指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

理论上,凡存在于样本中的微生物均可检出,但因微生物基因组长度和样本类型等的差异,无法针对所有微生物建立统一的阴性、阳性判读标准。各实验室应根据预期用途、样本类型、检测目标和技术特点,建立并验证阳性阈值及判读标准。受试者工作特征曲线(receiveroperatingcharacteristiccurve,ROC)分析是一种可用于确定已知结果...

预测模型教程:详解区分度和校准度的SPSS操作

预测模型ROC曲线如下图所示,曲线下面积AUC为0.782>0.75,95%CI为0.726-0.838,提示该预测模型的区分能力较好。五、模型校准度(Calibration)通过Hosmer-Lemeshow拟合优度检验来评价预测模型的校准能力。结果显示,Hosmer-Lemeshowχ2=4.864,P=0.772>0.05,提示模型预测值与实际观测值之间的差异没有统计学显著性,预测...

前列腺癌根治术后切缘阳性的预测模型构建

同时,Delong检验结果提示,本研究构建的预测模型在训练集(z=3.47)和验证集(z=3.38)的切缘阳性风险预测能力均显著高于P.R.O.S.T.A.T.E评分系统。图2P.R.O.S.T.A.T.E评分系统预测训练集及验证集的切缘阳性的ROC曲线总结前列腺癌根治术后切缘阳性,一直是困扰泌尿外科医师的难题。尽管目前对于切缘阳...

如何测量你的感觉--ROC曲线

’通过对这两个图的分析,得到ROC曲线(接受者操作特征曲线),在这条曲线上,我们可以很清楚的看到d'与β两个值,d'是两条曲线之间的间距,β是曲线的斜率。曲线离对角线越远,说明信号更容易辨别,或者被试者更加敏感。而曲线上平缓的部分说明决策标准更大胆,陡峭的部分说明决策更为保守。从ROC曲线上,我们可以看出...

科研绘图:如何用GraphPad Prism绘制ROC曲线

在Graphs处可查看绘制的ROC曲线。默认获得的ROC曲线并不美观,下面进行一些美化。鼠标双击坐标轴,选择FrameandOrigin项目卡,修改Framestyle改为"PlainFrame",点击“OK”应用设置。切换至Xaxis选项卡,对横坐标样式进行修改,取消勾选“Automaticallydeterminetherangeandinterval”选项,在Range选项中设置Maxi...

这么多诊断性试验的评价指标,你都搞懂了吗?

A3:这个简单!就是E啦!补充讲几个关于ROC曲线的知识点:1、离左上角最近的坐标点对应的取值即最佳诊断界值2、曲线下面积(AUC),也叫C值,越大准确度越高3、当斜率=1时,真阳性率=假阴性率,患者、健康人群分布重合,试验无意义!希望这期干货对大家有所帮助!

综述| 18F-氟代脱氧葡萄糖正电子发射计算机体层摄影-CT在结核病...

Hu等应用18F-FDGPET/CT影像组学构建预测模型鉴别肺内孤立性肺结核和肺腺癌,结果显示,训练组和验证组中PET/CT影像组学模型应用受试者工作特征曲线(ROC曲线)曲线下面积均高于0.86,单纯依靠临床参数建立的临床模型ROC曲线下面积均小于0.68,联合临床参数后建立的复杂模型ROC曲线下面积均高于0.88。因此,基于18F-PET/CT...

基于SEER 数据库构建的甲状腺微小乳头状癌颈淋巴结转移预测模型的...

ROC曲线结果表明,该列线图评分预测PTMC患者区域淋巴结转移的AUC值为0.722[95%CI为(0.7115,0.7326)],提示该列线图具有良好的区分度。R软件包计算的敏感度+特异度最高的Cut-off评分为122.067分(敏感度为0.638,特异度为0.684,图2e)。随后在内部验证集中对该模型的预测能力进行了验证,校准曲线结果表明,该列线...

关于病原体宏基因组高通量测序产品的几点考虑

基于mNGS技术的产品,阳性判断值应包含度量标准,例如检测结果中能够比对到数据库中的微生物的序列数、对某种微生物的基因组覆盖度等,可通过ROC曲线分析的方法对产品的阳性判断值进行研究。在阳性判断值研究过程中应注意,胞内菌和厚壁微生物检出率低,因此即使在检测报告中某种/某些胞内菌/厚壁菌检出序列数不高,也要...

中国医生团队登《柳叶刀》期刊 | 6家医院合作的上消化道肿瘤内镜...

我们使用ROC曲线来显示深度学习算法在鉴别上消化道癌症患者与正常人的诊断能力。通过改变预测概率阈值,绘制真阳性病例比例(敏感性)与假阳性病例比例(1-特异性)的ROC曲线。ROC曲线下面积越大,诊断效果越好。所有统计检验均为双侧,显著性水平为0.05。用3.5.1版r软件进行统计分析。