Nat Methods丨scNanoSeq-CUT&Tag技术:可精准检测单细胞基因组复杂...

尤其是基因组中的重复序列区域(在人类基因组中占52%,约1.56Gb;在小鼠基因组中占45%,约1.2Gb)、“黑名单”区域(在人类基因组中占3.0%,约91Mb(不包括着丝粒区域和rDNA区域);在小鼠基因组中占7.0%,约191Mb)以及基因组结构变异区域(如长片段插入或缺失、串联重复...

...团队挖掘到负责极低直链淀粉合成、提高稻米品质的Wx新等位基因

目前在水稻自然群体中已报道的Wx等位基因有Wxlv、Wxa、Wxin、Wxb、Wxmw/la、Wxop/hp、Wxmp和wx,它们的差异碱基表现在第1内含子和第2、4、6和10外显子上,通过影响GBSSI的含量和GT5结构域来负责不同含量直链淀粉的合成,调控稻米蒸煮食味品质。为精细调控稻米品质,近年来一些团队利用基因编辑技术创制了一些Wx优异...

进化史上最幸运的8项基因突变

人有一对等位基因,携带一个ALDH2*2基因的人(杂合子),酶活性只有正常的6%左右;而两个基因全是ALDH2*2的人,酶活性几乎为零。对于后者来说,喝酒几乎是一杯倒的事情,因此这部分人一般滴酒不沾。容易出问题的是杂合子,这部分人也是最危险的饮酒者,虽然乙醛对他们的伤害很大,但由于体内仍然有一点酶活性,因此...

《基因彩票》第十二章:反优生主义的科学和政策

只要有可能,基因组盲的立场就会致力于逃避知识,主张科学家不应该研究遗传差异或它们与社会不平等的联系,社会上的其他人也不应该将该研究产生的任何科学信息用于任何实际目的。上面两种立场与我提出的反优生主义立场形成了对比。反优生主义立场并不反对人们获取遗传学知识,而主张有意识地以减少自由、资源和福利分配不平等...

科创前沿 | 基因工程更加精准编辑生物体

基因工程技术为基因的结构和功能研究提供了有力手段,能够跨越生物种属之间不可逾越的鸿沟,打破常规育种难以突破的物种界限,开辟了在短时间内改造生物遗传特性的新领域。“剪切和粘贴”的基因编辑基因编辑是怎么回事?顾颖表示,该技术是通过对碱基序列进行精准的插入、缺失或其他类型的突变,调整目标基因的功能和表达量,...

未来基因编辑技术:超越边界,共创人类繁荣

然而，由于碱基编辑的局限性——特别是它无法将胸腺嘧啶转化为腺嘌呤——恢复野生型等位基因是不可能的(www.e993.com)2024年11月12日。Prime编辑的出现是应对这一挑战的解决方案。通过有效纠正突变并恢复基因的健康版本，primeedit在小鼠中表现出了显着的功效。同样，研究人员最近也利用CRISPR-Cas9技术在小鼠肺部进行基因编辑。这在以前一直是一个...

PCR反应的几大要素(各组分和条件)

引物的GC含量最好在40-60%之间,均匀的C和G分布能够避免错误发生。同样,为了尽量减少非特异性,引物3′端最多只能含有3个G或C碱基。另一方面,引物3′端含有1个C或G核苷酸有利于引物的锚定和延伸。表1.PCR引物设计的一般建议可以不可以●长度为15–30nt...

动脉粥样硬化中的DNA甲基化和组蛋白修饰及其表观遗传治疗视角

健康个体基因启动子区的CpG岛通常低甲基化,而非启动子区CpG岛则高甲基化。全基因组DNA低甲基化发生在非启动子区域,可导致在非准确区域转录启动和通常沉默位点的高转录活性。另一方面,整体DNA高甲基化通常会抑制表达、基因突变和等位基因丢失。在正常生理条件下,DNMTs和TETs协同维持DNA甲基化和去甲基化的平衡。研究表明...

重医谢国明教授:DNA检测新策略,探索癌症早筛密码

近日,重庆医科大学检验医学院谢国明教授团队提出了两种策略富集活性双链DNA,包括基于阻碍基团和可切割单元的PCR,并直接用于检测活性双链DNA中的SNVs。这一方法避免了传统PCR后处理步骤的复杂性和信息丢失风险,能够实现低至0.1%的变异等位基因频率(VAF)的检测。该研究发表在ACSNano(IF:17.1)。

Cancer Cell:顾伟/刘彦卿等2万字长文综述全面总结p53领域研究进展

p53的缺失,包括失杂合性(LOH)和双等位基因失活或缺失,会促进基因组不稳定并驱动肿瘤细胞基因组的进化。p53被誉为“基因组的守护者”。p53可以直接促进DNA伤修复。事实上,许多p53靶基因有助于DNA修复过程。然而,目前仍不清楚p53介导的这些DNA修复相关靶基因的激活是否足以独立于其他p53功能从而抑制肿瘤发生。