微小RNA:神秘“小开关” 微观“指挥家”
之后,随着包括人在内的多种生物基因组图谱的公布及高通量二代测序技术的发展,microRNA的相关研究便进入“掘金”时代。过去二十年,microRNA在不同物种的重要功能都得到了系统的研究。药物研发前景广阔在疾病治疗方面,目前已有10多种基于RNA的治疗方法获得监管批准,更多的研究进入后期临床开发阶段。陈炜表示,目前,小R...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术(NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生
此外，使用下一代测序技术后无需再做DNA克隆，简化了16SrRNA基因扩增子测序的步骤。因此目前主流的16SrRNA基因扩增子测序方法仍采用下一代测序技术。2013年，16SrRNA基因扩增子测序技术采用单分子测序技术（三代测序）实现了对16SrRNA基因全长序列的高通量测序。2022年，基于单细胞的16SrRNA基因扩增子测序方法研...
Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿
为了评估长读长方法在转录组分析中的有效性,长读长RNA测序基因组注释评估项目(Long-readRNA-SeqGenomeAnnotationAssessmentProject,LRGASP)应运而生。该项目通过使用不同的测序协议和平台,生成了超过4.27亿条来自人类、小鼠和海牛物种的长读长序列数据。这些数据集包括从互补DNA(cDNA)和直接RNA数据集中提取的...
利用DNA和RNA测序组合方法鉴定非小细胞肺癌靶向治疗的基因变异特征
RNA测序显著补充了基因融合DNA测序的不足。肺癌是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,其中非小细胞肺癌(NSCLC)约占肺癌病例的85%[1]。准确而全面地研究NSCLC患者的特定基因突变,有助于通过使用靶向药物的治疗显著改善患者的结局和预后。二代测序(NGS)技术被美国国家综合癌症网络(NCCN)和中国临床肿瘤学会(CSCO)指南推荐...
达安基因申请一种去除核糖体RNA二代测序文库的构建方法及构建试剂...
金融界2024年3月1日消息,据国家知识产权局公告,广州达安基因股份有限公司申请一项名为“一种去除核糖体RNA二代测序文库的构建方法及构建试剂盒“,公开号CN117626450A,申请日期为2022年8月(www.e993.com)2024年11月17日。专利摘要显示,本申请实施例属于生物技术领域,涉及一种去除核糖体RNA二代测序文库的构建方法及构建试剂盒,包括将RNA进行片段化...
基因测序技术:就像考试做“问答题”
纳米孔测序是高通量测序中的最新一代技术。相较于NGS二代测序,纳米孔测序的优势在于:第一,可单次读取很长的DNA序列,从而更好地检测基因片段中缺失、重复等大规模的结构变异,获得更加清晰、完整的基因组信息。第二,速度快,基本可以实现样本进—测序—数据出的快速流程,而且数据产出的同时就可以进行信息分析,明确疾病...
RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析
RNAseq和WES识别了常规方法未检测到的其他遗传学异常。最后,重点介绍了3个案例,说明了如何实现不同诊断技术和专家之间的协同作用。本研究表明了现代测序技术和流式细胞术整合到淋巴瘤常规诊断中的可行性,并讨论了附加价值。在儿童淋巴瘤患者中,RNA和DNA测序的纳入不仅能支持诊断,而且能为开发基于研究的新型治疗策略...
生命科学领域“光刻机”全球竞速,中国企业在纳米孔测序仪新赛道...
2012年,基因测序企业OxfordNanopore推出首款纳米孔基因测序仪样机,并于2014年率先实现商业化。基于电信号测序的纳米孔DNA测序,其原理实际上非常直观简洁:通过电场力驱动单链核酸分子穿过纳米尺寸的蛋白孔道,由于不同的碱基通过纳米孔道时产生了不同阻断程度和阻断时间的电流信号,由此可根据电流信号识别每条核酸分子上的...
Nature子刊:杨建华/屈良鹄/李斌团队发现新结构型非编码RNA及其...
序列的新测序方法——NAP-seq,具体的简化步骤包括:对RNA样品进行除杂、T4PNK修复RNA末端、长度筛选、自主设计的3’端接头和5’端接头连接、非目标RNA的去除、巢式RT-PCR与预扩增、可选地片段化、在两种不同的测序平台(OxfordNanopore三代单分子测序平台和Illumina二代测序平台)测序和开发新算法鉴定napRNA等步骤(...