Nat Chem:陈加余团队系统揭示三链体DNA互作蛋白调控机制与功能...
利用该探针,作者在HeLa和A549细胞系中开展了化学蛋白质组学研究,特异性捕获并通过定量质谱成功鉴定了78个高置信度的三链体DNA互作蛋白,为理解三链体DNA的动态调控机制奠定了坚实基础。随后,作者通过多组学数据(ChIP-seq,CUT&Tag,S1-END-seq等)的联合分析揭示了这些调控蛋白的分子调控机制及潜在生物学功能。作者对...
打开蛋白质互作谜题的大门:质谱技术助力寻找互作蛋白
免疫共沉淀-质谱技术结合了免疫共沉淀和质谱分析两种方法,可以帮助鉴定和鉴定蛋白质之间的相互作用。通过选择性地免疫共沉淀目标蛋白质,并结合质谱分析技术,可以鉴定与目标蛋白质相互作用的潜在结合伴侣。2.亲和纯化-质谱(AP-MS):亲和纯化-质谱技术利用特定结合剂(如抗体或亲和标记)将目标蛋白质与其相互作用的蛋白质...
蛋白质互作质谱分析:从样本到结果的全面质谱分析蛋白
蛋白质互作质谱分析是一种利用质谱技术研究蛋白质相互作用的方法。质谱技术是一种通过测量蛋白质分子的质量和荷电量来确定其结构和性质的方法。蛋白质互作质谱分析则是在质谱技术的基础上,通过分析蛋白质之间的相互作用来揭示它们在细胞内的功能和调控机制。二、蛋白质互作质谱分析的步骤蛋白质互作质谱分析通常包括以下...
【干货分享】免疫共沉淀CoIP实验详细方法步骤
本次实验的目的是使用CoIP-MS或者CoIP-WB的方法,通过在目的细胞中运用针对目标蛋白的抗体把相应的蛋白-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化并对结合在复合物上的蛋白进行MS或WB分析寻找目标蛋白相互作用的蛋白,或在不同遗传背景或处理条件下的互作变化。广州基云生物拥有经验丰富的技术团队,提供专业的研究方案、严格项目质...
Trends in Biotechnology:质谱技术解析染色质互作蛋白网络
导读:论文概述了研究染色质互作蛋白的最新质谱方法,并对这些方法在植物生物学中的应用进行了深入讨论,提出了有效的分析策略。近日,TrendsinBiotechnology(IF19.51)在线发表了中国农业大学植物生理与生化重点实验室陈艳梅老师的题为“Dissectingtheplantchromatininteractomeusingmassspectrometry”的综述文章,并入...
iTRAQ、TMT分析蛋白互作
目前分析蛋白相互作用的技术有很多,如免疫沉淀(IP)、免疫共沉淀(Co-IP)、Pulldown、GSTpulldown、标记转移法和交联法等,此外SILAC技术也可以与免疫共沉淀技术结合用于蛋白相互作用分析(www.e993.com)2024年9月7日。百泰派克生物科技采用Thermo公司最新推出的ObitrapFusionLumos质谱仪结合Nano-LC,提供基于iTRAQ/TMT的定量蛋白质分析服务...
化学蛋白质组学揭示高铁血红素-蛋白互作谱
最近的研究也证实了高铁血红素可以作为一种信号分子,通过与伴侣蛋白质结合而不是通过其金属中心反应来发挥其作用。然而,目前关于血红素结合蛋白的注释还不够完整。因此,本文采用化学蛋白质组学的方法去揭示人体中与高铁血红素发生互作的蛋白质谱。化学蛋白质组学是揭示蛋白质功能和发现药物靶标的重要工具。其中,最常用的...
Cell:全面绘制小鼠多器官蛋白互作组图谱
因此,现有的互作组图谱尚不能很好的分析发生在特定细胞类型或组织或病理生理学相关条件下的互作组。在组织或细胞类型特异性背景下的靶向互作组定位揭示了某些人类疾病中蛋白质互作的重排,但是关于哺乳动物组织间的互作组仍然不清晰。2021年7月1日,不列颠哥伦比亚大学研究团队在国际顶尖学术期刊Cell发表了题为:An...
鸿篇巨作:蛋白互作图谱一次筛选出新冠病毒66个潜在靶点、69种潜在...
此项研究在人类细胞中克隆、标记和表达了26种SARS-CoV-2的蛋白,并通过亲和纯化质谱(AP-MS)鉴定出332种高度可信的SARS-CoV-2与人的蛋白-蛋白相互作用(PPIs)。更重要的是,研究人员从中确定了66种可用药潜在靶点,有69个已上市、临床和临床前阶段的药物可以作用于这66个靶点,有助于现有潜在药物的再利用。
小分子-膜蛋白质互作界面和结构调控分析研究获进展
在此工作的基础上,王方军等人进一步实现了基于定量赖氨酸反应性变化的蛋白受体结构调节机制质谱分析,对小分子配体托卡朋和儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT),以及Ro25-6981,Gavestinel,UBP710和膜蛋白受体NMDARs的相互作用分子机制进行了系统研究,证明了该方法不仅可以发现小分子与蛋白质的直接作用区域,还可以监测蛋白质产生了...