华南师范等优化CBE碱基编辑器,斑马鱼中实现建立人类疾病模型

碱基编辑技术可以将一个核苷酸化学转化为另一个核苷酸。常见的两种碱基编辑器:胞嘧啶碱基编辑器(CBE),将CG碱基对转化为TA;腺嘌呤碱基编辑器(ABE),将AT碱基对转化成GC对,已经广泛应用于植物和动物系统中。其中,胞嘧啶碱基编辑可用于在细胞和模型生物(如斑马鱼)中进行精确的单核苷酸改变,这对于研究人类疾...

继NMN被禁之后,妆食同源的麦角硫因或将成为下一个抗衰黑马

2022年美国PriscillaSamuel等人的研究发现,通过0.04、0.1、0.3或1.0mg/ml麦角硫因处理细胞8周,在氧化条件下,发现麦角硫因显著延长了中位数端粒长度和第二十百分位端粒长度,降低了短端粒(<3千碱基对)的百分比,“端粒缩短率减少”也有显著差异。总的来说,证明了麦角硫因对降低端粒缩短率有益,并在氧化应激条件下,...

2024年诺贝尔生理学或医学奖花落microRNA,表彰两位得主改变人类...

相反,它产生出一些小RNA分子,长度分别为22和61个核苷酸,Ambros将它们分别称为lin-4S(短)和lin-4L(长)。序列分析表明,lin-4S是lin-4L的一部分,由此可以预测当lin-4L形成茎环结构后,lin-4S就在其中的5’号臂中。此外,Ambros和美国哈佛大学的GaryRuvkun还共同发现,lin-4S与编码lin-14蛋白的信使RNA3’...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

而以上这些方法都依赖于cDNA转换,这一过程抹去了有关RNA碱基修饰的信息,而且也只能粗略估计多聚腺苷酸(poly(A))尾巴的长度,而directRNA-seq可以直接分析全长转录本异构体、度量碱基修饰(比如N6-甲基腺苷(M6A))和检测poly(A)尾巴长度。RNA-seq技术的进步在NCBIShortReadArchive(SRA)数据共享平台中多于95%...

国内首个拥有自主知识产权固态纳米孔基因检测仪工程样机苏州问世

第一个人类的基因组,从1990年到2003年,由2000名科学家历时13年,花费38亿美金才完成,图谱中包含了人类染色体的近30亿个碱基对的核苷酸序列,由于高度重复的DNA块组成,当时技术的局限,这份图谱仍留下了约8%的空白区,这部分的测序难度非常大。1975年至今,基因测序技术已经发展到第四代,测序时间从13年缩短到5小时,...

测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?

测序读长最高达25000个碱基,准确性达99.9%HiFi测序是一种单分子、长读长度的测序技术,能够生成长且准确的读取序列(www.e993.com)2024年11月12日。目前,PacBio的HiFi测序读长最高可达25000个碱基,而短读长测序技术通常在500个碱基以内。在实现读长超长的基础上,HiFi测序还能使准确性达到99.9%。综合读长和准确性指标,使得HiFi测序能够在基因组...

科学新知丨实现增强版全人工核酸的第一步——科学家开发出生命的...

在这项研究中,构成DNA主链的5碳糖脱氧核糖,被4碳糖取代。此外,核碱基的数量从4个增加到6个。被换出的糖,使得TNA能够躲避细胞自身的降解酶。降解一直是核酸疗法的一个问题,因为引入细胞的合成产生的RNA会迅速降解并失去其作用。将TNA引入未被检测到的细胞中,可以更长时间地维持效果。内置的非天然碱基对,为细胞...

人造合成DNA,离现实又近了一步

这一假说被称为互变异构体假说,它提出,由于互变异构体的作用,4个标准的核苷酸可以形成错配,或者这些核苷酸会在具有相同组成的几个结构变体之间表现出振荡的趋势。这种现象被认为是点突变的一个来源,或者是只影响DNA序列中的一个碱基对基因突变。互变异构化可以使得通常不应该配对的核苷酸结合在一起。在过去的研究...

呈源生物开发高通量基因合成技术,「一锅法」组装TCR基因

为合成每一组TCR基因(包括约1000个TCR),研究人员分别订购寡聚核苷酸池ssDNACDR3αpool和ssDNACDR3βpool,并利用其分别具备的Zip和Zip*互补序列,在均一溶液中将两组寡聚核苷酸池定向连接。陈曦解释道,这种“一锅法”的组装方法只需要3个反应就能组装1000个TCR,大大节约了组装成本...

各种HIV药物的“前世今生”

这个过程需要功能完整的整合酶以及病毒cDNA两端最后10-20个碱基对的完整性(Aquaro等人,2020)。整合酶抑制剂有两种类型:INSTI和INBI。前者附着在整合酶的催化核心结构域上,防止酶与DNA结合。后者与IN的异源口袋结合,阻碍链转移反应所需的构象变化(Trivedietal.,2020)。使用BioRender创建。