-、β-、γ-氨基酸等);也可以依据极性、电离性及侧链基团类型(如脂肪族、非环状、芳香族、极性等)进行划分。在蛋白质中,氨基酸残基...
浙大重磅科研成果,又上新了!
在64种原有的密码子中,61种有义密码子肩负着合成氨基酸的任务,3种终止密码子用于合成进程的终止。61种的有义密码子理论上不能用于编码非天然氨基酸,过去的科研团队一直处于“灯下黑”,在3种终止密码子中寻找突破,是领域内的共识,但这一研究思路始终存在着关键瓶颈……部分科学家尝试采用四联密码子、非天然碱基...
美议员提出组建太空国民警卫队的两党法案
据ScienceAI公众号3月4日消息,英国牛津大学科研团队开发出基于密码子训练的语言模型CaLM。该模型基于密码子序列上与训练的蛋白质语言模型,可产生能够捕获关键生化特征的信息丰富的蛋白质表征,在物种识别、蛋白质和转录本风度预测等任务中的表现相较基于氨基酸序列训练的语言模型具有显著优势。该研究提供了更简单的模型架构...
新型氨基酸激发新药和新疗法:Jason Chin瞄准复杂生物制剂
在蛋白质合成过程中,DNA或mRNA序列被以三个核苷酸为一组的密码子翻译为氨基酸序列。若能改变密码子、转运RNA和氨基酸之间既定的对应关系,势必会出现22种氨基酸以外的非规范氨基酸(ncAA),进而产生新功能的肽、蛋白质和聚合物,衍生出一系列新药和新疗法。近年来,JasonChin和GeorgeChurch两位合成生物学大牛...
更大的遗传密码子更好吗?准备好找出答案
即使是具有两个字母相同的不同氨基酸的密码子,它们通常会翻译成具有关键化学性质相似的氨基酸。因此,发生常见的遗传编码错误时蛋白质也大多可以正确折叠,并维持正常功能。包括Freeland在内的研究人员进行的模拟计算实验已经对比了自然界中真实的遗传密码子与可能的替代方案(密码子任意分配给氨基酸)的相关性质。
《周易·神农图》传奇之五:遗传密码是按照神农六十四卦设计的吗
而丝氨酸(S)的六个密码子分占的两个位置显然是左右对称的(www.e993.com)2024年10月29日。它们这些特定的位置关系,跟其碱基字母组合上的相应关系平行一致,反映了这三种氨基酸选用密码子虽然是“超计划的”(超出了四个,在二十种氨基中密码子最多),但仍然是按照一定的原则来的,并不是随机的。除此之外的同义密码则全部是集中于一处分布(就连三...
深度综述:RNA m5C修饰的生物学及在肿瘤发生和免
除C48外,C38是反密码子环中另一个频繁甲基化位点。研究表明小鼠tRNA-Asp中C38甲基化可促进多个Asp蛋白翻译,在天门冬氨酸密码子解码过程中,tRNA-Met的m5C38丢失导致翻译保真度降低。同时DNMT2介导的m5C38tRNA-Asp可以区分同源和近同源密码子,如不同的tRNA-Asp和tRNA-glu可以避免氨基酸的假阳性率,提高翻译准确性...
特别关注|突变型KRAS在胰腺导管腺癌代谢中的作用
KRAS基因第12位密码子上的激活点突变是大部分胰腺癌病例(70%~95%)的起始事件,其中KRASG12D较为常见。KRAS的点突变破坏了RAS的内在GTP酶活性,使GTP酶活化蛋白(GAP)失去对GTP的失活作用(即促进GTP向GDP转化),因此KRAS蛋白与GTP永久结合,持续激活下游信号通路,维持细胞存活和增殖[10](图1)。
口服即能控制血糖,应用后或将提升糖尿病患者的生活质量
在翻译过程中,对应于不同密码子的tRNA携带着相应的氨基酸,通过核糖体将一个个氨基酸连接而成形成肽链。当遇到终止密码子时,因为没有相应的氨酰-tRNA,翻译过程也就终止了。这些tRNA携带相应氨基酸的过程,是由相应氨酰-tRNA合成酶(aaRS)完成的。GCE技术通过在目的基因内部引入终止密码子,并在细胞内外源引入对应...