大模型重构生命科学!最大基础模型面世,解锁DNA超长序列,参数规模...

此次发布的xTrimoV3,覆盖DNA、RNA、蛋白质、细胞、小分子、生物视觉和生物知识文本等生命科学7个主流模态。在上一版本已有蛋白质和细胞两大领域基础之上,拓展到了基因组学、转录组学、细胞复杂任务、影像分析和文本分析等领域,从而支持从分子早期研发到生产放大再到后期实验分析的全流程AI建模需求。而除了实现整个...

被质疑“不该拿物理学奖”的诺奖得主,一生经历却足够拍一部《奥本...

它由几门带有固体字样的课程、一个固体物理研讨会、两位在这个领域进行理论研究的教师和大约四个实验方向定义。那个部门当时进行的实验问题包括低温热导率、碱金属卤化物中的色心、绝缘体的紫外光谱和X射线吸收。我还记得部门里有个人在研究氦-4的超流动性系,但那肯定不属于当时定义的固态物理学范畴。刚从伊利诺...

两个圈外人的前卫实验,引发了一场不凡俗的科学革命

在20世纪50年代DNA双螺旋结构被发现后,人们希望知道基因是如何具体表达的,特别是翻译过程中密码子的碱基数量和对应的氨基酸序列。世界顶级实验室中的科学家一度处于迷茫的状态,但在60年代初,两位“圈外人”,海因里希·马特伊与马歇尔·尼伦伯格通过一种独特的实验方法,破译出第一个遗传密码,证明RNA密码子与氨基酸之间的...

一个与视网膜色素变性极为相似的疾病——Usher综合征

4、缺失突变小缺失可以是基因内的一个或几个碱基对丢失,而大的缺失可以删除几个相邻基因甚至是整个基因,从而改变编码蛋白质的功能。5、重复突变增加了DNA序列重复的次数,导致所得蛋白质不正常地发挥功能。6、移码突变通俗的来讲就是编码(氨基酸)的密码发生了错位,从而改变了编码合成氨基酸的种类,最终导致蛋白质...

Cancer Discovery:上海交大瑞金医院卢敏团队建立p53靶向药物研究...

某些突变正好发生于p53的DNA结合氨基酸(通常是带正电的精氨酸),导致这些突变体无法结合DNA,从而失去抑癌功能,这一类突变体被称为“DNA结合型突变体”。至今不存在(短期的将来应该也不会出现)可以理解的、针对这些突变体的功能恢复策略。作为一个重要的转录因子,p53进化出的DNA结合氨基酸可以与DNA的大沟和小沟在形状...

Cancer Discovery 中国专刊丨卢敏团队建立p53靶向药物的研究规范

某些突变正好发生于p53的DNA结合氨基酸(通常是带正电的精氨酸),导致这些突变体无法结合DNA,从而失去抑癌功能,这一类突变体被称为“DNA结合型突变体”(www.e993.com)2024年11月12日。至今不存在(短期的将来应该也不会出现)可以理解的、针对这些突变体的功能恢复策略。作为一个重要的转录因子,p53进化出的DNA结合氨基酸可以与DNA的大沟和小沟...

诺奖2024|马剑鹏:AI已绕不开,不能再不懂,宜从娃娃抓起

一个个氨基酸相连“串成”多肽,而长链一样的多肽折叠形成稳定的空间三维结构,成为一个有功能的蛋白质。根据一个氨基酸序列推测出相应蛋白质最终的“折叠结构”(foldedstructure),这就是蛋白质结构的预测问题。它被视为现代分子生物学“皇冠上的明珠”。

氨基酸行业专题报告:助益粮食安全,借力合成生物

合成生物学技术体系中，DNA合成、生物元件的开发是基础，其中低成本高效DNA合成以及基因编辑技术是最核心的使能技术。过去数年，DNA合成技术在合成长度、合成通量等方面不断进步，目前寡核苷酸链合成通量可达到百万条级，合成成本降低约3个数量级。基因编辑技术方面，2012年开始科学家利用CRISPR/Cas可...

《科学》:125个最具挑战性的科学难题

基因组大小,即细胞核中DNA的数量,在动植物中极其多样,差异超过64000倍。最大的基因组属于一种叫做日本重楼的开花植物,其每个细胞有40条染色体,有1500亿个DNA碱基对,是人类基因组的50倍。尽管我们现在知道基因组大小的多样性的主要贡献者是非蛋白质编码,通常是高度重复的DNA序列,但它们数量变化如此之大的原因仍然是...

年度最佳Cell综述:全面解析衰老的十二个标志

衰老通常是指有机体从成年期开始功能衰退的过程,自2013年Cell发表第一版“衰老的标志”以来,到目前已发表了近30万篇有关这一主题的文章,这与上一个世纪的总数量相当。早在2013年,科学家就已提出了衰老的九个分子细胞和系统标志,分别为:DNA不稳定、端粒损耗、表观遗传改变、蛋白质稳态丧失、营养感应失调、线粒...