...哈佛/西奈山团队首次发现,产前发生的体细胞单核苷酸变异与精神...

初步分析结果显示,与对照组相比,精神分裂症患者体内活性TFBS中点附近(±1kb)的体细胞单核苷酸变异确实显著增加。▲确实增加了随后,Chess等人注意到,在精神分裂症患者存在两种特殊的碱基替换模式,而在对照组中则没有。一种是在启动子附近活性TFBS上,CpG位点出现了CpG>GpG替换富集的体细胞单核苷酸变异(2),与预期的...

博格隆(Bestchrom)丨寡核苷酸药物纯化策略

??磷酸基团(Phosphategroup):寡核苷酸所带静电荷取决于磷酸或修饰基团的数目、碱基的数目以及二级结构是否遮蔽带电基团。通常在变性条件(例pH12)打开氢键使结构展开并且碱基不带电(pH>pKa),以有效区分N-1杂质。??DMTon/off:DMT是一个强疏水性基团,与反相层析/疏水层析产生相互作用。因此可以用于带有DMT的...

新方法可索引和搜索拍碱基级核苷酸资源

美国国立卫生研究院RichaAgarwala团队实现拍碱基级核苷酸资源的索引和搜索。2024年5月16日,《自然—方法学》杂志在线发表了这项成果。目前,对于大多数研究人员来说,搜索资源中大量且快速增长的核苷酸内容是不切实际的,例如序列读取档案(SequenceReadArchive)中的运行和GenBank中全基因组枪式测序项目的组装。研究...

技术分享|疫苗佐剂之 CpG ODN:特性、研究进展与应用全解析

不同于ASO和siRNA等寡核苷酸药物通过碱基互补配对原理发挥作用,CpGODN通过与蛋白结合发挥作用(图5)。其中主要的作用力是疏水相互作用和氢键。图5:TLR9蛋白和CpGOND的计算机模拟3D结构图。CpGODN临床研究进展CpGODN已被广泛应用于多种疾病的研究和开发中。而且不仅仅用于人,对于动物的效果也非常明显。肿瘤免...

融资总额近6亿、率先从头合成世界第一长的DNA寡核苷酸,这家企业凭...

2023年3月,Ansa宣布,成功从头合成了1005个碱基的DNA序列。据新闻稿报道,这是目前世界上单次合成最长的DNA寡核苷酸。合成的1005个碱基长度的DNA序列包含了用于开发基因治疗的AAV病毒载体关键部件,且包含复杂的强二级结构和高GC含量。其结构和序列特征对于使用传统化学合成方法合成短核苷酸再组装的方式极具挑战性。在此次...

合作Codexis,可合成400nt单链寡核苷酸,这家企业如何创新酶促DNA...

2020年6月,DNAScript推出了世界上首台采用酶促技术的台式DNA打印机——Syntax(www.e993.com)2024年11月12日。据其介绍,该款DNA打印机可按需生产合成DNA的寡核苷酸,其合成寡核苷酸的速度很快,合成96个寡核苷酸仅需6—13个小时。2023年3月,AnsaBiotechnologies宣布成功从头合成1005个碱基的DNA序列。值得注意的是,这1005个碱基序列编码了用于基因...

测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?

在变异检测领域,HiFi测序能够检测从单核苷酸到结构变异等所有类型的变异,包括一些基因组中十分难以检测的区域,如串联重复和高度重复序列区域。在表观遗传学研究方面,HiFi测序能够在测序中直接获取碱基修饰信息(如甲基化)及传统的碱基识别数据,为研究人员在人类和其他生物的基因表达遗传性变化方面提供了新的可能性。

...Chem Biol | 李大力/王立人/曾凡一开发了高精准型的胞嘧啶碱基...

有两种主要类型的碱基编辑器:腺嘌呤碱基编辑器(ABEs)和胞嘧啶碱基编辑器(CBEs),它们分别诱导高效率的A-to-G和C-to-T转换。ABEs通常催化碱基转化,产物纯度非常高(>99.9%),而CBEs通过胞嘧啶脱胺作用产生尿嘧啶,从而刺激尿嘧啶DNA糖基化酶产生基位,激活细胞碱基切除修复途径,将胞嘧啶转化为胸腺嘧啶和其他核苷酸。

科学家开发出生命的“人造构件”

科技日报北京3月12日电(记者张梦然)核苷酸是DNA的组成部分。德国科隆大学化学系科学家最新证明,核苷酸的结构可在实验室中进行很大程度的修改。该团队开发了具有新的附加碱基对的苏糖核酸(TNA),这是实现具有增强化学功能的完全人工核酸的第一步。相关研究发表在《美国化学会杂志》上。

科学新知丨实现增强版全人工核酸的第一步——科学家开发出生命的...

核苷酸是DNA的组成部分。德国科隆大学化学系科学家最新证明,核苷酸的结构可在实验室中进行很大程度的修改。该团队开发了具有新的附加碱基对的苏糖核酸(TNA),这是实现具有增强化学功能的完全人工核酸的第一步。相关研究发表在《美国化学会杂志》上。DNA携带所有生物体的遗传信息,由4种不同的构建块(核苷酸)组成。核苷...