蛋白质的万变神功

蛋白质究竟是什么?蛋白质是一种复杂的大分子化合物,如果拼装人体的积木块是蛋白质,那么拼装蛋白质的积木块就是氨基酸,氨基酸中必定包括碳、氢、氧、氮几种元素。氨基酸连接成链条状,即“肽链”,肽链被折叠成立体结构,再经过一些加工、修饰,就成为了蛋白质。拼装蛋白质的说明书我们对着说明书拼积木模型,拼装蛋白...

时代楷模!一种新型研究的出现轰动世界,造福全人类,成功通过细节...

1.ProteinMPNN是基于信息传递神经网络(MPNN)开发的,能够通过给定的蛋质骨架结构找到正确折叠的氨基酸序列。它的功能是通过蛋白质骨架特征如Cα-Cα原子间距离、二面角等信息,生成预测的氨基酸序列。与传统的Rosetta(Rosetta的原理为基于物理的方法将序列设计视为能量优化问题,在给定的输入结构中寻找具有最低能量的氨基酸身...

他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事

蛋白质分子的直径经常也就几纳米或者几十纳米,胰岛素只有51个氨基酸;助消化的胰蛋白酶有281个氨基酸;运氧气的血红蛋白有574个氨基酸;再大一点的有免疫系统用来对抗细菌病毒的抗体蛋白(1316个氨基酸),以及线粒体里提供能量的ATP合成酶(1125个氨基酸)。蛋白质是由氨基酸构成的。想象一下,你有20种不同形状和颜色的柔...

诺奖2024|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?

除了根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——从线性的序列就能预测其折叠后的三维空间结构,人们在AI模型的帮助下,洞悉蛋白质结构的上述密码后,产生了更大想象力——创造具有新功能的蛋白质。这可能导致新的纳米材料、靶向药物、更快的疫苗开发、最小的传感器和更环保的化学工业。它也让我们更好地了解生命是如何运作的,包...

...AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构...

蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成,而氨基酸可以说是生命的基石。2003年,DavidBaker成功利用这些基石设计出一种与其他蛋白质不同的新蛋白质。此后,DavidBaker的研究小组不断创造出一个又一个富有想象力的蛋白质,并证明能被用于药物、疫苗、纳米材料和微型传感器。

凭什么AI能屡屡斩获诺奖在内的国际大奖?AlphaFold重塑了蛋白质科学

为了理解蛋白质的构建原理并探索其结构,科研人员采用了多种方法(www.e993.com)2024年11月20日。他们试图用能量方程表达物理间的相互作用,同时运用X射线晶体学和其他技术来制作可作为蛋白质结构蓝图的模板。此外,他们还结合了关于特定氨基酸的知识(比如说是否带电荷)以及它们在链上的位置,以获得关于蛋白质结构特征的线索。

2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密

第一步:贝克依赖于他们开发的Rosetta蛋白质结构预测算法,可以预测氨基酸序列在形成蛋白质时可能采取的三维结构。第二步:利用这个工具,他们针对随机生成的一系列氨基酸序列进行结构预测,这些序列都是在自然界中未被观察到的。如果预测结果显示出合理的蛋白质结构,那么这条氨基酸序列就会被保留下来,反之则抛弃该序列。

诺贝尔化学奖揭晓!国际象棋AI大师破解了蛋白质的密码

答案是蛋白质的存在,蛋白质可以说是一种出色的化学工具。它们通常由20种氨基酸组成,可以以无数种方式组合。利用DNA中存储的信息作为蓝图,氨基酸在我们的细胞中连接在一起形成长链。然后,蛋白质的神奇之处就出现了:氨基酸链扭曲并折叠成独特的(有时是独一无二的)三维结构。正是这种结构赋予蛋白质功能。

2024年诺贝尔化学奖再颁AI,到底是诺奖“水”了还是AI“杀死”了...

蛋白质的神奇之处在于其结构——氨基酸链扭曲并折叠成独特的(有时是独一无二的)三维结构。正是这种结构赋予蛋白质功能。一些蛋白质成为可以制造肌肉或羽毛的化学构件,而另一些则可能成为激素或抗体。它们中的许多形成酶,以惊人的精度驱动生命的化学反应。而位于细胞表面的蛋白质也很重要,它们充当细胞与周围环境之间的...

诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI

氨基酸首先以“串珠子”的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS);这条氨基酸链最终会折叠成特定的三维结构,形成功能性蛋白质(PROTEIN);这张图很好地诠释了2024年诺贝尔化学奖的两个核心发现:如何利用这20种氨基酸设计新的蛋白质(DavidBaker的工作);...