AI面临的五个蛋白质设计问题,Nature找了一群专家来讨论

加州大学旧金山分校的生物工程师TanjaKortemme表示,一个含有100个氨基酸的蛋白质(以蛋白质标准来说很小)至少可以呈现3100种可能的构象。「我们对物理学的理解相当不错,但将其融入其中受到我们需要计算的可能性数量的限制。」机器学习可以帮助缩小范围,微软和其他公司正在开发加快寻找蛋白质构象所需计算的方法。

科学家开发非天然氨基酸eFSY,能在活细胞中鉴定直接的蛋白质相互作用

01浙江大学杨兵研究员实验室成功开发了可富集的非天然氨基酸eFSY,能在活细胞中鉴定直接的蛋白质相互作用。02该团队克服了高效大量制备探针化合物eFSY的难题,筛选出了能够识别eFSY的氨酰-tRNA合酶。03除此之外,研究人员开发了非天然氨基酸交联鉴定软件AixUaa,提高了交联肽段的鉴定率和准确性。04该技术有望用于鉴...

2024化学诺奖专家解读:颁给蛋白质预测和AI实至名归,化学家还不会...

沈琦告诉澎湃科技，有了这些预测工具之后，科学家们能够根据氨基酸序列快速计算出蛋白质的精细结构，大大提高工作效率。另外，通过AI也能高效设计和验证新的蛋白结构，帮助新药开发和人工生命体的构建。“从蛋白质一级结构预测高级结构是化学生物学家、结构生物学家和物理化学家都非常关心的一个重要问题。”他说，“AI确...

他们用AI破译蛋白质结构“密码”

诺贝尔化学奖委员会主席海纳??林克指出，今年的诺贝尔化学奖如同“双花并蒂”，他们一方面用计算软件构建出全新蛋白质结构，另一方面则基于氨基酸序列开发出名叫“阿尔法折叠2”的人工智能（AI）模型，实现对蛋白质复杂结构的预测。这两项科学突破携手开辟出巨大的可能性。从头设计全新蛋白质2024年诺贝尔化学奖“花落”蛋...

AI赢麻了?2024年诺贝尔化学奖授予蛋白质结构预测|科技观察

蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成,它们可以被描述为生命的基石。2003年,大卫·贝克成功地利用这些模块设计了一种不同于其他任何蛋白质的新蛋白质。从那时起,他的研究小组创造了一个又一个富有想象力的93个氨基酸残基的α/β蛋白,具有全新的拓扑结构,能够自动折叠成球状并非常稳定。

诺贝尔化学奖揭晓!国际象棋AI大师破解了蛋白质的密码

2024年诺贝尔化学奖了授予华盛顿大学的戴维·贝克教授(DavidBaker)、谷歌DeepMind的德米斯·哈萨比斯(DemisHassabis)和约翰·江珀(JohnJumper),他们因“蛋白质结构预测”,破解了蛋白质结构的密码,从而获得诺奖(www.e993.com)2024年11月15日。诺贝尔化学奖委员会主席海纳·林克说:“蛋白质里这20种氨基酸所蕴含的潜力,无论怎样强调都不为过。”...

基因突变影响蛋白质稳定性有新解

GRB2-SH3是一种含有34个氨基酸的蛋白质,每种氨基酸都可以突变成19种不同的氨基酸。如果每个位置只允许一个变化,那么就可以产生170亿种不同的蛋白质组合。图片来源:威康桑格研究所人体蛋白质由20种不同的氨基酸组成。单个突变会将一种氨基酸替换为另一种,从而改变蛋白质的形状。这种变化可能是健康与疾病之间的分水...

【中国科技网】深度学习助力蛋白质序列从头设计

经过实验验证,ABACUS-R的设计成功率和设计精度超过了原有统计能量模型ABACUS。研究成果北京时间7月21日发表于《自然-计算科学》。刘海燕、陈泉团队长期致力于发展数据驱动的蛋白质设计方法,先后建立并实验验证了对给定主链结构设计氨基酸序列的统计能量函数ABACUS模型,以及利用神经网络能量函数从头设计主链结构的SCUBA模型...

基因突变影响蛋白质稳定性有新解—新闻—科学网

GRB2-SH3是一种含有34个氨基酸的蛋白质,每种氨基酸都可以突变成19种不同的氨基酸。如果每个位置只允许一个变化,那么就可以产生170亿种不同的蛋白质组合。图片来源:威康桑格研究所特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用...

水产品肌肉组织中氨基酸含量检测

对虾肌肉组织以其高蛋白质含量而著称,这些蛋白质由多种氨基酸按特定序列组成。通过现代生物技术手段,如高效液相色谱法(HPLC)、氨基酸分析仪等精密仪器,科学家们能够精确测定对虾肌肉中各种氨基酸的具体含量。研究发现,对虾肌肉富含人体必需的多种氨基酸,如赖氨酸、色氨酸、缬氨酸等,这些氨基酸在人体内不能自行合成,必须从...