科学家利用AlphaFold-Multimer首次发现精卵结合的关键三聚体蛋白

这多少有点出人意料了,因为Tmem81是一种睾丸表达的单通道跨膜蛋白,此前从未有研究发现它与受精有关。这三种蛋白结构上都具有一个免疫球蛋白(Ig)样结构域,通过柔性结构连接到C端跨膜螺旋。Izumo1和Spaca6还具有一个N端的四螺旋束(4HB)。三个蛋白的结构AlphaFold-Multimer预测显示,Izumo1、Spaca6和Tmem81形...

Nature︱细胞内的“搬运工”:揭秘蛋白质定位调控的新策略

为了研究缺乏已知小分子结合位点的蛋白质,研究人员合成了双功能分子TRAM1,其能够与大肠杆菌二氢叶酸还原酶结构域(EcDHFR)和FKBP12F36V结构域结合,这些结构域因其与大多数哺乳动物蛋白的紧密的结合亲和力和正交性而被广泛使用。然后生成了mCherry融合EcDHFR和来自HIV-1REV蛋白的NES作为穿梭蛋白,并在HeLa细胞中稳...

中国科大首次解析人类溶酶体维生素B12外排蛋白ABCD4的电镜结构

该蛋白由606个氨基酸残基组成,以同源二聚体的形式在人体内行使功能。本次解析的结构为生理状态下ABCD4二聚体复合物的结构,包含两个六次跨膜的跨膜结构域(TMD)和两个核酸结合结构域(NBD),整体呈现对溶酶体内开放的构象,其中两个核酸结合结构域各自结合一个ATP分子并二聚化,两个跨膜结构域通过跨膜螺旋的交错形成...

中国科大解析Lon蛋白酶的完整三维结构并揭示其底物识别与转移的...

LonAAA+蛋白酶(LonA)是一种在原核生物和真核生物细胞器中保守的ATP依赖性蛋白酶。LonA组装为同源六聚体,每个单体都包含一个N端结构域、一个中间ATP酶结构域和一个C端蛋白酶结构域。LonA通过降解受损或错误折叠的异常蛋白质在细胞蛋白质稳态中发挥重要作用,从而防止这些不需要的蛋白质种类形成有毒聚集体。LonA还...

人偏肺病毒融合蛋白疫苗:研究进展

Ⅰ位点上的抗原表位DS7是所有4种hMPV亚型共有的有效中和位点,也是第一个具有hMPVF蛋白结构特征的抗原表位。位点Ⅱ:位于位点Ⅲ和Ⅰ之间,是单克隆抗体(monoclonalantibody,McAb)M1D2和M1C7的靶标,该表位在hMPVPreF和PostF构象中保守,故该位点特异性的McAb均可以与PreF和PostF结合。

分析蛋白质功能结构域的策略和步骤

蛋白质的功能结构域(Functionaldomains)是蛋白质序列中的特定区域,它可以独立地完成某种生物学功能(www.e993.com)2024年11月8日。分析蛋白序列的功能结构域通常涉及以下几个步骤:1.序列比对使用如BLAST之类的工具,将目标蛋白序列与已知的蛋白数据库进行比对,寻找相似的已知结构或功能的区域。

...篇顶刊,阿尔茨海默病治疗新突破!剑桥团队新策略精确清除毒性蛋白

▲以tau蛋白为“诱饵”激活Trim21的RING结构域(图片来源:参考资料[2])《细胞》论文展示的方法是将Trim21的RING结构域与tau蛋白的一个拷贝结合在一起,以这个tau蛋白作为“诱饵”(Bait)。一旦tau蛋白聚集体“吃进”了多个诱饵,就会激活RING,导致整个聚集体被送去降解。同样,这也不会破坏健康的tau蛋白。

生命科学与技术学院张赫团队关于染色质拓扑相关结构域调控基因...

真核生物基因组在进化上保守,但在空间层次上具有高度可塑性,由染色质环、拓扑相关结构域(topologicallyassociatingdomain,TAD)等动态的染色质高维结构组成。当TAD重构介导的染色质环处于紊乱状态时,易引起染色质构象重塑,导致基因表达异常,甚至促使肿瘤发生。因此,亟需进一步发现受TAD变化调控的功能基因,并深入揭示TAD重...

FMD 通过对LU结构域蛋白家族的系统分析发现人类新基因LY6A编码...

Ly-6抗原代表了一类最为复杂的淋巴细胞抗原,因为它被发现对应于多个不同的蛋白分子量以及不同的细胞类型,而且在不同品系的小鼠之间也存在差异。后来的研究表明,Ly-6抗原由许多个基因编码,它们的共同特征是含有LU结构域。Ly-6系列抗原在小鼠和人之间有一定的保守性,在基础和临床上已广泛应用于细胞的鉴定和分选。

不可思议!诺奖得主David Baker的Binder亲和力有多强?

2)与S蛋白的RBD结构域对接来设计(方法2)图A为方法1示意图,图B为方法2示意图技术路线如下:*AHB1亲和力高,但是稳定性差,通过AHB1结构再进行一次设计与筛选,获得AHB2前体。Octet亲和力测试:AHB1前体的动力学测定(uM级别亲和力)AHB2的动力学测定(nM级别亲和力)...