The Innovation Life | 可编程的转座子介导的植物基因组大片段DNA...
PrimeRoot系统依赖于SSRs特定的重组位点,首先在目标位置插入重组位点(RS),然后提供供体DNA和重组酶,从而实现精准的大片段DNA插入。目前,该系统已成功在水稻基因组中整合高达11.1kb的大片段DNA序列(图1)。转座子,也称为“跳跃基因”,是一类能够在基因组内部移动的DNA序列,广泛存在于植物、动物和微生物等多种生物...
我国科研团队发布水稻完整参考基因组
综合利用新一代测序技术,完成了“日本晴”参考基因组的完整组装,其大小为385.7百万碱基对,每条染色体的端粒到端粒均由一条完整连续的序列组成,碱基精确度超过99.9999%,最新的组装新增了12.5百万碱基对的基因组序列,主要解锁了水稻基因组中结构最为复杂的核糖体DNA序列、着丝粒区域、复杂转座子序列和端粒...
中国科学家牵头绘制精细水稻基因图谱,恢复“中国味”命名
中国农业科学院作物科学研究所黎志康研究员、国际水稻研究所KennethL.McNally和NickolaiAlexandrov高级科学家、上海交通大学生命科学与生物技术学院韦朝春教授、华大基因张耕耘博士、中国农业科学院深圳农业基因组研究所阮珏研究员、亚利桑那大学RodA.Wing教授为该篇论文的共同通讯作者。并列第一作者则有中国农业科学院作...
...| 南京农业大学张文利课题组在全基因组水平鉴定水稻单链DNA
此外,ssDNA对水稻基因组中不同类型转座子(TEs)的活性和进化具有不同的影响。将全基因组ssDNA分成正向和反向链特异(For/Rev_ssDNA)和共有ssDNA(CommonssDNA)3个亚类,发现在3种亚型ssDNA中,DNA-6mA含量较低,但DNA-4acC含量较高,其中,DNA-4acC在CommonssDNA中富集水平最高。通过多组学数据联合分析发现,ssDNA...
华中农业大学揭示水稻雄性配子发生过程表观基因组动态重编程机制
综上所述,该研究分析了水稻小孢子母细胞、小孢子和精细胞的全基因组DNA甲基化,并研究了一组染色质调节因子在此过程中的功能,揭示了DNA甲基转移酶和组蛋白去甲基化酶在mCHG重塑中的不同功能,并表明mCHG重塑对雄配子发生和受精具有重要意义。也为研究表观变异通过雄配子传递到后代的可能性提供了数据。
NSR | 中国农业科学院深圳农业基因组研究所商连光团队揭示转座子...
大量文献表明,基因组结构变异在调控水稻农艺性状具有重要作用,而水稻基因组中的结构变异大多源自于TE(www.e993.com)2024年11月10日。TE主要包含non-LTR(LongTerminalRepeat,SINE和LINE)型逆转座子、LTR型逆转座子(Copia、Gypsy等)、TIR(TerminalInvertedRepeat)型DNA转座子(StowawayMITE、TouristMITE、DTC、DTA、DTT、DTM、DTH等)和...
上海交大陆婷婷课题组水稻染色体外环状DNA研究取得重要进展
染色体外环状DNA(extrachrosomalcircularDNA,eccDNA)作为真核生物基因组的独特组成部分,在生物医学领域的多项研究中已被证实其具有丰富而重要的生物学功能。水稻是单子叶模式植物,也是世界上最主要的粮食作物之一。开展水稻eccDNA研究,能从全新角度认识水稻基因组稳定性及响应环境变化的遗传适应基础。
黄学辉团队在《科学》刊文:研究1.8万份水稻“混血儿”,探索遗传构架
提取DNA针对各类水稻育种性状，该研究鉴定到了1207个基因位点，每个性状平均可以检测出27.5个基因位点，并在此基础上系统解析了水稻基因的遗传互作网络。较以往工作，这项研究大幅提升了遗传定位的功效和分辨率，也大大加深了对水稻育种性状形成的了解。值得一提的是，这项研究涉及农学、生物学、信息学、统计学等多个...
福建省科学家创新水稻定向改良技术——神奇的基因“魔剪”
人们发现，生命的外在特征取决于内在基因。基因的本质是DNA分子上的一些片段，ATCG等4种碱基的不同排列组合，决定了每一种基因的功能。这多么像程序代码啊！于是，在“解码人”的努力下，人们逐渐读懂了这些代码背后的深意：有的调控水稻的株高，有的调控水稻熟期，有的调控水稻耐旱性……不同基因往往相互作用，最终...
王传超:2023年中国人群古DNA和古蛋白研究代表性成果及进展评述
Biology上发表论文(Taoetal.,2023),通过对新石器时代四川宝墩文化高山古城与青铜时代云南剑川海门口遗址人骨样本进行古DNA的提取、测序和群体遗传分析,发现两支古代人群主要由黄河流域的古代粟黍农业人群(约90%)与和平文化的采集狩猎人群(约10%)混合形成的,但没有发现与华南地区古代稻作农业人群相关的基因流。中...