中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生
高通量的16SrRNA基因扩增子测序方法有以下优点:该方法基于16SrRNA基因的扩增,因此可以适用于未培养的细菌或低生物量样品,并且可以对复杂样品进行细菌特异性的分析。因此,该方法在医学、农学、环境科学等多个领域的研究中都有广泛的应用。在医学领域,16SrRNA基因扩增子测序方法可用于鉴定口咽或直肠中特定的病原菌...
中国智造让基因测序技术突破受制于人困境
相比传统WGS文库和其他同类产品,stLFR文库仅需1ngDNA且无需预扩增即可获得高质量的全基因组测序文库,二倍体定相区块N50值可达10Mb,能够有效检出倒位、异位、删除等结构变异,实现常规手段无法实现的结构变异检测,并达到相同深度的常规全基因组测序文库表现的最佳水平。此外,该产品单管无分隔反应,无需微量移液设备或复杂...
高分子量DNA提取助力三代测序精准分析
分别使用康为世纪磁珠法高分子量DNA提取试剂与A公司的产品同时提取新鲜血液、动物组织样本中的DNA,提取的基因组DNA对纯度、浓度结果测定及脉冲电泳分析鉴定,结果显示康为世纪磁珠法高分子量DNA提取试剂所获得的DNA有更好的性能,且提取得率、浓度优于A公司。产品特点性能展示使用康为世纪玻璃珠法高分子量DNA提取试...
科学家研发低DNA输入量建库方法,全部流程在单个试管内进行,能最大...
它能在不扩增的前提之下,将PacBio测序的DNA建库输入量降低至100ng,适用于解析小型生物并可以帮助解析其内共生体基因组,除此之外LILAP还非常适合微小肿瘤等医疗用途的微量珍稀样品。预计LILAP将能用于研究那些DNA用量受限的小型生物、分析较大物种的体细胞变异、分析果蝇个体水平的全基因组突变规律、以及...
细胞用量大幅减少,新技术提升单分子DNA测序水平
单分子分析的黄金标准方法通常需要至少150000个人类细胞,其中包含数百万个单个DNA分子。这意味着研究人员在只有几千个细胞可用时,根本无法应用这些工具,例如在许多肿瘤活检中。团队此次开发的新工具被称为“单分子实时标记测序”(简称SMRT-Tag),它可同时绘制长DNA片段中的碱基序列,以及DNA长度上称为甲基的化学结构位置...
利用DNA和RNA测序组合方法鉴定非小细胞肺癌靶向治疗的基因变异特征
NSCLC队列中DNA和RNA序列的基因变异情况在NSCLC病例中,研究者使用DNA面板测序进一步展示了前20个基因的SNV/indel图谱,其中TP53和EGFR的SNV/indel频率分别为60%和55%(图2A)(www.e993.com)2024年10月18日。图2B显示NSCLC队列中CDKN2A、MYC、EGFR和CDK4基因的CNV率分别为15.9%、12.4%、8.2%和7.4%。其中,CDKN2A基因为拷贝数缺失,而MYC、EG...
RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析
在儿童癌症中,基于RNA测序(RNAseq)的融合基因检测显示出比传统方法更高的灵敏度,使诊断率提高了约40%。2018年,RNAseq和全外显子组测序(WES)导致鉴定出至少5个成人弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)亚群。与传统的免疫组化和细胞遗传学分类相比,这些遗传特征不仅为DLBCL发病机制提供了新的信息,而且改善了预后...
共享DNA片段对“寻根”有多大意义?
利用从头骨或牙齿中所提取的样本,DNA研究人员可以对生活在10万年前的人进行DNA测序。目前可用的古代DNA序列或基因组超过1万个。这些来自世界各地的基因组极大地改变了科学家对人类起源的理解。古DNA研究的一个新趋势是对“历史”个体(过去1000年来的人)的基因组进行测序。例子包括来自瑞典、挪威、丹麦、冰岛、波兰、...
单次准确率超97%!普译生物发布中通量纳米孔基因测序仪,实现高精准...
普基因之序,译生命密码。2024年1月16日,北京普译生物科技有限公司(以下简称“普译生物”)2024年一季度新品发布会在中关村科学城东升科技园会议中心顺利举行。会上,普译生物发布了公司首款中通量纳米孔基因测序仪PolyseqOne以及配套芯片和试剂盒,该测序系统为长读长测序应用提供了新的解决方案。PolyseqOne发布会现场...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
然后在高通量平台(通常是Illumina)上进行测序,每个样本测序reads深度为10-30Millionreads。早期的RNA-seq实验从细胞群(如来源于某个组织或器官的细胞)中得到DGE数据,并可以应用于很多物种,如玉米(Zeamays),拟南芥(Arabiodopsisthaliana),酿酒酵母(Saccharomycescerevisae),鼠(Musmusculus)和人(Homosapiens)...