GWAS关联分析知识普及(样本收集、性状调查、基因分型、关联分析...
做GWAS分析,从材料到结果一共有5大步:样本收集、基因分型、性状调查、关联分析、功能验证。对于初次接触GWAS分析的人来说,样本的选择和性状数据调查尤其重要。样本选择:一般来说群体大小至少200个,且样本间不能有明显的亚群分化(例如生殖隔离等)即遗传背景差异小。如果样本间存在亚群分化,则每个亚群建议样本量在...
...教授等:1 株新的变形杆菌噬菌体的分离、鉴定与生物学特性分析
选择噬菌体的主要衣壳蛋白进行进化树分析。如图8所示,发现PV66与奇异变形杆菌噬菌体podophagePrivateer和克罗诺杆菌噬菌体vB_CsaP_009均有83%的相似性,进化树分析发现PV66和vB_CsaP_009处于同一分支上,结合噬菌体的电镜形态特征与噬菌体宿主菌可判断PV66为C3形态、non-Kuravirus属的噬菌体。讨论与结论多项研究发...
多样性展现:质谱流式细胞技术解析细胞表型
第一:何为质谱流式细胞技术?质谱流式细胞技术是一种新兴的高通量分析技术,它结合了流式细胞术和质谱的优势。简言之,流式细胞术对细胞进行单细胞水平的分类与计数,而质谱则提供了对细胞表面蛋白质表型的强大检测能力。这种技术让我们有能力同时对数十亿细胞进行有标记的、无标记的或是特异性的表面蛋白表型分析。...
类器官高通量表型筛选用于药物发现和药物再利用
案例一:三阴性乳腺癌类器官中开展高通量筛选三阴性乳腺癌(Triplenegativebreastcancer,TNBC)是最难治的一个亚类,治疗方案少,且预后差。为此,我们建立了15株TNBCPDOs,形态学分析表明源于不同病人和同一病人不同区域肿瘤组织的类器官存在明显异质性(图6A-D)。从中选取了其中生长迅速的Pt-016号PDO对库...
DNA分析及其阴暗面
法律学者关注的另一个领域是法医DNA表型分析的实践。它旨在根据基因序列推断一个人的可见特征——皮肤、眼睛和头发的颜色,以及面部结构、雀斑的存在与否以及脱发的程度。然而,任何研究过生物发育的人都知道,生物体不仅是其基因的产物,也是其环境的产物,因此遗传信息只能说明部分情况。
余方友教授:临床耐药菌研究前沿
MRSA在中国的主要流行克隆型有ST5、ST59和ST239(www.e993.com)2024年7月24日。然而有研究表明,近年来ST22克隆已在中国出现,并在某些地区显示出取代ST59克隆型的趋势,但这些研究主要基于流行病学调查,没有深入分析毒力特征和基因组特征。日前,同济大学附属上海市肺科医院检验科余方友教授团队对我国MRSA的ST22克隆型进行了基因组和表型鉴定,证明...
【FCM指南与共识】流式细胞术的临床应用专家共识
选择适宜的对照是流式细胞术检测中正确获取和分析数据的基础[5]。“荧光减一”(fullystainedminusonefluorochrome或fluorescenceminusone,FMO)对照是目前确定阴性和阳性细胞群cutoff值的最佳对照,对于弱阳性或阳性细胞比较少的情况尤为适用,可排除交叉干扰等;同型对照可评估Fc受体或蛋白的交叉反应,排除非特异性...
淋巴瘤分型手段有哪些
免疫表型分析是淋巴瘤分型的一种常用方法,通常是利用抗原抗体反应,来检测淋巴瘤细胞,如果是良性的淋巴结疾病,该检查结果一般是呈阴性,如果是恶性的淋巴瘤,该检查结果通常是呈阳性。3、分子遗传学分析分子遗传学分析通常是指利用基因检测的技术,来检测淋巴瘤的基因,如果是良性的淋巴瘤,该检查结果一般是呈阳性,如果...
肿瘤深度分析 | 不仅仅是高级,更是结合表型的专属分析
自主平台BGISEQ-500,重复片段比率低于5%,准确度高:采用DNA纳米球技术,始终以同一个模板进行滚环复制,相较于PCR指数扩增,可以避免错误累积,有效提高测序准确度。免费提供解读视频:针对每项分析结果(demo)提供解读视频,相当于免费的高级信息分析培训。专业的肿瘤研究团队:团队具有丰富的肿瘤基因组学分析经验,在国际顶级...
美国“四院”院士莱诺·胡德:基因组和表型分析数据催生精准医疗
所谓表型组,是指生物体从微观(即分子)组成到宏观、从胚胎发育到衰老死亡全过程中所有表型的集合。胡德介绍,一个人的表型包含身体的各种变化情况,囊括一个人的纵向生命轨迹。而对于全体人类而言,表型集合包括基因组、行为和环境,是对人类不断变化的表型的持续评估,包括血液分析、肠道微生物组、大脑和数字健康分析、电...