新方法可索引和搜索拍碱基级核苷酸资源

搜索功能可在明确定义的保证下,找到与用户查询有短序列匹配的主题(运行或集合),并根据匹配的信息量对其进行排序。研究人员通过创建八个数据库来说明Pebblescout的功能,这些数据库索引了超过3.7个拍碱基。Pebblescout的网络服务可通过httpspebblescout.ncbi.nlm.nih.gov访问。这些研究表明,对于各种查询长度,Pebblescou...

合作Codexis,可合成400nt单链寡核苷酸,这家企业如何创新酶促DNA...

目前,Molecular可为各种CRISPR编辑类型,包括HDR敲入、引物和碱基编辑等设计供体模板DNA或长指南,并且能够编码抗体、调节元件或其他蛋白质可变区的长而复杂的寡核苷酸。除此之外,Molecular还将推出基因组组装服务。启动合作伙伴计划,加速更长、更纯、更准确的DNA生产2022年下半年,Molecular启动了一项“关键客户”计划,为...

测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?

在变异检测领域,HiFi测序能够检测从单核苷酸到结构变异等所有类型的变异,包括一些基因组中十分难以检测的区域,如串联重复和高度重复序列区域。在表观遗传学研究方面,HiFi测序能够在测序中直接获取碱基修饰信息(如甲基化)及传统的碱基识别数据,为研究人员在人类和其他生物的基因表达遗传性变化方面提供了新的可能性。此外...

Nature | 开辟治疗之路:反义寡核苷酸在蒂莫西综合征治疗中的突破

结合特异性:ASOs是设计来与特定的mRNA序列互补的短链核苷酸。当ASOs与其目标mRNA结合时,它们通过碱基配对原则形成稳定的双链结构。干预mRNA的功能:结合后,这种双链结构可以通过多种机制来阻断mRNA的正常功能。最常见的机制之一是促使mRNA降解。这通常是通过诱导RNaseH酶活性实现的,该酶识别这种双链结构并切割mRNA链。

仇子龙/程田林团队成功利用全脑单碱基编辑技术,改善孤独症小鼠...

近年来,CRISPR衍生技术-碱基编辑器(BE)已成为广受欢迎的碱基高效替换工具,它主要由Cas蛋白与脱氨酶或DNA损伤修复酶构成,如CBE,ABE,CGBE/GBE以及最近开发的腺嘌呤颠换编辑器(AYBE,AXBE,ACBE)等。因无需依赖外源模板和DSB,理论上也不依赖于细胞分裂,碱基编辑技术已广泛应用于生命科学的众多领域,特别是...

生命的化学起源如何形成?国际最新实验研究破解谜团

在本项研究中，论文通讯作者、德国路德维希-马克西米利安-慕尼黑大学ChristofB.Mast和同事合作，利用受地质启发的有极小(170-m)裂缝的腔室，从由氨基酸、核碱基、核苷酸等化合物组成的复杂混合物中分离出与生命起源前生命相关的50多种分子(www.e993.com)2024年11月12日。地壳中可发现由类似裂缝构成的巨大网络，这些网络被认为在生命形成前在地球...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

在需要测序尽可能多核苷酸的实验中,首选long-readpaired-end测序。在DGE分析中,用户只需要计算比对到转录本的reads数即可,故不需要对转录本片段的每个碱基都进行测序。例如,将“短”的50bp的单端测序与“长”的100bp的双端测序的DGE分析比较表明单端测序也可以获得一致的结果。这是因为单端测序足以确定大多数...

两个圈外人的前卫实验,引发了一场不凡俗的科学革命

分离出多核苷酸磷酸化酶意味着奥乔亚能够通过将这种酶与RNA的4种碱基一同温育来创造人工合成的RNA分子。要确定这些核苷酸的排列顺序是不可能的,但创造一条只由一种碱基构成的RNA分子——被称为多聚(A)、多聚(U)等——要相对简单一些。对多数人来说,用这种反自然的分子能做什么并不是显而易见的事情——任何...

医美,传统药企转型的捷径?

所谓“婴儿针”,指的是注射用透明质酸钠-多聚脱氧核糖核苷酸(PDRN)复合溶液产品。PDRN是由50-200个碱基对组成的链状脱氧核糖核苷酸聚合物的混合物,主要从含有丰富核酸的鳟鱼和鲑鱼精巢中提取。由于PDRN碱基组成与人类DNA相似度高达98%,PDRN成分不会引起明显的免疫反应,该复合填料能够在一定时间内在体内完全降解,具有...

鲁白:我们要做出真正一流的基础研究,还有很长一段路要走|科学|...

DNA的信息,要能转变成RNA的信息,首先它的双链需要解开,解开之后,游离的核苷酸碱基与DNA的信息模板进行配对,然后在酶的作用下,形成一条单链mRNA分子,这个单链会从DNA上解离出来,跑到细胞核外。这一整个过程就叫基因转录(Transcription)。在这项伟大的研究上,很多多的科学家运用了多种极富创造性的办法,揭示了我们...