西北农林科技大学陈坤明团队发现小麦穗发芽调控新基因
近年来,随着GWAS技术在作物中的应用发展成熟和小麦高密度单核苷酸多态性位点(SNPs)芯片(35K、55K、90K、660K、820K)的不断开发(Sunetal.,2020),为小麦这样基因组高度连锁不平衡的六倍体作物穗发芽性状相关因果基因的精准定位与挖掘提供了契机。该研究以680份具有丰富自然变异的小麦自然群体为研究材料,通过四...
恭喜大胡子哥 - MBE | 复旦大学徐书华团队解构哈萨克族的遗传源流...
比较哈萨克族与其祖源人群的核苷酸多样性()、单倍型多样性(H)、分离位点数量()、Tajimas’D的分布,发现各项参数估计均提示哈萨克族相对于祖源人群的遗传多样性有所增加。值得注意的是,相对于其祖源人群,哈萨克族基因组中富集了更多稀有等位基因,这个现象符合哈萨克族经历了近期基因交流历史的预期(图2)。图2|新...
β地贫如何“脱贫”?
BEAM-101是BeamTherapeutics研发的一种单碱基编辑疗法,通过在体外对患者的造血干细胞进行基因组改造,使其模仿遗传性持续性胎儿血红蛋白症个体中的单核苷酸多态性,来缓解导致SCD和β地贫遗传突变的不良影响。在临床前研究中,BEAM-101完成了高水平的HSC编辑,超过90%的等位基因被编辑,胎儿血红蛋白(HbF)上调水平高...
主编评述 | 2023年中国植物科学重要研究进展
农艺性状分析表明,导入GY3优良等位基因可增加稻穗的次生分枝数、穗粒数和产量,从而为水稻高产育种提供了新的基因资源(Wuetal.,2023a)。2.3抑制BR信号提高半矮化小麦产量的分子机制自20世纪60年代以来,半矮秆和抗倒伏作物品种的广泛种植显著提高了农作物产量,引发了农业领域的第1次“绿色革命”(Peng...
3孩非亲生案女方称DNA鉴定也不是100%准确?
其原理也很容易理解:正常情况下,一个人有23对(46条)染色体,同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因,一个来自父亲,一个来自母亲。如果检测到某个DNA位点的等位基因,一个与母亲相同,另一个就应与父亲相同,否则亲子关系就可能有问题。目前,DNA亲子鉴定最常用的是常染色体短串联重复序列(STR)分析。STR指...
Science Bulletin 2023年第20期
对自然发酵乳样本进行了深度宏基因组测序,并对其中的214株瑞士乳杆菌、97株乳酸乳球菌乳酸亚种和325株德氏乳杆菌保加利亚亚种进行了系统发育关系的分析.研究发现,同一样本中的乳酸菌菌株具有高度的种内异质性(每个样本平均含有2418~4382个单核苷酸多态性),在进化角度上被分为2~8个进化谱系.绝大多数谱系的碳水...
华裔科学家张锋的新“基因剪刀”到底多厉害
丘奇告诉《中国新闻周刊》,Fanzor的商业前景和其他数百种内切酶相似。不过,Fanzor距离真正商业化应用,似乎还有很远。因为即便是已有不少临床研究进展的CRISPR/Cas技术,目前获批的相关基因疗法数目仍为0。“迄今为止,已获美国食品和药物管理局(FDA)批准的基因疗法共有12种,均不涉及CRISPR。”丘奇表示,这种情况将在20...
什么是单核苷酸多态性?它有哪些分析方法?
5.检测方便二等位基因性使SNP分析易于自动化、规模化。用基因芯片直接分析序列变异,可同时对上千个SNP位点进行分型。SNP的传统分析技术有RFLP、SSCP、毛细管电泳、变性高效液相色谱等,但这些技术只能判断是否存在SNP,不能鉴定SNP类型,且通量受限。5′-核酸酶等位基因鉴别法、DNA测序、等位基因特异性寡核苷酸探针杂交...
药物基因组学发展和应用(二)
除了CYP2C9*6和CYP2C9*31外,所有导致酶活性降低的突变等位基因都是单个非同义碱基变异。CYP2C9*2,*4,和*5在白人和黑人中频率较高,但在中国人中却极低或为零。CYP2C9*6在中国人中也不存在,CYP2C9*7-12的频率未知。CYP2C9*3是中国人中已知的主要突变等位基因,其频率2.1%~4.5%,低于白人4.3%...
陈泽慧:古基因组揭示德裔犹太族群遗传疾病溯源早于十二世纪
通过对等位基因频率的分析表明:德裔(Ashkenazi)犹太人群相关疾病等位基因在公元12世纪之前上升到接近现代犹太人群的频率。由于这些等位基因大多数在西班牙裔(Shephardi)犹太人群中频率相对较低,最可能导致频率升高的瓶颈效应对应与中世纪早期北欧德裔犹太人群的形成有关。这为现代德裔犹太人相关遗传疾病的起源和传播提供...