蛋白质设计师David Baker:我喜欢做那些“魔法”般的事
NSR:你设计的很多蛋白质都是以α螺旋为主的。为什么?Baker:我想,我们从α螺旋开始的原因是,稳定α螺旋所需要的相互作用,是发生在序列上比较接近的氨基酸之间的。与之相比,要计算出β折叠片之间是怎样结合在一起,从而形成β折叠的,则要更加复杂。但是现在,我们对于β折叠型蛋白质的理解已经进步了很多,这已经不再...
中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...
晶体结构与预测模型高度一致,证明两段无序区发生协同折叠,形成包含三段反平行β的折叠片层与一段α螺旋堆积的有序核心结构,其中β折叠片层由来自4.1G的两段无序区包夹来自NuMA的无序靶标片段共折叠形成;进一步分析表明,4.1GC端结构域与其他靶标蛋白的结合采用了类似结构机制(图1)。图1.研究流程概述该研究揭示...
中国科大解析人类胆汁盐外排蛋白ABCB11的电镜结构
该蛋白由1321个氨基酸残基组成,以单体的形式发挥功能。结构上包含两个彼此靠近的跨膜结构域(TMD)和两个分开的胞内核算结合结构域(NDB)以及一个N端的α螺旋,整体呈现对肝细胞内开放的构象。根据该结构提供的三维空间信息,作者对临床上该蛋白的突变体致病机理进行了分析。作者发现,临床样本的突变会破坏蛋白质分子内部...
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI
左侧是一个环形排列,显示了20种基本氨基酸(AminoAcids)的名称:包括甘氨酸(Glycine);谷氨酸(Glutamicacid);谷氨酰胺(Glutamine);半胱氨酸(Cysteine);天冬氨酸(Asparticacid);等等...右侧展示了从氨基酸到蛋白质的形成过程:氨基酸首先以“串珠子”的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS);这条氨...
2024重组胶原蛋白行业白皮书:从美业革新先锋到精准医疗动力源
利用定点突变技术,可以在这些关键位点引入更有利于形成稳定相互作用的氨基酸。这样可以增强分子内部的构象稳定性,提高整体的机械强度。根据余建军和赵铧于2022年发表的学术论文,美尚洁与瑞士的一家专业研究机构合作,开发出一种独特的微囊模式。他们从人体胶原蛋白基因组中截取了I型胶原蛋白的有效片段(COL1A1部分,截取I型...
Dev Cell | CDK5RAP2导致γ-TuRC部分闭合可以激活微管成核
与许多中心体蛋白的典型特征一样,CDK5RAP2富含α螺旋,且有形成卷曲螺旋的倾向(www.e993.com)2024年10月19日。CDK5RAP2的N端CM1基序有57个氨基酸,其中59-88号氨基酸的序列(也被称为γ-TuRC成核激活子,γ-TuNA)能够在体外刺激γ-TuRC的微管成核11,12。CDK5RAP2的58-92号氨基酸此前在人类γ-TuRC的结构中出现13。在这个结构中,...
...农业大学刘骞教授等:亲水胶体调控肌原纤维蛋白热诱导凝胶形成...
每个肌球蛋白分子由两个椭圆的头部和一条细长的尾部组成,头部含有丰富的疏水基团,尾部由两条多肽链组成,是一个α-螺旋盘绕的线圈,有聚集在外表面的高密度带电氨基酸,包含肌球蛋白分子的大部分净电荷。MP形成凝胶的方式大多以热诱导为主,肌球蛋白分子的结构与热诱导凝胶的形成机制密切相关。凝胶形成的本质是蛋白...
专家点评Cell | 王继纵课题组/邓兴旺课题组合作解析植物光信号...
为了阐明光激活驱动phyB的结构重排,作者细致比对了之前文献报道的phyB-Pr及本研究获得的phyB-Pfr结构,发现发色团PΦB分子在吸收红光后,其D环翻转了180??,并且和口袋中的系列氨基酸重新建立互作网络(图2A,左),最终导致PHY结构域里与其互作的舌状突出结构发生由β片层到α螺旋的构象转变(图2A,右)。结构分析表明,...
诺贝尔化学奖颁给AI,是AI for Science,物理奖是Science for AI
左侧是一个环形排列,显示了20种基本氨基酸(AminoAcids)的名称:包括甘氨酸(Glycine)谷氨酸(Glutamicacid)谷氨酰胺(Glutamine)半胱氨酸(Cysteine)天冬氨酸(Asparticacid)等等...右侧展示了从氨基酸到蛋白质的形成过程:氨基酸首先以"串珠子"的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS)...
全新微蛋白结构设计出炉 将促进蛋白质折叠研究
现在,布里斯托团队的最新研究有望解决这一难题。他们让两种蛋白质结构——α螺旋和聚脯氨酸Ⅱ螺旋结合,形成“PPα”微蛋白。接着,他们将这一微蛋白进行“拆解”发现,两种螺旋结构相互缠绕后,其内氨基酸能通过“纽扣作用”紧密结合在一起。研究团队用非天然氨基酸取代“PPα”内部分氨基酸后还发现,除了疏水性作用外...