领创北京 | 武装蛋白|细胞|刘涛|免疫|蛋白质|氨基酸_网易订阅
所有的密码子组合中,有三种是特殊的,它们叫作终止密码子。就像“此路不通”标志一样,当“建筑师”读到这三个密码子时,就会知道蛋白质的合成已经结束,可以停止工作了。“我们的基因密码子扩展技术,就是通过对寄主细胞进行改造,让终止密码子来编码人工合成的非天然氨基酸。”刘涛解释。改造后,“建筑师”遇到“此路...
...器团队通过近同源tRNA提升伪尿苷介导的早终止密码子读通效率与...
此外,考虑到有义到无义密码子的自然发生频率,RESTARTv3能够准确地结合近一半PTC位点的原始氨基酸,而不影响正常终止密码子。虽然检测到脱靶位点,但没有观察到编码信息或转录本表达水平的变化,总体天然tRNA丰度保持不变。无义突变是在mRNA编码区产生过早终止密码子(PTCs)的单碱基突变,导致截断的无功能蛋白质。最近的...
合成生物学让“吃饼干治糖尿病”成为可能
论文通讯作者之一、华东师范大学生命学院研究员叶海峰解释,生物体内有3个不编码氨基酸的密码子(也叫终止子,其功能是终止蛋白质翻译),通过人为改造可以让其中一个只听“饼干”的命令。于是,改造过的密码子就有了双重身份——饼干里特殊的人工氨基酸一来,密码子配对,开启胰岛素的翻译过程,特殊的人工氨基酸一走,密码子...
Nature子刊:伊成器课题组开发升级版不依赖CRISPR的RNA编辑技术
无义突变是发生在mRNA编码区上的突变,这种突变会导致提前终止密码子(PrematureTerminationCodon,PTC)的产生,最终导致蛋白产物截短和功能缺失,这在人类疾病相关的单碱基突变中占比约20%。2024年3月6日,北京大学伊成器课题组在NatureBiotechnology期刊发表了题为
iMeta | 高被引分子系统发育树分析教程PhyloSuite_腾讯新闻
1.4.3.密码表:在“CodeTable”的下拉菜单中选择与数据匹配的密码表,以正确识别终止密码子和正确翻译基因序列。Gyrodactylidea的线粒体基因组使用第9套密码表(棘皮动物和扁形动物门线粒体密码表)。1.4.4.统一基因别名。提取功能主要通过基因名称来识别同源基因,但同一基因通常在不同数据集中以不同的名称注释:...
终止密码子重置新策略
介于真核生物普遍存在无义密码介导的降解途径,可清除带有提前终止密码子的mRNA10,作者推测锥虫科进化早期丢失该通路中两种关键组分UPF1和UPF2,可能成为允许终止子重置的关键前提(www.e993.com)2024年10月21日。利用重新开发的注释算法,作者发现在蛋白编码基因内部出现的重置终止子与相关蛋白的含量呈负相关:即当蛋白表达水平低时,其编码框中...
...世界上首次开发出抑制性tRNA疗法,有望治疗由过早终止密码子...
Gao博士解释道,“所有遗传病中约有11%是由导致过早终止密码子的单一核苷酸突变引起的。也许有可能设计一种治疗平台,该平台利用抑制性tRNA疗法来治疗其他因过早停止密码子出现而形成的疾病。这包括某些类型的囊性纤维化和肌肉萎缩症。”Wang博士和Gao博士及其同事们开发了一种抑制性tRNA,它允许核糖体跳过这些过早终止...
QB期刊 | 前沿研究:末端核苷酸影响终止密码子的通读速率
在SCR事件中,释放因子eRF1没有识别终止密码子,而是在核糖体A位点中容纳了一个近同源的tRNA,并将一个新的氨基酸结合到多肽链中。在这种方式下,释放因子eRF1和终止密码子3个位置中的2个近同源tRNA之间的竞争决定了蛋白质合成终止过程的效率。事实上,已知UGA的保真性最低,UAG是比较可靠的终止密码子,UAA则是具有最...
短tRNA反密码子茎和突变体eRF1允许终止密码子重新分配
研究人员发现在这个物种中,框内终止密码子在高水平表达的基因中代表性不足,UAA作为唯一的终止密码子。与UAG和UAA完全同源的新tRNAGlu的演化是为了重新分配这些终止密码子,而UGA的重新分配则是通过将tRNATrpCCA的反密码子茎从5个碱基对缩短到4个碱基对(bp)的不同路径。常规5个碱基对的tRNATrp按照遗传密码的规定...
Nature | 一种全新的可在不相关物种中实现终止密码子重置的分子机制
总结全文,作者报道了一种全新的可在不相关物种中实现终止密码子重置的分子机制。作者发现一种新发现的锥虫基因组中存在终止密码子重置现象,其UAG和UGA出现在基因读码框内部,编码谷氨酸和色氨酸,而仅有UAA作为真正的终止密码子。其基因组编码两种tRNAGlu反密码子可完全识别UAG和UAA,实现对两种终止子的重置。对UGA编码...