干货分享 | 抗体从头测序的亮氨酸I和异亮氨酸L区分
蛋白质从头测序软件PEAKS????AB利用这一原理并结合不同酶对亮氨酸和异亮氨酸的酶切倾向性和同源序列比对的方法可实现单抗中包括CDR区的I/L的准确区分(图7)。参考文献1.BagalD,KastE,CaoP.RapidDistinctionofLeucineandIsoleucineinMonoclonalAntibodiesUsingNanoflowLCMSn.AnalChem....
Nat Mach Intell | 识别肿瘤新抗原-物理启发的Sliding...
研究人员提出了“物理启发的Sliding-Transformer”算法—PISTE,用于TCR-抗原-HLA结合预测和肿瘤新抗原筛选。该算法在Transformer模型中引入了新颖的物理先验,以残基相互作用的梯度场为指引实现氨基酸残基的逐步定位,从而模拟两个(或更多个)生物序列相互滑动并形成亲和的虚拟过程,为探索TCR/抗原/HLA的复杂相互作用和人类免疫...
D-氨基酸多肽的医药学价值
D-氨基酸以前被称为“非天然”氨基酸其实并不算准确,尽管L-构型的氨基酸在自然界的蛋白质和多肽中占据绝对统治地位,但生物体仍会产生含有D-氨基酸的生物活性肽和蛋白。这些肽和蛋白通过由非核糖体肽合成酶(NRPS)介导的游离D-氨基酸的直接偶合而合成,或者通过L-多肽前体进行D-修饰——也称为翻译后L-氨基酸...
为何蛋白质都是“左撇子”
结果显示,D,L和L,D异手性二肽形成得最快,并且在这种情况下,研究人员从混合物中提取了等量的L和D氨基酸。由于基线偏差,最终在未反应的氨基酸库中保留了占优势的L氨基酸,从而增加了形成完全左旋二肽的可能性。“这就像多米诺骨牌效应。”Powner说,第一个异手性反应最终促使更多同手性反应的形成,“这是一个适用于...
氨基酸行业专题报告:助益粮食安全,借力合成生物
生物法L-缬氨酸在环保和调节日粮氨基酸平衡等方面优势显著,应用规模不断扩大。据中国发酵产业协会,近年全球缬氨酸市场规模增长迅速,全球需求量从16年0.73万吨增长至19年3.25万吨,CAGR达65%,预计20-23年期间以约24%的复合增速增长。缬氨酸目前已成为全球动物营养氨基酸领域需求规模第四大...
GNC健安喜儿童液体钙镁锌:含L-赖氨酸,孩子健康成长的秘密武器
赖氨酸,作为人体必需的氨基酸之一,对于儿童的生长发育具有至关重要的作用(www.e993.com)2024年11月19日。它不仅能够促进孩子的成长发育,还能提高孩子的免疫力,帮助他们更好地吸收和利用其他营养素。然而,人体无法自行合成赖氨酸,必须通过食物摄入来获取。而且,D-型和L-型赖氨酸的吸收效率也是不同的,D-赖氨酸几乎不能被吸收利用,具有生物活性的主要...
N-乙酰-L-亮氨酸:神经退行性病的新希望
N-乙酰-DL-亮氨酸(Tanganil)是NALL和N-乙酰-D-亮氨酸的外消旋体,其临床试验似乎主要由经验驱动:因为其作用机制尚未明确阐明。自20世纪50年代以来,N-乙酰-DL-亮氨酸就被批准用于治疗急性眩晕症;动物模型提示,该药可通过重新平衡内侧前庭神经元的过极化和去极化而发挥作用。随后,Strupp等人报告了一项短期研究结果,...
开发出L-苏氨酸高通量筛选方法
本报讯(记者朱汉斌)广东省科学院微生物研究所研究员朱红惠团队在L-苏氨酸生物合成研究方面取得新进展,成功开发出一种基于新型生物传感器的L-苏氨酸高通量筛选方法。近日,相关成果发表于《生物资源技术》。L-苏氨酸是一种重要的氨基酸,广泛应用于食品、动物营养和医药领域,是动物饲料中的第二限制性氨基酸,可以促进各种...
Nature揭秘生命之谜:为什么所有的蛋白质都是“左撇子”?
在一系列实验中,斯克里普斯的研究人员从偏斜比例的L和D氨基酸开始——例如,60%的Ls和40%的Ds。L,D和D,L异手性二肽形成得最快,同时它们从混合物中拉出了相等数量的L和D氨基酸。由于基线偏见,最终在未反应的氨基酸池中剩余的主要是Ls,从而增加了形成完全左手性二肽的可能性。
青科沙龙第120期 | Cell Research-从头设计异手性蛋白质-蛋白质...
本期青科沙龙关键词镜像蛋白D型蛋白L型蛋白多肽药物相关介绍2024年8月14日,西湖大学卢培龙研究员实验室与清华大学刘磊教授实验室合作在CellResearch杂志发表了题为Accuratedenovodesignofheterochiralprotein-proteininteractions的研究论文。该研