从结构准确预测蛋白质功能,东北大学「CNN+GCN」统一框架

TAWFN:用于蛋白质功能预测为了解决这些问题,东北大学研究人员提出了一种新型蛋白质功能预测方法TAWFN。该方法集成了CNN和GCN,同时利用了蛋白质结构和蛋白质语言模型。对蛋白质结构进行处理,得到相应的蛋白质序列。研究的主要贡献总结如下:在GCN方面,使用处理后的蛋白质序列特征和蛋白质接触图构建图形输入网络。

??研究蛋白质热稳定性的几种方法

蛋白质Tm值测定具有重要的实际应用价值,例如辅助生物药物开发、生产和质量控制,评估生物相似性、优化蛋白药物配方等,还可以作为探索蛋白质高级结构的手段之一指导蛋白质工程,如比较不同突变对蛋白质稳定性的影响,研究结构域改变与功能活性改变关联性等。比较不同Tm值测定方法,全面了解技术特点及测量效果对于Tm值测定的实际...

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生

蛋白质维持我们的细胞和身体的生存与运行。由于蛋白质的形状决定了它的功能,因此成功解决这一问题将对我们理解疾病、生产新药以及洞察生命运作方式产生深远影响。在这场每两年举行一次的会议上,科学家们测试了他们最新的蛋白质折叠工具。但似乎距离实现这一目标总是遥不可及。他们中的一些人穷极一生试图在这方面预测...

AI+Science新视野:用物理信息引导AlphaFold 2预测蛋白质动力学

本研究表明,通过将支配蛋白质运动的物理规则与预测蛋白质结构的人工智能相结合,我们能够准确预测蛋白质的结构变化和运动路径。我们的方法在蛋白质序列、能量阻挫、共进化信息与蛋白质结构和动力学之间建立了有机联系,为蛋白质设计等重要问题提供了新的启发。尽管人工智能在生物物理领域的突破展示了数据驱动方法的强大能力...

Nature系列重磅论文:首次全面总结细胞衰老和组织衰老的标志物

此外,SASP蛋白CXCL8、SERPINE1、CXCL2和MMP14的分泌增加。随着衰老和肥胖,来自衰老细胞的SASP因子上调脂肪免疫细胞中的CD38,从而降低NAD+水平,从而导致代谢功能障碍增加和整体健康水平下降。肥胖时,TNSF8+PDCD1+CD44+CD4+T细胞在脂肪组织中积累,呈现衰老特征,SPP1、CDKN2A、CDKN1A表达增加,SATB1、DUSP10、EEF1A...

人体需要的7大营养素及营养配餐全总结

下面是它们的简要总结及详细介绍每种营养素的链接(点击标题可以直接进入):总介绍第一期:(图片来自微信公众平台公共图片库)1.蛋白质人体的重要组成成分,用于维修和建造身体组织,也是酶、激素和抗体的主要成分(www.e993.com)2024年11月8日。肉类、鸡蛋、豆类、坚果和种子都富含蛋白质。

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情...

从运动到大众,千亿蛋白质赛道如何创新?

步入老年后,人们的器官功能和机能水平不断下降、代谢速度减缓,难以像青年时期那样食用大量肉蛋类高蛋白食材来保证基本营养,更多是通过保健食品、功能性食品来补充。传统的蛋白粉冲泡麻烦、适口性较差,很难让老年群体形成长期服用的习惯,针对这一痛点圣元老君堂经过对配方、口感的不断调试,针对老年人的营养补充需求,推出...

【科技前沿】Protein & Cell 综述 | 甘波谊团队总结代谢性细胞...

LIAS是催化硫辛酸生物合成最后一步的酶,并充当蛋白质脂酰化的关键上游调节因子。蛋白质硫辛酰化是一种翻译后修饰,这种修饰对于调节线粒体TCA循环的关键代谢酶的功能不可或缺,其中就包括丙酮酸脱氢酶复合物的重要亚基DLAT,研究发现LIAS和DLAT的基因缺失可使癌细胞对铜死亡产生抵抗。尽管蛋白质脂酰化引发铜死亡的确切...

地球生命源于外太空?到底是先有DNA,还是先有蛋白质?

生命的起源形式:先有DNA还是先有蛋白质?我们知道,一个细胞的结构大致是由一层具有保护功能的脂质细胞膜包裹着核酸(DNA或RNA)和各种蛋白质。其中,细胞遗传物质编码的蛋白质相当于活体细胞中的螺丝、弹簧和齿轮等所有运转部件,以维持细胞生活所需的能量、养分。