为避免同类相食,大自然设定了一个障碍:朊病毒?它究竟是什么?
大多数人听到“病毒”这个词,脑海里立刻就浮现出流感病毒、艾滋病毒或者新冠病毒,它们有基因,有自己的DNA或RNA,会侵入细胞、劫持系统,然后疯狂复制自己。但是,朊病毒却“不走寻常路”。它根本没有DNA或RNA这种遗传物质,就是一种蛋白质。正常情况下,人体内的蛋白质都会按照特定的方式折叠,形成稳定的结构,去执行它们...
超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
它们由蛋白质、DNA及其他分子组成,只有通过观察它们在这无数种组合中的相互作用,我们才能开始真正理解生命过程。了解我们体内的生物分子世界,以及我们细胞内复杂的分子网络如何相互作用,是理解疾病和理性设计药物治疗疾病的关键起点。2020年,谷歌旗下公司DeepMind推出了基于人工智能(AI)的蛋白质结构预测工具——AlphaFold...
疫苗前沿 | 甲型流感病毒的反向疫苗学:从基因组测序到疫苗设计
甲型流感病毒是一种RNA病毒,其主要结构成分是血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)蛋白。甲型流感病毒具有进化的能力,产生几种不同的变种,甚至更具传染性和毒性,因此更难以对比。应用工作流程鉴定潜在的抗甲型流感病毒多表位疫苗的第一步是从国家生物技术信息中心数据库收集的HA和NA蛋白序列。3.3.多序列比对需要对选定...
低调又迷人,它完成了DNA和蛋白质都无法做到的事 | 西湖大学付向东...
因为蛋白质没有储存遗传信息的功能,DNA没有表达遗传信息的功能,所以说大家就认为,大概这个世界最开始是从RNA开始的。黄雨佳:对对对。但是就像您刚刚提到的,酶催化可能只是RNA功能的一个方面,但现在大家对RNA功能的认知大概有哪些方面呢?付向东:对,我接着刚才的说。就是说从RNA的催化,大家很快就过渡到RNA的加...
新研究发现,3000万年感染人类的病毒,要为今天人类的癌症负责
我们的基因组中至少有5%到8%是远古病毒的残留片段,另外有40%由重复的遗传字母串组成,一些研究人员认为这些字母串也源自病毒。当病毒拜访我们时,它们有时就会留下自己的部分基因片段,这种水平基因转移方式在自然界中普遍发生,如果运气好的话,这些基因片段就会被遗传给下一代,如果运气爆表的话,它就可以代代...
诺贝尔化学奖也花落AI领域!刚刚,AlphaFold开发者等人获奖 | 深度...
相比于预测蛋白质的结构,从头设计出一个蛋白质需要向弄清蛋白质折叠的原理再迈进一步(www.e993.com)2024年11月10日。这要求科学家们能根据一个具有特定形状的蛋白,倒推出其DNA序列。从某种意义上讲,从头设计蛋白,要比预测蛋白结构难上几个数量级。假设要设计一个由100个氨基酸组成的蛋白质,每一种氨基酸又有20种截然不同的可能,使将得可能的...
专访博德研究所计算科学家邵斌:用DNA语言模型破译和设计生命丨...
未来百科:像DavidBaker实验室从头设计和生成新的蛋白质,你们的MegaDNA的系统则是生成DNA,DNA碱基只有4种,远小于组成蛋白质的氨基酸种类,从头生成DNA序列和生成蛋白质序列之间在难度上有什么分别?用MegaDNA模型生成DNA序列对未来设计、改造、优化或工程化蛋白有哪些帮助?
两个圈外人的前卫实验,引发了一场不凡俗的科学革命
马特伊和尼伦伯格为这一结果给出了一种正确的解释:完好无损的RNA的存在是蛋白质合成的必要条件,而DNA酶造成的抑制是因为“DNA遭到了破坏,导致其无法再承担模板RNA的合成模板这一功能”。第二篇论文的标题很含混——《大肠杆菌无细胞蛋白质合成对天然或人工合成多聚核糖核苷酸的依赖性》(TheDependenceofCell-...
Science:细菌能够在基因组外从头生成新基因,以对抗病毒感染_澎湃...
具体来说,一种存在于细菌中的逆转录酶将非编码RNA作为模板来读取,从头生成新基因。然后,这一基因重新转录成RNA,当细菌被病毒感染时,RNA被翻译成保护性蛋白。相比之下,病毒的逆转录酶并不会产生新基因,它们只是简单地将将RNA逆转录为DNA。这项研究强调了细菌逆转录酶以RNA为模板创造新基因的基因组编码潜力,是对...
【云飞杂记】真菌传之感染
健客:又提到“开放阅读框”,DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列。云飞:嗯,不错。健客:CTG分别是胞嘧啶、胸腺嘧啶和鸟嘌呤,这讲过,但是三联体密码是什么意思?云飞:哈哈,蛋白质由氨基酸组成。健客:嗯,在《细菌传》中讲过,20多种氨基酸嘛,丝氨酸和亮氨酸位列其中。