Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

首先,用于建库的RNA分子需要是全长转录本,但由于RNA提取、分离过程中会导致RNA断裂或实验过程中RNA降解,使得理想状态并非总能实现。这种情况在短读长RNA-seq中也会导致可控的3??端偏好,但对定位于应用长读长的RNA-seq分析全长转录组的研究者来说,即使是低水平的RNA降解,效果也会受限。因此,相关研究者需要在RNA...

人偏肺病毒融合蛋白疫苗:研究进展

用稳定的PreF蛋白处理血清,能显著消耗DS-CavEs2免疫小鼠血清中的中和抗体活性;而PostF蛋白未能大量消耗DS-CavEs2免疫后小鼠血清的中和抗体活性,表明DS-CavEs2免疫主要引发融合前F蛋白特异性抗体,是优越的疫苗抗原。基于融合前RSVF蛋白构建体的经验,将hMPVC-85473毒株(GenBank:KM408076.1)的野生型(WT)F基因插入p...

上新| 5 min细胞 or 10 min组织RNA提取,简单&疑难样本全覆盖(文末...

10min完成单次提取,有效提高RNA产量和5SrRNA占比。图4.不同产品提取RNA产量和完整度比对结果使用Vazyme#RC113与市场上同类产品SupplierA、B、C、D,按照各自说明书同时提取10mg大鼠肾脏、脑、骨头和小鼠牙龈组织总RNA,进行浓度测定和琼脂糖凝胶电泳检测。Vazyme#RC113提取的RNA产量和完整性均较好,且5Sr...

Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录组学...

为了深入理解IPF的发病机制,该研究利用空间转录组学(SpatialTranscriptomics,SRT)技术和单细胞RNA测序(Single-cellRNASequencing,scRNA-seq)技术,绘制了人类和小鼠肺纤维化模型的基因表达图谱,从而揭示了纤维化生态位及其相关细胞类型和信号通路的特征。研究使用了从IPF患者和健康对照(HealthyControls,HCs)获取的肺组...

...Biotechnol | 陈玲玲团队利用环形RNA适配体实现银屑病小鼠模型...

这两种过表达ds-cRNA小鼠模型中,各组织能够稳定表达ds-cRNA,且与同龄野生型小鼠相比生长发育正常,无明显差异。这些结果初步表明了环形RNA在生物医学应用中的安全性。此外,稳定过表达ds-RNA的小鼠模型中,研究人员也观察到银屑病症状也得到缓解。研究人员还首次实现了RNA适配体在银屑病小鼠模型中的干预治疗:1)通过尾...

小鼠肺类器官对减少、增加和循环拉伸的反应

实验对类器官进行了20小时的循环拉伸,并从这些mLOs中提取RNA,mLO承受相同大小的静态拉伸以及不施加拉伸(www.e993.com)2024年11月20日。PCA揭示了静态和无拉伸mLOs之间的相似性,以及这两组和循环拉伸mLOs具有良好的分离性(图2A)。由于静态和无拉伸mLOs相似,将它们与对照循环拉伸mLOs进行比较,以确定循环拉伸是否激活了与细胞外基质结构和组织、细...

...基于Rac1信号研究淫羊藿苷对慢性阻塞性肺疾病模型小鼠肺泡巨噬...

称取小鼠肺组织,TRIZOL法提取RNA,ReverTraAceqPCRRT试剂盒合成cDNA,使用SYBRGreenFastqPCRMix进行实时荧光PCR检测,以GAPDH为参考基因,用2??????Ct法进行定量,对照组的基因表达被标准化为1。引物序列由GENEWIZ公司设计与合成,见表1。

上海交大章雪晴团队与新泽西理工学院许晓阳团队发表吸入式肺靶向...

在该研究中,作者基于开发的吸入式核酸纳米递送载体,成功递送mRNA到达纤维化小鼠的肺部,实现抗纤维化治疗。上海交通大学柏欣博士为该论文的第一作者,上海交通大学药学院为第一和责任通讯单位。在该项目中,研究人员首先提出了一种新型“LOOP”研究平台,由四步工作流程组成,避免了大量且冗余的LNP筛选过程。作者利用微...

步长宣肺败毒颗粒(方)通过影响中性粒细胞功能治疗急性肺损伤的...

1.与脂多糖(LPS)模型组相比,宣肺败毒方(XFBD)给药两天能够显著改善ALI小鼠肺部损伤以及肺水肿,降低支气管肺泡灌洗液中炎症因子IL-6、TNF-α的表达。宣肺败毒方(XFBD)也可以减少BALF以及肺组织中中性粒细胞的募集,降低与中性粒细胞趋化因子CXCL3和CSF2的mRNA的表达。肺组织中IF结果显示XFBD可以降低NETs形成标记...

PNAS. | 环状RNA疫苗诱导有效的T细胞反应

图4.体内循环RNA递送激活T细胞特异性反应作者设计试验检测小鼠腹腔内注射circRNA编码蛋白后的适应性免疫反应。在第0天和第21天,用单独的CART(仅载体对照)、CART-circOVA和circRNA+OVAp对三组小鼠进行腹膜内免疫。通过在第7天(餐后7天)和第42天(加强后21天)对肺、脾和血液T细胞进行MHC类四聚体染色来评估抗原特...