计算机如何辅助抗病毒药物研发?为特效药物研发赢得宝贵时间
目前,研究人员已从新型冠状病毒(2019-nCoV)中分离出orf1ab,S,E,M,N等10条基因组序列,各自编码相应的病毒蛋白。通过与同为冠状病毒的SARS病毒类比,我们可以合理地推测出新型冠状病毒基因编码的各类蛋白质的功能。举例来讲,如,orf1ab基因编码orf1ab多聚蛋白,参与病毒RNA的转录与复制,并具有蛋白酶、甲基转移酶等...
Cell:重磅!首次绘制出酵母基因组编码蛋白在完整细胞周期中的精密...
在一项新的研究中,来自加拿大多伦多大学等研究机构的研究人员成功绘制出酵母基因组编码蛋白在完整细胞周期中的精密运动与分布图谱。这是首次运用深度学习与高通量显微镜技术,对有机体的所有蛋白质在整个细胞周期中的行为进行全面追踪。相关研究结果近期发表在Cell期刊上,论文标题为“Proteome-scalemovementsandcompartment...
J Virol. | CP204L作为非洲猪瘟病毒的一个多功能蛋白,与同型融合...
CP204L基因在所有ASFV分离株中是保守的,并编码病毒复制所必需的高抗原性病毒蛋白。CP204L蛋白,也称为P30或P32,是感染早期合成的最丰富的病毒蛋白之一。在感染的细胞中,CP204L主要定位于细胞质中,但也在细胞核和质膜中少量存在。据报道,核CP204L与异质核核糖核蛋白K(hnRNP-K)相互作用。最近一项研究...
艾滋病病毒遗传物质序列
艾滋病病毒遗传物质序列核心提示:艾滋病病毒的遗传物质是RNA,主要通过编码蛋白质来影响宿主细胞的功能和生命周期。艾滋病病毒的遗传物质是RNA,主要通过编码蛋白质来影响宿主细胞的功能和生命周期。艾滋病病毒感染后,由于其RNA基因组变异迅速,使得免疫系统难以识别并攻击感染细胞。病毒进入宿主细胞后,利用逆转录酶将自身...
「耀文解读」一文读懂|非洲猪瘟病毒(ASFV)疫苗研究进展
病毒基因组长度在170-190kb,可编码150-200个病毒蛋白,包括68个结构蛋白和100多个非结构蛋白。ASFV形态发生在高尔基体和微管组织中心附近的核周病毒工厂,病毒组装的第一个迹象是从内质网池中形成病毒膜前体,衣壳逐渐组装后,这种病毒膜前体成为多面体中间体。随着衣壳的形成,病毒核心在病毒的内膜下组装,然后细胞内的...
细胞与病毒的战争:揭秘病毒如何感染你的身体
一旦成功侵入宿主细胞,病毒就开始进行复制(www.e993.com)2024年9月20日。病毒会利用细胞内的生化机制来合成新的病毒成分,并组装成完整的病毒颗粒。病毒基因组中所编码的酶会操纵宿主细胞的蛋白质合成机制,使细胞开始合成病毒的蛋白质和核酸。这些新产生的病毒成分随后会组装成病毒颗粒,并释放出来感染其他细胞。
Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...
我们总共从89,412个细菌基因组、9,202个病毒基因组、3,073个古细菌基因组和804个真核基因组中提取了所有蛋白质序列,最终得到了94,672,003条序列的数据集。本研究中的参考基因组只包括分离基因组,不包括MAG或单扩增基因组。同样,对于未分箱的宏基因组,我们从26,931个数据集(20,759个宏...
推荐阅读 | 太难了!抗病毒药物开发为何这么难?
研究人员假设,被劫持的细胞只是利用细胞自身的酶和蛋白质构建了病毒的新副本。1967年,科学家发现了第一种病毒酶,一种痘病毒DNA-依赖型RNA聚合酶[1]。该酶采用病毒的DNA编码基因组并将其转录为RNA,以开始生产新的病毒蛋白。在科学家确定了这些第一种病毒酶之后,他们就意识到他们可以设计针对病毒本身的药物,但这个...
独家原创 | 龙思会教授、余文颖研究员:新型冠状病毒感染治疗药物...
nsp13是由病毒基因组编码的具备5'-3'定向解旋酶、ATP酶和RNA5'-三磷酸酶活性[39]的多功能蛋白质,其与其他nsp协同组装成复制转录复合物,从而参与病毒RNA的复制与转录[40-43],是病毒基因组复制与转录的关键[44];另外,nsp13还具备高度保守的特点,SARS-CoV和SARS-CoV-2的nsp13之间只有单一的氨基酸差异,故其被...
...农业大学周艳荣课题组揭示PRRSV通过选择性自噬逃避宿主抗病毒...
结果显示,在所有测试时间点,DDX10的异位表达显著下调了病毒基因组RNA的拷贝数(图2A)、PRRSVN蛋白的表达水平(图2B)和TCID50(图2C)。通过使用siRNA研究了DDX10敲除对PRRSV感染的影响。设计了三种DDX10特异性siRNA,并选择siDDX10-2(以下简称为siDDX10)用于随后的实验,因为它具有最高的敲除效率(图S2A和S2B)。用...