疫苗前沿 | 甲型流感病毒的反向疫苗学:从基因组测序到疫苗设计

2024年10月17日 - 网易

4、重点事项ClustalOmega可以对齐多达4000个序列或最大文件大小为4MB:对于较大的序列,需要对原始序列进行片段化,并逐个提交每个短序列;NetCTL对提交数据的大小有几个限制:每次提交最多5000个序列,每个序列应不超过20,000个氨基酸,不少于9个氨基酸,最多200,000个氨基酸;BepiPred软件的新版本目前可用,解决了与第...

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国内首个!《动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

2024年9月26日 - 网易

NGS以DNA纳米球测序和边合成边测序技术为主,测序数据量大,准确性高,测序成本低,但测序读长较短,拼接复杂、长基因组时较困难;TGS以纳米孔测序和单分子荧光信号测序两种技术为主,测序读长长,可拼接长基因组序列,但数据产出量较低,准确性较低、测序成本较高,可实时产出数据,设备可便携[2]。各实验室可根据自身测...

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指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

2024年7月9日 - 腾讯新闻

其中,NGS测序通量高,但其测序读长较短,导致后续在进行生物信息学分析时基因组拼接困难,且测序时存在高GC偏好性,上述缺点使其应用受限,也因此推动了TGS的发展。TGS因其超长的测序读长弥补了NGS的不足,逐渐被应用于临床各个领域。依据检测目的和方法的不同,TGS主要分为靶向测序(targetednextgenerationsequencing,tN...

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迪安诊断tNGS平台“500+”病原体靶向测序产品全新上线!

2024年6月25日 - 新浪

耐药突变检测范围升级,重点覆盖结核分枝杆菌rpoB基因关键区域,肺炎支原体、百日咳耐药突变;同时加入部分临床意义较明确的真菌和病毒的耐药突变。囊括毒力基因检测,覆盖临床重点关注病原,如高毒力肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌等。医学知识库全面支撑报告解读更好地辅助临床诊疗医学知识库覆盖病原、耐药基因及突变、毒...

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一谱识菌: MALDI-TOF MS 在病原微生物临床应用的专家共识

2024年10月15日 - 仪器信息网

三、结果分析与解读问题6:采集到质量较差的谱图时,如何分析原因?推荐意见6:推荐采用新鲜菌落进行MALDI-TOFMS鉴定,针对不同病原微生物的特征,选择恰当的前处理方法提高谱图质量。合格的谱图应包含丰富的谱峰信息,体现在峰数量较多且分散、强度错落有致、分辨率较高、信噪比较高。在日常工作中,如果质控正常...

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30岁男性突发呼吸困难、咯血,却不是单纯肺部感染?

2024年4月15日 - 医学界网

呼吸困难、咯血、贫血,30岁患者的诡异症状联合患者男性,30多岁(www.e993.com)2024年11月18日。因进行性呼吸困难、咳嗽、咯血而就诊于急诊科。患者自述呼吸困难缓慢进展,与体位无关,无明显诱因或缓解因素,咳嗽时常伴有多次咯血,无发热。既往无特殊疾病史,无长期用药史。其父曾被熊袭击身亡,母于6年前因中风去世。三个兄弟和一个姐姐均健康。吸...

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RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析

2023年12月8日 - 健康界

此外,标记物的重叠使这些独立技术的结果能够相互关联,有助于解读结果,为观察到的免疫表型提供可靠的重新确认。此外,在组织中观察到的流式细胞术免疫表型可以作为检测骨髓和脑脊液中(微小)淋巴瘤播散的参考——如果不知道确切的诊断免疫表型,这可能很困难。剩余的细胞悬液可以合并到生物库中,促进转化研究,这是重要的...

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专家共识丨动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

2024年9月26日 - 网易

高通量测序技术包括第二代测序技术(nextgenerationsequencingtechnique,NGS)和第三代测序技术(thirdgenerationsequencingtechnique,TGS)。NGS以DNA纳米球测序和边合成边测序技术为主,测序数据量大,准确性高,测序成本低,但测序读长较短,拼接复杂、长基因组时较困难;TGS以纳米孔测序和单分子荧光信号测序两种技术为...

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Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

2024年10月3日 - 腾讯新闻

在short-readcDNA测序中,有很多reads比对回两个不同转录本共享的外显子上导致无法确定其真实来源。跨越2个或多个外显子的Junctionreads可以改善转录异构体的分析,但当两种转录异构体共享剪接断点时就无能为力了。这些问题都增加了分析和解读结果的复杂度。long-readcDNA方法能直接检测全长转录异构体,从而移除或...

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