作为丝氨酸蛋白酶中的一个家族,颗粒酶具有哪些特性?
2024年5月29日 - 网易
其他特征包括一个氧阴离子孔来稳定酶间底物复合物的过渡态和一个底物结合袋,其形状决定了蛋白酶的特异性。大鼠颗粒酶B的晶体结构最近被测定,它的晶体结构几乎没有什么惊喜。结果表明,颗粒酶B的底物裂隙容量相当大,可容纳多达8个底物残基。与P1底物残基接触的关键残基(即切割键的氨基末端,通常是天冬氨酸)是Arg226...
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首个从头设计酶分子诞生!AI加速药物开发再获突破
2023年2月25日 - 网易
酶分子在催化化学反应的第一个步骤是通过酶上的活性位点(activesite)与所催化的底物(substrate)相结合,形成酶-底物复合物。接着酶分子通过稳定催化反应发生所必需的高能过渡态来促使化学反应的进行。因此在进行从头酶分子设计时的首要步骤便是识别活性位点以及可与底物结合的口袋,但这经常因为现有蛋白结构文库缺乏合适...
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抗流感药物奥司他韦的药物设计
2023年3月11日 - 医学界网
奥司他韦(oseltamivir)是通过模拟靶标神经氨酸酶与底物过渡态的结合模式设计获得的,成为基于靶标结构的药物设计的经典案例。继离子通道M2之后,血细胞凝聚素(简称为血凝素)和神经氨酸酶成为抗流感药物研究的流行靶标。这2种酶识别和结合上呼吸道上皮细胞膜糖复合物的末端糖单元N-乙酰神经氨酸(唾液酸)。血凝素结合N...
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南京航空航天大学【综述】超分子策略调控纳米空间化学反应活性
2020年3月16日 - 网易
酶是一种生物结构,具有多个分隔空腔能够催化底物转化,底物与酶的结合常常导致它们与溶液分离。因此,反应物在受限的纳米空间中被物理隔离,使得反应能够选择性地快速进行,隔离的环境提供了底物的预组织和邻近、高的局部浓度、氨基酸残基之间的协同作用和稳定过渡态的可能性,这些因素同时影响酶催化作用。尽管构建复杂的酶主体...
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